cluster # 4201

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Schistosoma mansoni
cluster # 4201 cluster # 4201 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4201#0 length = 599 sequences # 3

consensusID : consensus_4201#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 599
fasta sequence

                              [CCTCATTGGATTCTATTGATCAAGTTGCAATTTGACGACTAGTCTAAGTGACTCCACTTCGTGTGGACTGTTTTTTGATGTTAGGTGGTTAGAGGAAGTCGACAGATAATTCTCAATGGTCATCTTACGCTAGTCGGTACTCGTCAACAAGACGGCCTGAATAGCTCAGTGGTTACATCTCAAATGATGTGGCTTGACGGTGGTGAAGCATTGGCGATCTTGATATCATTTTTTTGTCATTAACTGTTCATTGTAAGTTTAAGACTTTTCTTGAATGTCATGAAATCTTAGACAGCTTTATTGATATCGGCCAAATATATTACACTCTTAAATTGTTCATTTTCTAGAGTAAAATTATCGCTTAGTCCGAAATTTAAACAATACAAACACGATAATTGTTTATATTGATCATGTTTCTTAGCTCATCAAAACAAATTATTTGTTATGTTATTGTTCCTTAACGAAAGGAGAGAGCGTTTTATTATTTCCAACGTTTGTCTTTCTAAAGTCAGTCTTTGTTGGTTATTCACTGAGTAAAAACCAGCATTTCTAATCCTCATTGGATTCTATTGATCAAGTTGCAATTTGACGACTAGTCT]

[+] EMBL CD146893             [CCTCATTGGATTCTATTGATCAAGTTGCAATTTGACGACTAGTCTAAGTGACTCCACTTCGTGTGGACTGTTTTTTGATGTTAGGTGGTTAGAGGAAGTCGACAGATAATTCTCAATGGTCATCTTACGCTAGTCGGTACTCGTCAACAAGACGGCCTGAATAGCTCAGTGGTTACATCTCAAATGATGTGGCTTGACGGTGGTGAAGCATTGGCGATCTTGATATCATTTTTTTGTCATTAACTGTTCATTGTAAGTTTAAGACTTTTCTTGAATGTCATGAAATCTTAGACAGCTTTATTGATATCGGCCAAATATATTACACTCTTAAATTGTTCATTTTCTAGAGTAAAATTATCGCTTAGTCCGAAATTTAAACAATACAAACACGATAATTGTTTATATTGATCATGTTTCTTAGCTCATCAAAACAAATTATTTGTTATGTTATTGTTCCTTAACGAAAGGAGAGAGCGTTTTATTATTTCCAACGTTTGTCTTTCTAAAGTCAGTCTTTGTTGGTTATTCACTGAGTAAAAACCAGCATTTCTAATCCTCATTGGATTCTATTGATCAAGTTGCAATTTGACGACTAGTCT]
[+] EMBL CD146958             [CCTCATTGGATTCTATTGATCAAGTTGCAATTTGACGACTAGTCTAAGTGACTCCACTTCGTGTGGACTGTTTTTTGATGTTAGGTGGTTAGAGGAAGTCGACAGATAATTCTCAATGGTCATCTTACGCTAGTCGGTACTCGTCAACAAGACGGCCTGAATAGCTCAGTGGTTACATCTCAAATGATGTGGCTTGACGGTGGTGAAGCATTGGCGATCTTGATATCATTTTTTTGTCATTAACTGTTCATTGTAAGTTTAAGACTTTTCTTGAATGTCATGAAATCTTAGACAGCTTTATTGATATCGGCCAAATATATTACACTCTTAAATTGTTCATTTTCTAGAGTAAAATTATCGCTTAGTCCGAAATTTAAACAATACAAACACGATAATTGTTTATATTGATCATGTTTCTTAGCTCATCAAAACAAATTATTTGTTATGTTATTGTTCCTTAACGAAAGGAGAGAGCG                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD146969             [CCTCATTGGATTCTATTGATCAAGTTGCAATTTGACGACTAGTCTAAGTGACTCCACTTCGTGTGGACTGTTTTTTGATGTTAGGTGGTTAGAGGAAGTCGACAGATAATTCTCAATGGTCATCTTACGCTAGTCGGTACTCGTCAACAAGACGGCCTGAATAGCTCAGTGGTTACATCTCAAATGATGTGGCTTGACGGTGGTGAAGCATTGGCGATCTTGATATCATTTTTTTGTCATTAACTGTTCATTGTAAGTTTAAGACTTTTCTTGAATGTCATGAAATCTTAGACAGCTTTATTGATATCGGCCAAATATATTACACTCTTAAATTGTTCATTTTCTAGAGTAAAATTATCGCTTAGTCCGAAATTTAAACAATACAAACACGATAATTGTTTATATTGATCATGTTTCTTAGCTCATCAAAACAAATTATTTGTTATGTTATTGTTCCTTAACGAAAGGAG                                                                                                                                 ]




>consensus_4201#0
CCTCATTGGATTCTATTGATCAAGTTGCAATTTGACGACTAGTCTAAGTGACTCCACTTC
GTGTGGACTGTTTTTTGATGTTAGGTGGTTAGAGGAAGTCGACAGATAATTCTCAATGGT
CATCTTACGCTAGTCGGTACTCGTCAACAAGACGGCCTGAATAGCTCAGTGGTTACATCT
CAAATGATGTGGCTTGACGGTGGTGAAGCATTGGCGATCTTGATATCATTTTTTTGTCAT
TAACTGTTCATTGTAAGTTTAAGACTTTTCTTGAATGTCATGAAATCTTAGACAGCTTTA
TTGATATCGGCCAAATATATTACACTCTTAAATTGTTCATTTTCTAGAGTAAAATTATCG
CTTAGTCCGAAATTTAAACAATACAAACACGATAATTGTTTATATTGATCATGTTTCTTA
GCTCATCAAAACAAATTATTTGTTATGTTATTGTTCCTTAACGAAAGGAGAGAGCGTTTT
ATTATTTCCAACGTTTGTCTTTCTAAAGTCAGTCTTTGTTGGTTATTCACTGAGTAAAAA
CCAGCATTTCTAATCCTCATTGGATTCTATTGATCAAGTTGCAATTTGACGACTAGTCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case