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Schistosoma mansoni
cluster # 4449 cluster # 4449       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4449#0 length = 733 sequences # 3  

consensusID : consensus_4449#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 733
fasta sequence
                              [AATAGTTTGTACGTTGCAATGGCCCAAACACATCAGCTGAGTGCCTTGCTTAAAGTAACTGCGGCTAAAATCGATGTTGAAGATAAACTTCTTGAGCACTACTTGAATAAGGTTGTGAAAGTCATAGGTTCATCTGATTTATCAAAAGCACTCACGGAGGAATTCGTATTATCTGTCAAATGCTTAATTAACATTTGTTCAACTGTTCAAGGAACAAGTCTTTTAAAAACCGTGCTGTCAACTCAAGAAAAACGTGAAGAGTTCACTCGAATCCTTGCTACCCTCTCTTTGAATAATTCAAGAATTCATGCTGATTTGGCGTCTCTAATTATTGACTTGATTTCTAATTTGACTAGAGATCCTGTTTGGATTAGTCATTTTGGTGAACATTTCGATAACAAACATATTAGATCGATTCTTAGTTCAAGTTCTTATGTTCAGAAGTTTCTTCCAATAGTACTTAACCTAAGTAGCCTAACATCAGTACGCCACTCCGTATGTTCCTCAGAACAATTACGAAAGCTGATGGGTTTATTTTCGAAGGTGGATTCTGTCCCAATCAAAATTCTCATAGCTGGCATAATAAAAAATTGCTCATTTGGAGATGAGCTTCATTGTGAACTTTTCAACAA-GGCGTCGGTTTGCTCGATGCACTTTTAGTTCCACTTTGTGGTCCAGAAGATTGTATTGATAAAGAAGACCGTGCTATATTGCCTAAATCTGTGCAGACTAT]

[+] EMBL BF936849             [AATAGTTTGTACGTTGCAATGGCCCAAACACATCAGCTGAGTGCCTTGCTTAAAGTAACTGCGGCTAAAATCGATGTTGAAGATAAACTTCTTGAGCACTACTTGAATAAGGTTGTGAAAGTCATAGGTTCATCTGATTTATCAAAAGCACTCACGGAGGAATTCGTATTATCTGTCAAATGCTTAATTAACATTTGTTCAACTGTTCAAGGAACAAGTCTTTTAAAAACCGTGCTGTCAACTCAAGAAAAACGTGAAGAGTTCACTCGAATCCTTGCTACCCTCTCTTTGAATAATTCAAGAATTCATGCTGATTTGGCGTCTCTAATTATTGACTTGATTTCTAATTTGACTAGAGATCCTGTTTGGATTAGTCATTTTGGTGAACATTTCGATAACAAACATATTAGATCGATTCTTAGTTCAAGTTCTTATGTTCAGAAGTTTCTTCCAATAGTACTTAACCTAAGTAGCCTAACATCAGTACGCCACTCCGTATGTTCCTCAGAACAATTACGAAAGCTGATGGGTTTATTTTCGAAGGTGGATTCTGTCCCAATCAAAATTCTCATAGCTGGCATAATAAAAAATTGCTCATTTGGAGATGAGCTTCATTGTGAACTTTTCAACAA GGCGTCGGTTTG                                                                                         ]
[+] EMBL AI976505             [AATAGTTAGTACGTTGCAATGGCCCAAACACATCAGCTGAGTGCCTTGCTTAAAGTAACTGCGGATAAAATCGATGTTGAAGATAAACTTCTTGAGCACTACTTGAATAAGGTTGTGAAAGTCATAGGTTCATCTGATTTATCAAAAGCACTCACGGAGGAATTCGTATTATCTGTCAAATGCTTAATTAACATTTGTTCAACTGTTCAAGGAACAAGTCTTTTAAAAACCGCGCTGTCAACTCAAGAAAAACGTGAAGAGTTCACTCGAATCCTTGCTACCCTCTCTTTGAATAATTCAAGAATTCATGCTGATTTGGCGTCTCTAATTATTGACTTGATTTCTAATTAGACTAGAGATCCTGTTTGGATTAGTCATTATGGTGAACATTTCGATAACAAACATATTAGATCGATTCTTAGCTCAAGTTCTTATGTTCAGAAGTTTCTTCCAATAGTACT                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD080589             [                                                                                                                                                      CTCACGGAGGAATTCGTATTATCTGTCAAATGCTTAATTAACATTTGTTCAACTGTTCAAGGAACAAGTCTTTTAAAAACCGTGCTGTCAACTCAAGAAAAACGTGAAGAGTTCACTCGAATCCTTGCTACCCTCTCTTTGAATAATTCAAGAATTCATGCTGATTTGGCGTCTCTAATTATTGACTTGATTTCTAATTTGACTAGAGATCCTGTTTGGATTAGTCATTTTGGTGAACATTTCGATAACAAACATATTAGATCGATTCTTAGTTCAAGTTCTTATGTTCAGAAGTTTCTTCCAATAGTACTTAACCTAAGTAGCCTAACATCAGTACGCCACTCCGTATGTTCCTCAGAACAATTACGAAAGCTGATGGGTTTATTTTCGAAGGTGGATTCTGTCCCAATCAAAATTCTCATAGCTGGCATAATAAAAAATTGCTCATTTGGAGATGAGCTTCATTGTGAACTTTTCAACAAGGGCGTCGGTTTGCTCGATGCACTTTTAGTTCCACTTTGTGGTCCAGAAGATTGTATTGATAAAGAAGACCGTGCTATATTGCCTAAATCTGTGCAGACTAT]


>consensus_4449#0 AATAGTTTGTACGTTGCAATGGCCCAAACACATCAGCTGAGTGCCTTGCTTAAAGTAACT GCGGCTAAAATCGATGTTGAAGATAAACTTCTTGAGCACTACTTGAATAAGGTTGTGAAA GTCATAGGTTCATCTGATTTATCAAAAGCACTCACGGAGGAATTCGTATTATCTGTCAAA TGCTTAATTAACATTTGTTCAACTGTTCAAGGAACAAGTCTTTTAAAAACCGTGCTGTCA ACTCAAGAAAAACGTGAAGAGTTCACTCGAATCCTTGCTACCCTCTCTTTGAATAATTCA AGAATTCATGCTGATTTGGCGTCTCTAATTATTGACTTGATTTCTAATTTGACTAGAGAT CCTGTTTGGATTAGTCATTTTGGTGAACATTTCGATAACAAACATATTAGATCGATTCTT AGTTCAAGTTCTTATGTTCAGAAGTTTCTTCCAATAGTACTTAACCTAAGTAGCCTAACA TCAGTACGCCACTCCGTATGTTCCTCAGAACAATTACGAAAGCTGATGGGTTTATTTTCG AAGGTGGATTCTGTCCCAATCAAAATTCTCATAGCTGGCATAATAAAAAATTGCTCATTT GGAGATGAGCTTCATTGTGAACTTTTCAACAAGGCGTCGGTTTGCTCGATGCACTTTTAG TTCCACTTTGTGGTCCAGAAGATTGTATTGATAAAGAAGACCGTGCTATATTGCCTAAAT CTGTGCAGACTAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)