cluster # 4400

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Schistosoma mansoni
cluster # 4400 cluster # 4400 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4400#0 length = 1056 sequences # 3
consensusID : consensus_4400#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1056
fasta sequence
                              [CGAAGCAGGTGGTTTTTGTTATACTTGTGGCCGAGTGGATGACTAGTTGATGTGTGGCTCGATAGAACCGCCAAACAGGGAGCAGCGAATTGTCGATTGGAACAATGACACGAAACTTGTACGAGCAGACTAGAGTGCTAACCGGTCCTGCGATCTGCCTAGCCCAGCCAGTTAAGCCCAAAACACCAATAACAGCCTCAGTGGTATGAGTCATTGTATTTAAAACATACTGGGTTTTTATACAAACCAAAGTAATCAATAAACTGATTATAACTCAAGAATTGTATGATACTAAGTCAAGGTCAAAATAAAGCTAATGATAAGAGAAATACGAATATGAATAGCTCAGTTACGTAATAATCGTATAATAGGAAATAGGCATATTACATTGATCCATAAATAGACCTAAAAGTTACCATTCGTAATTCACCGGGGGATATAACAGTTTTGATGTGAACTTAAATTCTGGTATAGCTCCGGGTAAAGAATATGAGAAGCTACAGAATCATTAATTAATATGAAATGTAACCCTGTTAATCACCTTTTATTCAGTGAATCAGATTTTTTGAGTGGGTTCTAGCAATAATACATAGGTCCCTTAACATAAACAGTTAGAATTAATTTCAACCTCCACTCCAGTAATTGAAAACAGTTTTTAGTTGTACTTTCATTTTGTACTGACAACATGTATGACTTACCAGTCCCTGCATTACTTTTATGCCATAGTAACACTCTTTAGTTATAATTCTGTTCATATGTCAACATCTAGTAGTACTGATCGCACCAACTATCGTNTTAATTGAGTTGTAGCATTTAACATAGTTCTATTGCTACTGNTTCGTTGGAAAATACACCATGGTNTATTACGCATGTCCAGCTNTTAATGCTTGCTGACGATTCATTGTGTAGATTCTGGATACATNTAATACCATAATNATCGTTTTTGATGATATACTATATTTCCTTACTTTTATAGCGAACNTACTGTACTATAAGATCTGTAGATGACATTTTCAAGATGCTCTATCTTGAGTTGTCAAGGAGTTTCGATATNAA]

[-] EMBL CD179281             [CGAAGCAGGTGGTTTTTGTTATACTTGTGGCCGAGTGGATGACTAGTTGATGTGTGGCTCGATAGAACCGCCAAACAGGGAGCAGCGAATTGTCGATTGGAACAATGACACGAAACTTGTACGAGCAGACTAGAGTGCTAACCGGTCCTGCGATCTGCCTAGCCCAGCCAGTTAAGCCCAAAACACCAATAACAGCCTCAGTGGTATGAGTCATTGTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD179305             [CGAAGCAGGTGGTTTTTGTTATACTTGTGGCCGAGTGGATGACTAGTTGATGTGTGGCTCGATAGAACCGCCAAACAGGGAGCAGCGAATTGTCGATTGGAACAATGACACGAAACTTGTACGAGCAGACTAGAGTGCTAACCGGTCCTGCGATCTGCCTAGCCCAGCCAGTTAAGCCCAAAACACCAATAACAGCCTCAGTGGTATGAGTCATTGTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD080672             [                                                                                                                                              CGGTCCTGCGATCTGCCTAGCCCAACCAGTTAAGTCCAAAACACCAATAACAGCCTCAGTGGTATGAATCGTCGTATTTAAAACATACTGGGTTTTTATACAAACCAAAGTAATCAATAAACTGATTATAACTCAAGAATTGTATGATACTAAGTCAAGGTCAAAATAAAGCTAATGATAAGAGAAATACGAATATGAATAGCTCAGTTACGTAATAATCGTATAATAGGAAATAGGCATATTACATTGATCCATAAATAGACCTAAAAGTTACCATTCGTAATTCACCGGGGGATATAACAGTTTTGATGTGAACTTAAATTCTGGTATAGCTCCGGGTAAAGAATATGAGAAGCTACAGAATCATTAATTAATATGAAATGTAACCCTGTTAATCACCTTTTATTCAGTGAATCAGATTTTTTGAGTGGGTTCTAGCAATAATACATAGGTCCCTTAACATAAACAGTTAGAATTAATTTCAACCTCCACTCCAGTAATTGAAAACAGTTTTTAGTTGTACTTTCATTTTGTACTGACAACATGTATGACTTACCAGTCCCTGCATTACTTTTATGCCATAGTAACACTCTTTAGTTATAATTCTGTTCATATGTCAACATCTAGTAGTACTGATCGCACCAACTATCGTNTTAATTGAGTTGTAGCATTTAACATAGTTCTATTGCTACTGNTTCGTTGGAAAATACACCATGGTNTATTACGCATGTCCAGCTNTTAATGCTTGCTGACGATTCATTGTGTAGATTCTGGATACATNTAATACCATAATNATCGTTTTTGATGATATACTATATTTCCTTACTTTTATAGCGAACNTACTGTACTATAAGATCTGTAGATGACATTTTCAAGATGCTCTATCTTGAGTTGTCAAGGAGTTTCGATATNAA]




>consensus_4400#0
CGAAGCAGGTGGTTTTTGTTATACTTGTGGCCGAGTGGATGACTAGTTGATGTGTGGCTC
GATAGAACCGCCAAACAGGGAGCAGCGAATTGTCGATTGGAACAATGACACGAAACTTGT
ACGAGCAGACTAGAGTGCTAACCGGTCCTGCGATCTGCCTAGCCCAGCCAGTTAAGCCCA
AAACACCAATAACAGCCTCAGTGGTATGAGTCATTGTATTTAAAACATACTGGGTTTTTA
TACAAACCAAAGTAATCAATAAACTGATTATAACTCAAGAATTGTATGATACTAAGTCAA
GGTCAAAATAAAGCTAATGATAAGAGAAATACGAATATGAATAGCTCAGTTACGTAATAA
TCGTATAATAGGAAATAGGCATATTACATTGATCCATAAATAGACCTAAAAGTTACCATT
CGTAATTCACCGGGGGATATAACAGTTTTGATGTGAACTTAAATTCTGGTATAGCTCCGG
GTAAAGAATATGAGAAGCTACAGAATCATTAATTAATATGAAATGTAACCCTGTTAATCA
CCTTTTATTCAGTGAATCAGATTTTTTGAGTGGGTTCTAGCAATAATACATAGGTCCCTT
AACATAAACAGTTAGAATTAATTTCAACCTCCACTCCAGTAATTGAAAACAGTTTTTAGT
TGTACTTTCATTTTGTACTGACAACATGTATGACTTACCAGTCCCTGCATTACTTTTATG
CCATAGTAACACTCTTTAGTTATAATTCTGTTCATATGTCAACATCTAGTAGTACTGATC
GCACCAACTATCGTNTTAATTGAGTTGTAGCATTTAACATAGTTCTATTGCTACTGNTTC
GTTGGAAAATACACCATGGTNTATTACGCATGTCCAGCTNTTAATGCTTGCTGACGATTC
ATTGTGTAGATTCTGGATACATNTAATACCATAATNATCGTTTTTGATGATATACTATAT
TTCCTTACTTTTATAGCGAACNTACTGTACTATAAGATCTGTAGATGACATTTTCAAGAT
GCTCTATCTTGAGTTGTCAAGGAGTTTCGATATNAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case