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Schistosoma mansoni
cluster # 4248 cluster # 4248       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4248#0 length = 478 sequences # 3  

consensusID : consensus_4248#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 478
fasta sequence
                              [CTGATTCTACAACGCCTAAAAGAAGAAGAAGAGTCAGAGAAATTAATTTCAGAAAAGTATAAACTTTGTCCAGGTTGTTGGACACCATGTGAGAAAATTACTGGTTGTAATAAAATGACCTGTTCATATTGTCATTTATTTTTTTGTTGGTTATGTTTATATGCTATACATGATCGTCATAATCCATATTCACATTTTTCTAATGGTACATGTCAAGGTCAATTATGGACAGATAATACAATTGAATTTAGATAATCATTTGATTTCACTTTCTTATTATGATCCTATAAGAGTACTGTATCTAAAAGAAATATATCCAGCCACTCCTTTTACCACCTTGGTCAACTTCAGAGTTAACTTATTACTAATCCATTTTATAAGATGGTGGTGACATGAATTTGGTTTGATGTTCATTCTTATATCTTACATTTATCCACATATCTTACCATTGTGATTATTATTATTATTACACTTGTTA]

[+] EMBL CD197091             [CTGATTCTACAACGCCTAAAAGAAGAAGAAGAGTCAGAGAAATTAATTTCAGAAAAGTATAAACTTTGTCCAGGTTGTTGGACACCATGTGAGAAAATTACTGGTTGTAATAAAATGACCTGTTCATATTGTCATTTATTTTTTTGTTGGTTATGTTTATATGCTATACATGATCGTCATAATCCATATTCACATTTTTCTAATGGTACATGTCAAGGTCAATTATGGACAGATAATACAATTGAATTTAGATAATCATTTGATTTCACTTTCTTATTATGATCCTATAAGAGTACTGTATCTAAAAGAAATATATCCAGCCACTCCTTTTACCACCTTGGTCAACTTCAGAGTTAACTTATTACTAATCCATTTTATAAGATGGTGGTGACATGAATTTGGTTTGATGTTCATTCTTATATCTTACATTTATCCACATATCTTACCA                              ]
[+] EMBL CD196569             [CTGATTCTACAACGCCTAAAAGAAGAAGAAGAGTCAGAGAAATTAATTTCAGAAAAGTATAAACTTTGTCCAGGTTGTTGGACACCATGTGAGAAAATTACTGGTTGTAATAAAATGACCTGTTCATATTGTCATTTATTTTTTTGTTGGTTATGTTTATATGCTATACATGATCGTCATAATCCATATTCACATTTTTCTAATGGTACATGTCAAGGTCAATTATGGACAGATAATACAATTGAATTTAGATAATCATTTGATTTCACTTTCTTATTATGATCCTATAAGAGTACTGTATCTAAAAGAAATATATCCAGCCACTCCTTTTACCACCTTGGTCAACTTCAGAGTTAACTTATTACTAATCCATTTTATAAGATGGTGGTGACATGAATTTGGTTTGATGTT                                                                   ]
[-] EMBL CD146595             [                                                                                           AGAAAATTACTGGTTGTAATAAAATGACCTGTTCATATTGTCATTTATTTTTTTGTTGGTTATGTTTATATGCTATACATGATCGTCATAATCCATATTCACATTTTTCTAATGGTACATGTCAAGGTCAATTATGGACAGATAATACAATTGAATTTAGATAATCATTTGATTTCACTTTCTTATTATGATCCTATAAGAGTACTGTATCTAAAAGAAATATATCCAGCCACTCCTTTTACCACCTTGGTCAACTTCAGAGTTAACTTATTACTAATCCATTTTATAAGATGGTGGTGACATGAATTTGGTTTGATGTTCATTCTTATATCTTACATTTATCCACATATCTTACCATTGTGATTATTATTATTATTACACTTGTTA]


>consensus_4248#0 CTGATTCTACAACGCCTAAAAGAAGAAGAAGAGTCAGAGAAATTAATTTCAGAAAAGTAT AAACTTTGTCCAGGTTGTTGGACACCATGTGAGAAAATTACTGGTTGTAATAAAATGACC TGTTCATATTGTCATTTATTTTTTTGTTGGTTATGTTTATATGCTATACATGATCGTCAT AATCCATATTCACATTTTTCTAATGGTACATGTCAAGGTCAATTATGGACAGATAATACA ATTGAATTTAGATAATCATTTGATTTCACTTTCTTATTATGATCCTATAAGAGTACTGTA TCTAAAAGAAATATATCCAGCCACTCCTTTTACCACCTTGGTCAACTTCAGAGTTAACTT ATTACTAATCCATTTTATAAGATGGTGGTGACATGAATTTGGTTTGATGTTCATTCTTAT ATCTTACATTTATCCACATATCTTACCATTGTGATTATTATTATTATTACACTTGTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)