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Schistosoma mansoni
cluster # 4427 cluster # 4427       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4427#0 length = 984 sequences # 3  

consensusID : consensus_4427#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 984
fasta sequence
                              [CTATCTATTCGATGAGTTGAATTCACATCATCCAGATGCATTGAATGAATTATCACAATTTAAACATCCACCAAATTCATAATTAACAAATTTATTACTGAAATGAATTTTATACTACTTATTAACTGTCAATGCTACTAACTAAATAATGATCTCAATGGGGATGCTTTTAAATCTCAATTAATCTCAATTCAATAGCACTGATCTGATCATTTATTGTATATACGTATATTAAAATCATAGTCTTTTTAATTTCCCTTTACCTTTTGATACATAAGTCAACGGTTTTCCTTTTTTTTTCCTCTCACCTAATAATGATAGGAATCTACCTCCTTTCTCTATACTTTATTTTTAAATACATTATTGTACTCTTTGGAAATACTCAATTACACCTTTATTCATATGTGTATATCATACATATATAGGCTTGATCTCAGTACTTCATGCCCTATAAACACATATCCTATAAACAGCTCAACACATTCCTGTATCTCAGGC--TATATATATATATATACATACTACGTACTAGTACTAGTCTTACTTACTTACTTACTTGCTCACTTACGCCTGTTACCCCTCGTCGAGGAGCATAGGCCGCTCACCAGCATTCTCCATCCAACTCTGTCCTGGGCAACTAGTACTAATCATGCTGACATTATTTAAATGCTACTGATATTAGCTTGTTTTCATTTTGGTTAGAGTAAATATCTTCATTATTAATCTTATTATTTTGTACGCTTCTCGCTCACAACTTGTTGTGTTGTTTATGAACTTCCTTCTAAATTGATTTTTGTAAATAAGTTTAGTGATTTCCTTACCTTTATAATGTATGTGTGGTGTTTGATTGTTTATTATTATTGGCAGCAGTGTTTCCCATTTTTGTGTGCGAGTTCTGCGTTTATTTATTCCTTTTTTACATTACTTGTTAGAATAAACAATTGTTTACGCATTTTCTTTGATTTAGATTTTTGTATTGCTATTCAG]

