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Schistosoma mansoni
cluster # 4300 cluster # 4300       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4300#0 length = 896 sequences # 3  

consensusID : consensus_4300#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 896
fasta sequence
                              [CACAATATACAGCAAATTATGCAGTTAAGCTAAATGGTTAAGGATTAATGGAGCCAGTGATACAATTTAAGCATGACTGGTGTCAAACAGTTTTCACACACAAAAGAATGGTCATTATTTACCTGCCAATAATTACGTGTTAATTGTTAAACAATATGTACAGGAAAAAATAATTGTATAAAGTATCGTACATTTGCTAACTAAAGTGGTATATCATTAGGTAAAGAAGAGAACACTAATACATACAAAATAGTATATGATTTGGTAAAGGTGTGTAACTACCAAAGCTACGGCATCTTACAGTAGCAAAGAAGGGGTATAAAGAAAAGACAGAAGCTAAATAAGAGTAAACAATGAATATATAGTGTTTTCAATAGTATGTTGTAAAAAGCCAGAAAATGTAACAAATCGGTTATTTTAGATGTGTAATAAGTATCTACGGTGAGCATATATATAATCATTAGCATGTTAGCCGATTCATCAGGCTGGAATGTATATATAATGAATCCTAAGTTTTCAAACTTACAGTACGAATCTGATATGATGTGTGTTAAAGAAATAAAAAAAACTAAGCAGAATTATCTTGTAGGTTGAATAGGGTAGATATAAAATTAAAAAGGAAATACACGAAAGACAACCTAATAACCATTTAAAAGATTATTAGACTATATTTTAATTGCCTTTGGATTGCATGCAAATAGTTCTTTCATAAATACAGGATAATGTTTATACGCATAAAATTGCCGCTGATCTGGCAATAACTATATTAGTACGTAGTGTGTACACTCACATACATACGTAAACTGCTTACGTATCGTAATCGACTGAATTCACTGAAAGTTGGAGCCACAATATAACTAATAAAACAATTACTTAGTGGTAGAAAAATGGATAGG]

[+] EMBL CD066754             [CACAATATACAGCAAATTATGCAGTTAAGCTAAATGGTTAAGGATTAATGGAGCCAGTGATACAATTTAAGCATGACTGGTGTCAAACAGTTTTCACACACAAAAGAATGGTCATTATTTACCTGCCAATAATTACGTGTTAATTGTTAAACAATATGTACAGGAAAAAATAATTGTATAAAGTATCGTACATTTGCTAACTAAAGTGGTATATCATTAGGTAAAGAAGAGAACACTAATACATACAAAATAGTATATGATTTGGTAAAGGTGTGTAACTACCAAAGCTACGGCATCTTACAGTAGCAAAGAAGGGGTATAAAGAAAAGACAGAAGCTAAATAAGAGTAAACAATGAATATATAGTGTTTTCAATAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD096464             [                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAAGCTACGGCATCTTACAGTAGCAAAGAAGGGGTATAAAGAAAAGACAGAAGCTAAATAAGAGTGAACAATGAATATATAGTGTTTTCAATAGTATGTTGTAAAAAGCCAGAAAATGTAACAAATCGGTTATTTTAGATGTGTAATAAGTATCTACGGTGAGCATATATATAATCATTAGCATGTTAGCCGATTCATCAGGCTGGAATGTATATATAATGAATCCTAAGTTTTCAAACTTACAGTACGAATCTGATATGATGTGTGTTAAAGAAATAAAAAAAACTAAGCAGAATTATCTTGTAGGTTGAATAGGGTAGATATAAAATTAAAAAGGAAATACACGAAAGACAACCTAATAACCATTTAAAAGATTATTAGACTATATTTTAATTGCCTTTGGATTGCATGCAAATAGTTCTTTCATAAATACAGGATAATGTTTATACGCATAAAATTGCCGCTGATCTGGCAATAACTATATTAGTACGTAGTGTGTACACTCACATACATACGTAAACTGCTTACGTATCGTAATCGACTGAATTCACTGAAAGTTGGAGCCACAATATAACTAATAAAACAATTACTTAGTGGTAGAAAAATGGATAGG]
[+] EMBL CD096472             [                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAAGCTACGGCATCTTACAGTAGCAAAGAAGGGGTATAAAGAAAAGACAGAAGCTAAATAAGAGTAAACAATGAATATATAGTGTTTTCAATAGTATGTTGTAAAAAGCCAGAAAATGTAACAAATCGGTTATTTTAGATGTGTAATAAGTATCTACGGTGAGCATATATATAATCATTAGCATGTTAGCCGATTCATCAGGCTGGAATGTATATATAATGAATCCTAAGTTTTCAAACTTACAGTACGAATCTGATATGATGTGTGTTAAAGAAATAAAAAAAACTAAGCAGAATTATCTTGTAGGTTGAATAGGATAGATATAAAATTAAAAAGGAAATACACGAAAGACAACCTAATAACCATTTAAAAGATTATTAGACTATATTTTAATTGCCTTTGGATTGCATGCAAATAGTTCTTTCATAAATACAGGATAATGTTTATACGCATAAAATTGCCGCTGATCTGACAATAACTATATTAGTACGTAGTGTGTACACTCACATACATACGTAAACTGCTTACGTATCGTAATCGACTGAATTCACTGAAAGTTGGAGCCACATTAT                                         ]


>consensus_4300#0 CACAATATACAGCAAATTATGCAGTTAAGCTAAATGGTTAAGGATTAATGGAGCCAGTGA TACAATTTAAGCATGACTGGTGTCAAACAGTTTTCACACACAAAAGAATGGTCATTATTT ACCTGCCAATAATTACGTGTTAATTGTTAAACAATATGTACAGGAAAAAATAATTGTATA AAGTATCGTACATTTGCTAACTAAAGTGGTATATCATTAGGTAAAGAAGAGAACACTAAT ACATACAAAATAGTATATGATTTGGTAAAGGTGTGTAACTACCAAAGCTACGGCATCTTA CAGTAGCAAAGAAGGGGTATAAAGAAAAGACAGAAGCTAAATAAGAGTAAACAATGAATA TATAGTGTTTTCAATAGTATGTTGTAAAAAGCCAGAAAATGTAACAAATCGGTTATTTTA GATGTGTAATAAGTATCTACGGTGAGCATATATATAATCATTAGCATGTTAGCCGATTCA TCAGGCTGGAATGTATATATAATGAATCCTAAGTTTTCAAACTTACAGTACGAATCTGAT ATGATGTGTGTTAAAGAAATAAAAAAAACTAAGCAGAATTATCTTGTAGGTTGAATAGGG TAGATATAAAATTAAAAAGGAAATACACGAAAGACAACCTAATAACCATTTAAAAGATTA TTAGACTATATTTTAATTGCCTTTGGATTGCATGCAAATAGTTCTTTCATAAATACAGGA TAATGTTTATACGCATAAAATTGCCGCTGATCTGGCAATAACTATATTAGTACGTAGTGT GTACACTCACATACATACGTAAACTGCTTACGTATCGTAATCGACTGAATTCACTGAAAG TTGGAGCCACAATATAACTAATAAAACAATTACTTAGTGGTAGAAAAATGGATAGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)