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Schistosoma mansoni
cluster # 4207 cluster # 4207       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4207#0 length = 640 sequences # 3  

consensusID : consensus_4207#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 640
fasta sequence
                              [CTTGTACTCGATCATAAACAGCATAGAGAAAAAAAGCTACAAATTTCGACGCTTTCTTACTCTAGTTTCATGGTTTTCCCAATTTGGCACTGATTCACAGACACCAATTGATGAAATCCTAAAATGCTACTCTTCCAAAGAAAGAGGTAAGCTCTTAAAAATGCTCACAGAATCACTGGCGGGATACTTTCCAGACTTATATCTAGGTCAGAAATTATCTGTTTCTCTTCATCAAGAAACTCCAGTATCAACTGGAAATCAGTTGAATTCTCCAATTTTTGTATATAGCCCACAGGAGGCTAATTCCACAACACAAACTGTATTATGGCAAAGACGTCTTAGTGATTTACTAAAAGGTCAGTCGACTATTATCCTAGGAAGTATGGATTTTACACAAAGATGGTCAACAAATTTATCACAATTATATTTTAAACATAAACTTGCACCATTCATTTTAACTCCTATCTATTGTCAAGGTGGCGTTGTTCTGCCTTTATTAATTGAAAATCCAAATATTGAATTGTCAGCATATGAAATTTCACTACCTTTAAGATGGATGCACTATCGTTTATTTTGTGGTATTGAACATAACCTATCACAAAAGCAAAAACTAATCG-GCTTAAATCCTTATATTTTGGAA]

[+] EMBL CD202080             [CTTGTACTCGATCATAAACAGCATAGAGAAAAAAAGCTACAAATTTCGACGCTTTCTTACTCTAGTTTCATGGTTTTCCCAATTTGGCACTGATTCACAGACACCAATTGATGAAATCCTAAAATGCTACTCTTCCAAAGAAAGAGGTAAGCTCTTAAAAATGCTCACAGAATCACTGGCGGGATACTTTCCAGACTTATATCTAGGTCAGAAATTATCTGTTTCTCTTCATCAAGAAACTCCAGTATCAACTGGAAATCAGTTGAATTCTCCAATTTTTGTATATAGCCCACAGGAGGCTAATTCCACAACACAAACTGTATTATGGCAAAGACGTCTTAGTGATTTACTAAAAGGTCAGTCGACTATTATCCTAGGAAGTATGGATTTTACACAAAGATGGTCAACAAATTTATCACAATTATATTTTAAACATAAACTTGCACCATTCATTTTAACTCCTATCTATTGTCAAGGTGGCGTTGTTCTGCCTTTATTAATTGAAAATCCAAATATTGAATTGTCAGCATATGAAATTTCACTACCTTTAAGATGGATGCACTATCGTTTATTTTGTGATATTGAACATAACCTATCACANAAGCA                                   ]
[-] EMBL CD166016             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGGATTTTACACAAAGATGGTCAACAAATTTATCACAATTATATTTTAAACATAAACTTGCACCATTCATTNTAACTCCTATCTATTGTCAAGGTGGCGTTGTTCTGCCTTTATTAATTGAAAATCCAAATATTGAATTGTCAGCAAATGAAATTTCACTACCTTTAAGATGGATGCACTATCGTTTATTTTGTGGTATTGAACATAACCTATCACAAAAACAAAAACTAATCG GCTTAAATCCTTATATTTTGGAA]
[-] EMBL CD165955             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGTCAACAAATTTATCACAATTATATTTTAAACATAAACTTGCACCATTCATTTTAACTCCTATCTATTGTCAAGGTGGCGTTGTTCTGCCTTTATTAATTGAAAATCCAAATATTGAATTGTCAGCATATGAAATTTCACTACCTNTAAGATGGATGCACTATCGTTTATTTTGTGGTATTGAACATAACCTATTTCAAAATCAAAACCTGAGCGAAAATAAATCCTTATATTTTGGAA]


>consensus_4207#0 CTTGTACTCGATCATAAACAGCATAGAGAAAAAAAGCTACAAATTTCGACGCTTTCTTAC TCTAGTTTCATGGTTTTCCCAATTTGGCACTGATTCACAGACACCAATTGATGAAATCCT AAAATGCTACTCTTCCAAAGAAAGAGGTAAGCTCTTAAAAATGCTCACAGAATCACTGGC GGGATACTTTCCAGACTTATATCTAGGTCAGAAATTATCTGTTTCTCTTCATCAAGAAAC TCCAGTATCAACTGGAAATCAGTTGAATTCTCCAATTTTTGTATATAGCCCACAGGAGGC TAATTCCACAACACAAACTGTATTATGGCAAAGACGTCTTAGTGATTTACTAAAAGGTCA GTCGACTATTATCCTAGGAAGTATGGATTTTACACAAAGATGGTCAACAAATTTATCACA ATTATATTTTAAACATAAACTTGCACCATTCATTTTAACTCCTATCTATTGTCAAGGTGG CGTTGTTCTGCCTTTATTAATTGAAAATCCAAATATTGAATTGTCAGCATATGAAATTTC ACTACCTTTAAGATGGATGCACTATCGTTTATTTTGTGGTATTGAACATAACCTATCACA AAAGCAAAAACTAATCGGCTTAAATCCTTATATTTTGGAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)