[+] EMBL CD081446             [CTATCTATTCGATGAGTTGAATTCACATCATCCAGATGCATTGAATGAATTATCACAATTTAAACATCCACCAAATTCATAATTAACAAATTTATTACTGAAATGAATTTTATACTACTTATTAACTGTCAATGCTACTAACTAAATAATGATCTCAATGGGGATGCTTTTAAATCTCAATTAATCTCAATTCAATAGCACTGATCTGATCATTTATTGTATATACGTATATTAAAATCATAGTCTTTTTAATTTCCCTTTACCTTTTGATACATAAGTCAACGGTTTTCCTTTTTTTTTCCTCTCACCTAATAATGATAGGAATCTACCTCCTTTCTCTATACTTTATTTTTAAATACATTATTGTACTCTTTGGAAATACTCAATTACACCTTTATTCATATGTGTATATCATACATATATAGGCTTGATCTCAGTACTTCATGCCCTATAAACACATATCCTATAAACAGCTCAACACATTCCTGTATCTCAGGC  TATATATATATATATACATACTACGTACTAGTACTAGTCTTACTTACTTACTTACTTGCTCACTTACGCCTGTTACCCCTCGTCGAGGAGCATANGCCGCTCACCAGCATTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD075270             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTACACCTTTATTCATATGTGTATATCATACATATATAGGCTTGATCTCAGTACTTCATGCCCTATAAACACATATCCTATAAACAGCTCAACACATTCCTGTATCTCAGGC  TATATATATATATATACATACTACGTACTAGTACTAGTCTTACTTACTTACTTACTTGCTCACTTACGCCTGTTACCCCTCGTCGAGGAGCATAGGCCGCTCACCAGCATTCTCCATCCAACTCTGTCCTGGGCAACTAGTACTAATCATGCTGACATTATTTAAATGCTACTGATATTAGCTTGTTTTCATTTTGGTTAGAGTAAATATCTTCATTATTAATCTTATTATTTTGTACGCTTCTCGCTCACAACTTGTTGTGTTGTTTATGAACTTCCTTCTAAATTGATTTTTGTAAATAAGTTTAGTGATTTCCTTACCTTTATAATGTATGTGTGGTGTTTGATTGTTTATTATTATTGGCAGCAGTGTTTCCCATTTTTGTGTGCGAGTTCTGCGTTTATTTATTCCTTTTTTACATTACTTGTTAGAATAAACAAT                                             ]
[-] EMBL CD137992             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCATGCCCTATANACACATATCCTATANACAGCTCAACACATCCCTGTATCTCAGGCTATATATATATATATATACATACTACGTACTAGTACTAGTCTTACTTACTTACTTACTTGCTCACTTACGCCTGTTACCCCTCGTCGAGGAGCATAGGCCGCTCACCAGCATTCTCCATCCAACTCTGTCCTGGGCAACTAGTACTAATCATGCTGACATTATTTAAATGCTACTGATATTAGCTTGTTTTCATTTTGGTTAGAGTAAATATCTTCACTATTAATCTTATTATTTTGTACGCTTCTCGCTCACAACTTGTTGTGTTGTTTATGAACTTCCTTCTAAATTGATTTTTGTAAATAAGTTTAGTGATTTCCTTACCTTTATAATGTATGTGTGGTGTTTGATTGTTTATTATTATCGGCAGCAGTGTTTCCCATTTTTGTGTGCGAGTTCTGCGTTTATTTATTCCTTTTTTACATTACTTGTTAGAATAAACAATTGTTTACGCATTTTCTTTGATTTAGATTTTTGTATTGCTATTCAG]


>consensus_4427#0 CTATCTATTCGATGAGTTGAATTCACATCATCCAGATGCATTGAATGAATTATCACAATT TAAACATCCACCAAATTCATAATTAACAAATTTATTACTGAAATGAATTTTATACTACTT ATTAACTGTCAATGCTACTAACTAAATAATGATCTCAATGGGGATGCTTTTAAATCTCAA TTAATCTCAATTCAATAGCACTGATCTGATCATTTATTGTATATACGTATATTAAAATCA TAGTCTTTTTAATTTCCCTTTACCTTTTGATACATAAGTCAACGGTTTTCCTTTTTTTTT CCTCTCACCTAATAATGATAGGAATCTACCTCCTTTCTCTATACTTTATTTTTAAATACA TTATTGTACTCTTTGGAAATACTCAATTACACCTTTATTCATATGTGTATATCATACATA TATAGGCTTGATCTCAGTACTTCATGCCCTATAAACACATATCCTATAAACAGCTCAACA CATTCCTGTATCTCAGGCTATATATATATATATACATACTACGTACTAGTACTAGTCTTA CTTACTTACTTACTTGCTCACTTACGCCTGTTACCCCTCGTCGAGGAGCATAGGCCGCTC ACCAGCATTCTCCATCCAACTCTGTCCTGGGCAACTAGTACTAATCATGCTGACATTATT TAAATGCTACTGATATTAGCTTGTTTTCATTTTGGTTAGAGTAAATATCTTCATTATTAA TCTTATTATTTTGTACGCTTCTCGCTCACAACTTGTTGTGTTGTTTATGAACTTCCTTCT AAATTGATTTTTGTAAATAAGTTTAGTGATTTCCTTACCTTTATAATGTATGTGTGGTGT TTGATTGTTTATTATTATTGGCAGCAGTGTTTCCCATTTTTGTGTGCGAGTTCTGCGTTT ATTTATTCCTTTTTTACATTACTTGTTAGAATAAACAATTGTTTACGCATTTTCTTTGAT TTAGATTTTTGTATTGCTATTCAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)