cluster # 4428

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Schistosoma mansoni
cluster # 4428 cluster # 4428 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4428#0 length = 606 sequences # 3

consensusID : consensus_4428#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 606
fasta sequence

                              [CAACCTGCACTATGTAAACAAGTTATATGAACATTTTTATCTCATTATTACTCAAGGTGGAACTACCACCGATTGGAGTTGTGATGATAAGATGTATGGTCCGAATTGGTAGAAATTGACGATTTGTTAATAACTCTGTTATTTTCTTAGGGTCCATAAAACATTGAACTTGCATTCACCTTCCTTCTATTTATGTTATCTTGAGATGTTTCGTTCCTGCTTTTTTATTTTGAGTCAGGTAAGCAGCACAAACCTACTTTACTTACGCCTGTTACTTTCCCACTCTTGATTTGACCGATGGCCATTCTCATTTCTCTGATCGTTAGTGGAGTGACAGCTATAAAAAGGTCTGTATGTGCTGCTTCGATGTCCAGTGGATTCAGTGGAAGAGGTCTATTCAAGAGTTCCTCAAAGTGTTCCACCCACCTGTTCCTCTGTTCTTGAATT-CACTGGTTATCTTGCCTTCTTTGCCCTTGACTGGTTGGTCCAGCCTACTATATTTCCCTTCCAGTTTCTTCGTCATGTCAAATAATTGTTTCATATTTGCTTTTTCCACTCTTCCATTTACTTATGTTTGTCGTCTCTAATGCTCTCTATCACGTGCTT]

[+] EMBL CD122306             [CAACCTGCACTATGTAAACAAGTTATATGAACATTTTTATCTCATTATTACTCAAGGTGGAACTACCACCGATTGGAGTTGTGATGATAAGATGTATGGTCCGAATTGGTAGAAATTGACGATTTGTTAATAACTCTGTTATTTTCTTAGGGTCCATAAAACATTGAACTTGCATTCACCTTCCTTCTATTTATGTTATCTTGAGATGTTTCGTTCCTGCTTTTTTATTTTGAGTCAGGTAAGCAGCACAAACCTACTTTACTTACGCCTGTTACTTTCCCACTCTTGATTTGACCGATGGCCATTCTCATTTCTCTGATCGTTAGTGGAGTGACAGCTATAAAAAGGTCTGTATGTGCTGCTTCGATGTCCAGTGGATTCAGTGGAAGAGGTCTATTCAAGAGTTCCTCAAAGTGTTCCACCCACCTGTTCCTCTGTTCTTGAATT CACTGGTTATCTTGCCTTCTTTGCCCTTGACTGGTTGGTCCAGCCT                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD122297             [CAACCTGCACTATGTAAACAAGTTATATGAACATTTTTATCTCATTATTACTCAAGGTGGAACTACCACCGATTGGAGTTGTGATGATAAGATGTATGGTCCGAATTGGTAGAAATTGACGATTTGTTAATAACTCTGTTATTTTCTTAGGGTCCATAAAACATTGAACTTGCATTCACCTTCCTTCTATTTATGTTATCTTGAGATGTTTCGTTCCTGCTTTTTTATTTTGAGTCAGGTAAGCAGCACAAACCTACTTTACTTACGCCTGTTACTTTCCCACTCTTGATTTGACCGATGGCCATTCTCATTTCTCTGATCGTTAGTGGAGTGACAGCTATAAAAAGGTCTGTATGTGCTGCTCCCATGTCCA                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD129578             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAGTTCCTCAAAATGTTCCACCCACCTGTTCCTCTGTTCTTGAATTCCACTGGTTATCTTGCCTTCTTTGTCCTTGACTGGTTGTTCCAGCTTACTATATTTCCCTTCCAGTTTCTTCGTCATGTCAAATAATTGTTTCATATTTGCTTTTTCCACTCTTCCATTTACTTATGTTTGTCGTCTCTAATGCTCTCTATCACGTGCTT]




>consensus_4428#0
CAACCTGCACTATGTAAACAAGTTATATGAACATTTTTATCTCATTATTACTCAAGGTGG
AACTACCACCGATTGGAGTTGTGATGATAAGATGTATGGTCCGAATTGGTAGAAATTGAC
GATTTGTTAATAACTCTGTTATTTTCTTAGGGTCCATAAAACATTGAACTTGCATTCACC
TTCCTTCTATTTATGTTATCTTGAGATGTTTCGTTCCTGCTTTTTTATTTTGAGTCAGGT
AAGCAGCACAAACCTACTTTACTTACGCCTGTTACTTTCCCACTCTTGATTTGACCGATG
GCCATTCTCATTTCTCTGATCGTTAGTGGAGTGACAGCTATAAAAAGGTCTGTATGTGCT
GCTTCGATGTCCAGTGGATTCAGTGGAAGAGGTCTATTCAAGAGTTCCTCAAAGTGTTCC
ACCCACCTGTTCCTCTGTTCTTGAATTCACTGGTTATCTTGCCTTCTTTGCCCTTGACTG
GTTGGTCCAGCCTACTATATTTCCCTTCCAGTTTCTTCGTCATGTCAAATAATTGTTTCA
TATTTGCTTTTTCCACTCTTCCATTTACTTATGTTTGTCGTCTCTAATGCTCTCTATCAC
GTGCTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case