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Schistosoma mansoni
cluster # 4448 cluster # 4448       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4448#0 length = 992 sequences # 3  
consensusID : consensus_4448#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 992
fasta sequence 
                              [ACTGAACAAATATCGACCACATTTATCTATATAAATGATATATACAGAATATATACAAAGATCGTTTAATCAAAACGAAGGTCATTTGTTGCTGAAGATATAAGTTTACATTTCGAATTTTCTTCCACACATTTAGGAGCATCGTTAACGTACAAATATACTGTACTGCCGTCAGGTACAGTAAGAGCACATGCAGAAAATAAACTCATAGTTAATTTATGTGGCCAGTCATATATATAAATATAAACTTGATGTTTATGAATTTTATTAAAAAACGAGGTAATAAAGCTTTGAAATGATGAGCTTAAATTTTGACTTTCATAAAATTGATTTAAAAGAGACGAAGTAATCATTGGATTTTCTGACAGATTTAAAGTATGGAGGTAAGAAAGAGTATCAGGTATCATACTTAAAAATGTTGTTGCTACAGGCACTTGGATGTTATGTGATATAAAAACTGAAGATAAGTCCAACTCTTCAAGGTGCGGGCAAGTTTGCTTAAGAAAAGCTGACATCTTTTCAAAACGCATGTTCAGTGGACAAGATGCTGGAGGACCAAGAAATAAACGATAACATTTTGATACATTTAGATACTTCAGACTTTTTGAAGCATTTAAACCAATCAATGCCGATAAGTGTACGTCATATACCCAGCTACTATCAGATAACTTGAGATACTTTAACGAAAATCTTGGGACACTGGGCAGAGATTCAGGATCAACTGACCTGTTTTAAGCAACAGTCTCAATTAATTCAAGTTTTTCAAGATAATCAGAAAATAATCTGATAAAATTTTGAAAGTTATTAATACTTCCACCCCGAATCAATACATGAGTCAAAACACCACAAATTTTAAAGACTGGTGCCAATCCTGCTTCAATATTTTTGGATCTCGGATTAACTTTGGGACAATTCAGTCACGACGAAAAGGTACCTGCATTCAATTTTAACGCTAACAGTTTGTCGTCCAACCAGTTTCCTCGTGCGGTCTT]

[+] EMBL CD075649             [ACTGAACAAATATCGACCACATTTATCTATATAAATGATATATACAGAATATATACAAAGATCGTTTAATCAAAACGAAGGTCATTTGTTGCTGAAGATATAAGTTTACATTTCGAATTTTCTTCCACACATTTAGGAGCATCGTTAACGTACAAATATACTGTACTGCCGTCAGGTACAGTAAGAGCACATGCAGAAAATAAACTCATAGTTAATTTATGTGGCCAGTCATATATATAAATATAAACTTGATGTTTATGAATTTTATTAAAAAACGAGGTAATAAAGCTTTGAAATGATGAGCTTAAATTTTGACTTTCATAAAATTGATTTAAAAGAGACGAAGTAATCATTGGATTTTCTGACAGATTTAAAGTATGGAGGTAAGAAAGAGTATCAGGTATCATACTTAAAAATGTTGTTGCTACAGGCACTTGGATGTTATGTGATATAAAAACTGAAGATAAGTCCAACTCTTCAAGGTGCGGGCAAGTTTGCTTAAGAAAAGCTGACATCTTTTCAAAACGCATGTTCAGTGGACAAGATGCTGGAGGACCAAGAAATAAACGATAACATTTTGATACATTTAGATACTTCAGACTTTTTGAAGCATTTAAACCAATCAATGCCGATAAGTGTACGTCATATACCCAGCTACTATCAGATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD075733             [             