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Schistosoma mansoni
cluster # 4399 cluster # 4399       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4399#0 length = 863 sequences # 3  

consensusID : consensus_4399#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 863
fasta sequence
                              [GACAATCAGAATACTCATAACTCATTAAATCCTTATGTGTCCACGTTAATATTATTTTGATGATTCCAAGGATTTCCAGGCAAATAACTGGTAAATGCATAACTAAAAATTTTTTTGAACTCATTTTTGTTTTTTACAAGCACCAAACAAGTGTTAACACTCGTAATCCTAATTCGTTTTTAATTTTTAGGCTTATACACATTTACTTTGTCTTGTAAATGAATTTCCTCTGGATTATTCTAATCTAAAAATTCATGAATTGGAGATATTAGAAAAACTTTTTATTGACTCAACTTTGCTAGGAATACACCGTTCACTTGGTTACACACCCGTTTCAGATAGTGATTACAATGAAACTGGTTCGTATCTTTCAGACGATCCGGACGTATCCGTTGTTATAGCCACGGGGACTCTGGAATGTGTAAGATATTTTATTGATCGATTGCTAACACCCATGGGGGATGAGAACAGAAGAGAGGTTCTTTTAGCTAAAAAGTTCTATTCAAAGGTCCTTATGCGTCTTTTTTCTGACTGTCTTATTACACATGCACGAGTCCATACCTCTCCGCAATTGGTTTGCAGCCGTCCACCACTCTNCAGGCAATCCTATTTAAATATTGTTTTCAATCAAACTGCAAAGTTTTGCAATAATATTGCTCAATCTAATCATCTTCTAAAAATACAAATGTATGATGAATTAAAAAATACTTTATTCAGATGGATTTCCTTAGGACAATCAAACGAATTCTCAACACCAACAATTGATGTTGGCAAAGTGGATCGTATGTTTATTGGAATTGTTGATCCGTTACGATTAATCAGCTTTATAAACCATTTAGCTAAATCCAGCAACCAGAAATTTA]

[+] EMBL CD093281             [GACAATCAGAATACTCATAACTCATTAAATCCTTATGTGTCCACGTTAATATTATTTTGATGATTCCAAGGATTTCCAGGCAAATAACTGGTAAATGCATAACTAAAAATTTTTTTGAACTCATTTTTGTTTTTTACAAGCACCAAACAAGTGTTAACACTCGTAATCCTAATTCGTTTTTAATTTTTAGGCTTATACACATTTACTTTGTCTTGTAAATGAATTTCCTCTGGATTATTCTAATCTAAAAATTCATGAATTGGAGATATTAGAAAAACTTTTTATTGACTCAACTTTGCTAGGAATACACCGTTCACTTGGTTACACACCCGTTTCAGATAGTGATTACAATGAAACTGGTTCGTATCTTTCAGACGATCCGGACGTATCCGTTGTTATAGCCACGGGGACTCTGGAATGTGTAAGATATTTTATTGATCGATTGCTAACACCCATGGGGGATGAGAACAGAAGAGAGGTTCTTTTAGCTAAAAAGTTCTATTCAAAGGTCCTTATGCGTCTTTTTTCTGACTGTCTTATTACACATGCACGAGTCCATACCTCTCCGCAATTGGTTTGCAGCCGTCCACCACTCTNCAGGCAAT                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD093212             [GACAATCAGAATACTCATAACTCATTAAATCCTTATGTGTCCACGTTAATATTATTTTGATGATTCCAAGGATTTCCAGGCAAATAACTGGTAAATGCATAACTAAAAATTTTTTTGAACTCATTTTTGTTTTTTACAAGCACCAAACAAGTGTTAACACTCGTAATCCTAATTCGTTTTTAATTTTTAGGCTTATACACATTTACTTTGTCTTGTAAATGAATTTCCTCTGGATTATTCTAATCTAAAAATTCATGAATTGGAGATATTAGAAAAACTTTTTATTGACTCAACTTTGCTAGGAATACACCGTTCACTTGGTTACACACCCGTTTCAGATAGTGATTACAATGAAACTGGTTCGTATCTTTCAGACGATCCGGACGTATCCGTTGTTATAGCCACGGGGACTCTGGAATGTGTAAGATATTTTATTGATCGATTGCTAACACCCATGGGGGATGAGAACAGAAGAGAGGTTCTTTTAGCTAAAAAGTTCTATTCAAAGGTCCTTATGCGTCTTTTTTCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD116970             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGATGAGGACAGAAGAGAGGTTCTTTTAGCTAAAAAGTTCTATTCAAAGGTCCTTATGCGTCTTTTTTCTGACTGTCTTATTACACATGCACGAGTCCATACCTCTCCGCAATTGGTTTGCAGCCGTCCACCACTCTCCAGGCAATCCTATTTAAATATTGTTTTCAATCAAACTGCAAAGTTTTGCAATAATATTGCTCAATCTAATCATCTTCTAAAAATACAAATGTATGATGAATTAAAAAATACTTTATTCAGATGGATTTCCTTAGGACAATCAAACGAATTCTCAACACCAACAATTGATGTTGGCAAAGTGGATCGTATGTTTATTGGAATTGTTGATCCGTTACGATTAATCAGCTTTATAAACCATTTAGCTAAATCCAGCAACCAGAAATTTA]


>consensus_4399#0 GACAATCAGAATACTCATAACTCATTAAATCCTTATGTGTCCACGTTAATATTATTTTGA TGATTCCAAGGATTTCCAGGCAAATAACTGGTAAATGCATAACTAAAAATTTTTTTGAAC TCATTTTTGTTTTTTACAAGCACCAAACAAGTGTTAACACTCGTAATCCTAATTCGTTTT TAATTTTTAGGCTTATACACATTTACTTTGTCTTGTAAATGAATTTCCTCTGGATTATTC TAATCTAAAAATTCATGAATTGGAGATATTAGAAAAACTTTTTATTGACTCAACTTTGCT AGGAATACACCGTTCACTTGGTTACACACCCGTTTCAGATAGTGATTACAATGAAACTGG TTCGTATCTTTCAGACGATCCGGACGTATCCGTTGTTATAGCCACGGGGACTCTGGAATG TGTAAGATATTTTATTGATCGATTGCTAACACCCATGGGGGATGAGAACAGAAGAGAGGT TCTTTTAGCTAAAAAGTTCTATTCAAAGGTCCTTATGCGTCTTTTTTCTGACTGTCTTAT TACACATGCACGAGTCCATACCTCTCCGCAATTGGTTTGCAGCCGTCCACCACTCTNCAG GCAATCCTATTTAAATATTGTTTTCAATCAAACTGCAAAGTTTTGCAATAATATTGCTCA ATCTAATCATCTTCTAAAAATACAAATGTATGATGAATTAAAAAATACTTTATTCAGATG GATTTCCTTAGGACAATCAAACGAATTCTCAACACCAACAATTGATGTTGGCAAAGTGGA TCGTATGTTTATTGGAATTGTTGATCCGTTACGATTAATCAGCTTTATAAACCATTTAGC TAAATCCAGCAACCAGAAATTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)