Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4272 cluster # 4272       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4272#0 length = 612 sequences # 3  

consensusID : consensus_4272#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 612
fasta sequence
                              [AAATAGTGATTATACAGTTAACAAACAGTAAAAAGAAACTTTAACGTACAATATATTTTGTTAGACAAGTAGAGGTGTTGTTTGTTTTTTGGAATTAGTACTGAAATCTTACAAAATACGAGGGAACATTTAAAGAATAGAAGAAATTAACCATACATAAGGAAATGAAAATACATTAAGAAGTTGATTACTTGAGTGGTTAATTTCTAACTTGAAAATTTGTTATATTATACAAATTAATGACCACAGAAAATTTTCAATGCAATGTCACAACAACGAATAACAATGAAAAATGTGTAAATGTGAATGTCTCATTCTGGTGGTGTATATTACACAAAAGTGAAAATGTGCTCCATTTACTATTCAGTAATAACAATATGTACACATCAATTCATAGTAATGTAAGTAGATTAAGTTTTTCCCACTGGATAAGCTGTGATAGGTTGAGTTTGAAGTTGAAATTTGTCAAAAATTTCAGCCAATTCATGAATATGATACTCGGATAGGATAATGAATGTTTTTAAAGTAGAATCCATACGACGTGCACAATCTAAACATCTAACAACCAATTTTTTATCTTGAGATAAAACGAATAAAATATTGAATACTTCA]

[+] EMBL CD169216             [AAATAGTGATTATACAGTTAACAAACAGTAAAAAGAAACTTTAACGTACAATATATTTTGTTAGACAAGTAGAGGTGTTGCTTGTTTTTTGGAATTAGTACTGAAATCTTACAAAATACGAGGGAACATTTAAAGAATAGAAGAAATTAACCATACATAAGGAAATGAAAATACATTAAGAAGTTGATTACTTGAGTGGTTAATTTCTAACTTGAAAATTTGTTATATTATACAAATTAATGACCACAGAAAATTTTCAATGCAATGTCACAACAACGAATAACAATGAAAAATGTGTAAATGTGAATGTCTCATTCTGGTGGTGTATATTACACAAAAGTGAAAATGTGCTCCATTTACTATTCAGTAATAACAATATGTACACATCAATTCATAGTAATGTAAGTAGATTAAGTTTTTCCCACTGGATAAGCTGTGATAGGTTGAGTTTGAAGTTGAAATTTGTCAAAAATTTCAGCCAATTCATGAATATGATACTCGGATAGGATAATGAATGTTTTTAAAGTAGAATCCATACGACGTGCACAATCTAAACATCTAACAACCAATTTTTTATCTTGAGATAAAACGAATAAAATATTGAATACTTCA]
[+] EMBL CD169264             [AAATAGTGATTATACAGTTAACAAACAGTAAAAAGAAACTTTAACGTACAATATATTTTGTTAGACAAGTAGAGGTGTTGTTTGTTTTTTGGAATTAGTACTGAAATCTTACAAAATACGAGGGAACATTTAAAGAATAGAAGAAATTAACCATACATAAGGAAATGAAAATACATTAAGAAGTTGATTACTTGAGTGGTTAATTTCTAACTTGAAAATTTGTTATATTATACAAATTAATGACCACAGAAAATTTTCAATGCAATGTCACAACAACGAATAACAATGAAAAATGTGTAAATGTGAATGTCTCATTCTGGTGGTGTATATTACACAAAAGTGAAAATGTGCTCCATTTACTATTCAGTAATAACAATATGTACACATCAATTCATAGTAATGTAAGTAGATTAAGTTTTTCCCACTGGATAAGCTGTGATAGGTTGAGTTTGAAGTTGAAATTTGTCAAAAATTTCAGCCAATTCATGAATATGATACTCGGATAGGATAATGAATGTTTTTAAAGTAGAATCCATACGACGTGCACAATCTAAACATCTAACAACCAATTTTTTATCTTGAGATAAAACGAATAAAATATTGAATACTTC ]
[+] EMBL CD169700             [gAATAGTGATTATACAGTTAACAAACAGTAAAAAGAAACTTTAACGTACAATATATTTTGTTAGACAAGTAGAGGTGTTGTTTGTTTTTTGGAATTAGTACTGAAATCTTACAAAATACGAGGGAACATTTAAAGAATAGAAGAAATTAACCATACATAAGGAAATGAAAATACATTAAGAAGTTGATTACTTGAGTGGTTAATTTCTAACTTGAAAATTTGTTATATTATACAAATTAATGACCACAGAAAATTTTCAATGCAATGTCACAACAACGAATAACAATGAAAAATGCGTAAATGTGAATGTCTCATTCTGGTGGTGTATATTACACAAAAGTGAAAATGTGCTCCATTTACTATTCAGTAATAACAATATGTACACATCAATTCATAGTAATGTAAGTAGATTAAGTTTTTCCCACTGGATAAGCTGTGATAGGTTGAGTTTGAAGTTGAAATTTGTCAAAAACTTCAGCCAATTCATGAATATGATACTCCGATAGGATAATGAATGTT                                                                                             ]


>consensus_4272#0 AAATAGTGATTATACAGTTAACAAACAGTAAAAAGAAACTTTAACGTACAATATATTTTG TTAGACAAGTAGAGGTGTTGTTTGTTTTTTGGAATTAGTACTGAAATCTTACAAAATACG AGGGAACATTTAAAGAATAGAAGAAATTAACCATACATAAGGAAATGAAAATACATTAAG AAGTTGATTACTTGAGTGGTTAATTTCTAACTTGAAAATTTGTTATATTATACAAATTAA TGACCACAGAAAATTTTCAATGCAATGTCACAACAACGAATAACAATGAAAAATGTGTAA ATGTGAATGTCTCATTCTGGTGGTGTATATTACACAAAAGTGAAAATGTGCTCCATTTAC TATTCAGTAATAACAATATGTACACATCAATTCATAGTAATGTAAGTAGATTAAGTTTTT CCCACTGGATAAGCTGTGATAGGTTGAGTTTGAAGTTGAAATTTGTCAAAAATTTCAGCC AATTCATGAATATGATACTCGGATAGGATAATGAATGTTTTTAAAGTAGAATCCATACGA CGTGCACAATCTAAACATCTAACAACCAATTTTTTATCTTGAGATAAAACGAATAAAATA TTGAATACTTCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)