CGACCACATTTATCTATATAAATGATATATACAGAATATATACAAAGATCGTTTAATCAAAACGAAGGTCATTTGTTGCTGAAGATATAAGTTTACATTTCGAATTTTCTTCCACACATTTAGGAGCATCGTTAACGTACAAATATACTGTACTGCCGTCAGGTACAGTAAGAGCACATGCAGAAAATAAACTCATAGTTAATTTATGTGGCCAGTCATATATATAAATATAAACTTGATGTTTATGAATTTTATTAAAAAACGAGGTAATAAAGCTTTGAAATGATGAGCTTAAATTTTGACTTTCATAAAATTGATTTAAAAGAGACGAAGTAATCATTGGATTTTCTGACAGATTTAAAGTATGGAGGTAAGAAAGAGTATCAGGTATCATACTTAAAAATGTTGTTGCTACAGGCACTTGGATGTTATGTGATATAAAAACTGAAGATAAGTCCAACTCTTCAAGGTGCGGGCAAGTTTGCTTAAGAAAAGCTGACATCTTTTCAAAACGCATGTTCAGTGGACAAGATGCTGGAGGACCAAGAAATAAACGATAACATTTTGATACATTTAGATACTTCAGACTNTTTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD082118             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACGAAGTAATCATTGGATTTTCTGACAGATTTAAAGTATGGAGGTAAGANAGAGTATCAGGTATCATACTTAAAAATGTTGTTGCTACAGGCACTTGGATGTTATGTGATATAAAAACTGAAGATAAGTCCAACTCTTCAAGGTGCGGGCAAGTTTGCTTAAGAAAAGCTGACATCTTTTCAAAACGCATGTTCAGTGGACAAGATGCTGGAGGACCAAGAAATAAACGATAACATTTTGATACATTTAGATACTTCAGACTTTTTGAAGCATTTAAACCAATCAATGCCGATAAGTGTACGTCATATACCCAGCTACTATCAGATAACTTGAGATACTTTAACGAAAATCTTGGGACACTGGGCAGAGATTCAGGATCAACTGACCTGTTTTAAGCAACAGTCTCAATTAATTCAAGTTTTTCAAGATAATCAGAAAATAATCTGATAAAATTTTGAAAGTTATTAATACTTCCACCCCGAATCAATACATGAGTCAAAACACCACAAATTTTAAAGACTGGTGCCAATCCTGCTTCAATATTTTTGGATCTCGGATTAACTTTGGGACAATTCAGTCACGACGAAAAGGTACCTGCATTCAATTTTAACGCTAACAGTTTGTCGTCCAACCAGTTTCCTCGTGCGGTCTT]




>consensus_4448#0
ACTGAACAAATATCGACCACATTTATCTATATAAATGATATATACAGAATATATACAAAG
ATCGTTTAATCAAAACGAAGGTCATTTGTTGCTGAAGATATAAGTTTACATTTCGAATTT
TCTTCCACACATTTAGGAGCATCGTTAACGTACAAATATACTGTACTGCCGTCAGGTACA
GTAAGAGCACATGCAGAAAATAAACTCATAGTTAATTTATGTGGCCAGTCATATATATAA
ATATAAACTTGATGTTTATGAATTTTATTAAAAAACGAGGTAATAAAGCTTTGAAATGAT
GAGCTTAAATTTTGACTTTCATAAAATTGATTTAAAAGAGACGAAGTAATCATTGGATTT
TCTGACAGATTTAAAGTATGGAGGTAAGAAAGAGTATCAGGTATCATACTTAAAAATGTT
GTTGCTACAGGCACTTGGATGTTATGTGATATAAAAACTGAAGATAAGTCCAACTCTTCA
AGGTGCGGGCAAGTTTGCTTAAGAAAAGCTGACATCTTTTCAAAACGCATGTTCAGTGGA
CAAGATGCTGGAGGACCAAGAAATAAACGATAACATTTTGATACATTTAGATACTTCAGA
CTTTTTGAAGCATTTAAACCAATCAATGCCGATAAGTGTACGTCATATACCCAGCTACTA
TCAGATAACTTGAGATACTTTAACGAAAATCTTGGGACACTGGGCAGAGATTCAGGATCA
ACTGACCTGTTTTAAGCAACAGTCTCAATTAATTCAAGTTTTTCAAGATAATCAGAAAAT
AATCTGATAAAATTTTGAAAGTTATTAATACTTCCACCCCGAATCAATACATGAGTCAAA
ACACCACAAATTTTAAAGACTGGTGCCAATCCTGCTTCAATATTTTTGGATCTCGGATTA
ACTTTGGGACAATTCAGTCACGACGAAAAGGTACCTGCATTCAATTTTAACGCTAACAGT
TTGTCGTCCAACCAGTTTCCTCGTGCGGTCTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)