Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4204 cluster # 4204       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4204#0 length = 336 sequences # 3  

consensusID : consensus_4204#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 336
fasta sequence
                              [CGACCCCATCCCGTAGAAAACCAGCTT-GCTAAAAAACGCTAATGAACTTTTATAATCAATAAATTTTTTTCAACTCGCTAAAAAAATGCTAACCAGAAAAAATTTATAGATTATAAAGGTTCATTAATAATGAGTTTACTTACTCCATATCAGTAATCATAATGACCTGTTAACTAATAATAGCAATGATTCATTTTGTATTAGTTGTTTAAATCTTTTGATTGTTATTTAAGACTATAATTGATCAATCTCTTATTGGTATATGTGCATCTTGTGTGAATTGCCTCGATATTGCTTTAATTCTGTTATAAACGCATGAATGCCGTCGCCAATTGT]

[+] EMBL CD066375             [CGACCCCATCCCGTAGAAAACCAGCTT GCTAAAAAACGCTAATGAACTTTTATAATCAATAAATTTTTTTCAACTCGCTAAAAAAATGCTAACCAGAAAAAATTTATAGATTATAAAGGTTCATTAATAATGAGTTTACTTACTCCATATCAGTAATCATAATGACCTGTTAACTAATAATAGCAATGATTCATTTTGTATTAGTTGTTTAAATCTTTTGATTGTTATTTAAGACTATAATTGATCAATCTCTTATTGGTATATGTGCATCTTGTGTGAATTGCCTCGATATTGCTTTAATTCTGTTATAAACGCATGAATGCCGT          ]
[+] EMBL CD066376             [CGACCCCATCCCGTAGAAAACCAGCTT GCTAAAAAACGCTAATGAACTTTTATAATCAATAAATTTTTTTCAACTCGCTAAAAAAATGCTAACCAGAAAAAATTTATAGATTATAAAGGTTCATTAATAATGAGTTTACTTACTCCATATCAGTAATCATAATGACCTGTTAACTAATAATAGCAATGATTCA                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD066642             [         CCCTAAAAAAACCA CTTGGTTAAAAAACGCTAATGAACTTTTATAATCAATAAATTTTTTTCAACTCGCTAAAAAAATGCTAACCAGAAAAAATTTATAGATTATAAAGGTTCATTAATAATGAGTTTACTTACTCCATATCAGTAATCATAATGACCTGTTAACTAATAATAGCAATGATTCATTTTGTATTAGTTGTTTAAATCTTTTGATTGTTATTTAAGACTATAATTGATCAATCTCTTATTGGTATATGTGCATCTTGTGTGAATTGCCTCGATATTGCTTTAATTCTGTTATAAACGCATGAATGCCGTCGCCAATTGT]


>consensus_4204#0 CGACCCCATCCCGTAGAAAACCAGCTTGCTAAAAAACGCTAATGAACTTTTATAATCAAT AAATTTTTTTCAACTCGCTAAAAAAATGCTAACCAGAAAAAATTTATAGATTATAAAGGT TCATTAATAATGAGTTTACTTACTCCATATCAGTAATCATAATGACCTGTTAACTAATAA TAGCAATGATTCATTTTGTATTAGTTGTTTAAATCTTTTGATTGTTATTTAAGACTATAA TTGATCAATCTCTTATTGGTATATGTGCATCTTGTGTGAATTGCCTCGATATTGCTTTAA TTCTGTTATAAACGCATGAATGCCGTCGCCAATTGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)