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Schistosoma mansoni
cluster # 4371 cluster # 4371       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4371#0 length = 629 sequences # 3  

consensusID : consensus_4371#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 629
fasta sequence
                              [TCTTGAACCAATCTTAGCTAGACCATCATTGAAAACATAGAACCACAGGAAGGTCTTGAGTTCGGTTCTCGCATGTGGAATTGTGTATGCCCGTTGGCGAGAATTCCGACATCAGAACGAAACAGCAGTAGAGCAAACACTTGAGAAATCCCTAAAAAGTCTTAATTAATACTTATTGATTCCTATTACTCCCTTAGTTATTAACATTCTTTGCCTAAATAATGATGATAACGATCATAAGCAACTCTATGATTATTACCTTTCCTGTGTGTCTGTGTGCGTACGTGCTACTTCAGTTTATCCTCTCCCCTCCCACCTCGTCATTACATCCTTCAATTCAACAATTCTCGGATGAAAATTTTTCTTTAAAAAAAGCACTTTTGATTATACATTCAGTGTGAAATCTACTAAGAATATGTACCTATTCCTTACCACTTTAAAAAATTTGTCTCAGGGTTGTTCCCTGTCTATATACATATATAACATGTTTCCGCGCATATTTTGTGTTTTCCTTGTACAAATCACGAATATTTAGTTTTTTTGGAAAATACTAATTATTGATTGATAATTTTCCGTCACTACTACTAATATTACTTCACCTATAAATACTAGGGAAATTAGTGTTAACT]

[-] EMBL CD127221             [TCTTGAACCAATCTTAGCTAGACCATCATTGAAAACATAGAACCACAGGAAGGTCTTGAGTTCGGTTCTCGCATGTGGAATTGTGTATGCCCGTTGGCGAGAATTCCGACATCAGAACGAAACAGCAGTAGAGCAAACACTTGAGAAATCCCTAAAAAGTCTTAATTAATACTTATTGATTCCTATTACTCCCTTAGTTATTAACATTCTTTGCCTAAATAATGATGATAACGATCATAAGCAACTCTATGATTATTACCTTTCCTGTGTGTCTGTGTGCGTACGTGCTACTTCAGTTTATCCTCTCCCCTCCCACCTCGTCATTACATCCTTCAATTCAACAATTCTCGGATGAAAATTTTTCTTTAAAAAAAGCACTTTTGATTATACATTCAGTGTGAAATCTACTA                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD067087             [                                                                                                                              AGTAGAGCAAACACTTGAGAAATCCCTAAAAAGTCTTAATTAATACTTATTGATTCCTATTACTCCCTTAGTTATTAACATTCTTTGCCTAAATAATGATGATAACGATCATAAGCAACTCTATGATTATTACCTTTCCTGTGTGTCTGTGTGCGTACGTGCTACTTCAGTTTATCCTCTCCCCTCCCACCTCGTCATTACATCCTTCAATTCAACAATTCTCGGATGAAAATTTTTCTTTAAAAAAAGCACTTTTGATTATACATTCAGTGTGAAATCTACTAAGAATATGTACCTATTCCTTACCACTTTAAAAAATTTGTCTCAGGGTTGTTCCCTGTCTATATACATATATAACATGTTTCCGCGCATATTTTGTGTTTTCCTTGTACAAATCACGAATATTTAGTTTTTTTGGAAAATACTAATTATTGATTGATAATTTTCCGTCACTACTACTAATATTACTTCACCTATAAATACTAGGGAAATTAGTGTTAACT]
[+] EMBL CD067043             [                                                                                                                              AGTAGAGCAAACACTTGAGAAATCCCTAAAAAGTCTTAATTAATACTTATTGATTCCTATTACTCCCTTAGTTATTAACATTCTTTGCCTAAATAATGATGATAACGATCATAAGCAACTCTATGATTATTACCTTTCCTGTGTGTCTGTGTGCGTACGTGCTACTTCAGTCTATCCTCTCCCCTCCCACCTCGTCATTACATCCTTCAATTCAACAATTCTCGGACGAAAATTTTTCTTTAAAAAAAGCACTTTTGATTATACATTCAGTGTGAAATCTACTAAGAATATGTACCTATTCCTTACCACTTTAAAAAATTTGTCTCAGGGTTGTTCCCTGTCTATATACATATATAACATGTTTCCGCGCATATTTTGTGTTTTCCTTGTACAAATCACGAATATTTAGTTTTTTTGGAAAATACTAATTATTGATTGAT                                                               ]


>consensus_4371#0 TCTTGAACCAATCTTAGCTAGACCATCATTGAAAACATAGAACCACAGGAAGGTCTTGAG TTCGGTTCTCGCATGTGGAATTGTGTATGCCCGTTGGCGAGAATTCCGACATCAGAACGA AACAGCAGTAGAGCAAACACTTGAGAAATCCCTAAAAAGTCTTAATTAATACTTATTGAT TCCTATTACTCCCTTAGTTATTAACATTCTTTGCCTAAATAATGATGATAACGATCATAA GCAACTCTATGATTATTACCTTTCCTGTGTGTCTGTGTGCGTACGTGCTACTTCAGTTTA TCCTCTCCCCTCCCACCTCGTCATTACATCCTTCAATTCAACAATTCTCGGATGAAAATT TTTCTTTAAAAAAAGCACTTTTGATTATACATTCAGTGTGAAATCTACTAAGAATATGTA CCTATTCCTTACCACTTTAAAAAATTTGTCTCAGGGTTGTTCCCTGTCTATATACATATA TAACATGTTTCCGCGCATATTTTGTGTTTTCCTTGTACAAATCACGAATATTTAGTTTTT TTGGAAAATACTAATTATTGATTGATAATTTTCCGTCACTACTACTAATATTACTTCACC TATAAATACTAGGGAAATTAGTGTTAACT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)