cluster # 4477

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Schistosoma mansoni
cluster # 4477 cluster # 4477 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4477#0 length = 646 sequences # 3

consensusID : consensus_4477#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 646
fasta sequence

                              [TTCTTCGGAATCATGTGAACCTTGTGAAACATTGGATGAAACTGAATTTGCAACTTCTCTCAATAAAGATTGTTTACTTGTTAAATTTAAGCTTATGGAAGAACTGATCAAACCTCTGCTTAATGGGATTAATGAAAGTGTTTCTTCTAATCCATATCTATATCATTCTCTAGAAGGTTTCCTGGATATGCTTAATGAGCACTACAGAAATATCAGAGAGACTATGTTTATTCAAATGAAGGATTCTGAGGTAGAAATCATTGAACCTAAACCAACCCAGAATGTGGAAAAAGTTATACTTTCAGGAAGATCTTTAAACATGGCGGCTTTGTCTGTTTGGAATCGTATCTACAGTCGTTTGCATGGATTTGATTCGTTTTTGCCTACGGCTAACACGAATCAATCAATGTCCATCAGTGCTCAAATAGATGCCTGTATTCATGAGGCCACTAATGTTGATAATCTTGCTCTCATGTATGAAGGATGGACGGCATGGGTATGAATTTCTGCAAGTGATTCGCTAATATGCTCCAATTTTCACTACAAAGTTAATTTTTAATTGCTCGATCTCGAGGATCACGTGGTAAATGGATTGATCAATTAGTACCTCTAGGTAGCTTGAGGAAATCATACCCATAATATCCAT]

[-] EMBL CD117506             [TTCTTCGGAATCATGTGAACCTTGTGAAACATTGGATGAAACTGAATTTGCAACTTCTCTCAATAAAGATTGTTTACTTGTTAAATTTAAGCTTATGGAAGAACTGATCAAACCTCTGCTTAATGGGATTAATGAAAGTGTTTCTTCTAATCCATATCTATATCATTCTCTAGAAGGTTTCCTGGATATGCTTAATGAGCACTACAGAAATATCAGAGAGACTATGTTTATTCAAATGAAGGATTCTGAGGTAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD083685             [                                                                                                                                    TGAAAATGTTTCTTCTAATCCATATCTATATCATTCTCTAGAAGGTTTCCTGGATATGCTTAATGAGCACTACAGAAATATCAGAGAGACTATGTTTATTCAAATGAAGGATTCTGAGGTAGAAATCATTGAACCTAAACCAACCCAGAATGTGGAAAAAGTTATACTTTCAGGAAGATCTTTAAACATGGCGGCTTTGTCTGTTTGGAATCGTATCTACAGTCGTTTGCATGGATTTGATTCGTTTTTGCCTACGGCTAACACGAATCAATCAATGTCCATCAGTGCTCAAATAGATGCCTGTATTCATGAGGCCACTAATGTTGATAATCTTGCTCTCATGTATGAAGGATGGACGGCATGGGTATGAATTTCTGCAAGTGATTCGCTAATATGCTCCAATTTTCACTACAAAGTTAATTTTTAATTGCTCGATCTCGAGGATCACGTGGTAAATGGATTGATCAATTAGTACCTCTAGGTAGCTTGAGGAAATCATACCCATAATATCCAT]
[+] EMBL CD186341             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATACTTTCAGGAAGATCTTTAAACATGGCGGCTTTGTCTGTTTGGAATCGTATCTACAGTCGTTTGCATGGATTTGATTCGTTTTTGCCTACGGCTAACACGAATCAATCAATGTCCATCAGTGCTCAAATAGATGCCTGTATTCATGAGGCCACTAATGTTGATAATCTTGCTCTCATGTATGAAGGATGGACGGCATGGGTATGAATTTCTGCAAGTGATTCGCTAATATGCTCCAATTTTCACTACAAAGTTAATTTTTAATTGCTCGATCTCGAGGATCACGTGGTCAATGGATTGA                                                  ]




>consensus_4477#0
TTCTTCGGAATCATGTGAACCTTGTGAAACATTGGATGAAACTGAATTTGCAACTTCTCT
CAATAAAGATTGTTTACTTGTTAAATTTAAGCTTATGGAAGAACTGATCAAACCTCTGCT
TAATGGGATTAATGAAAGTGTTTCTTCTAATCCATATCTATATCATTCTCTAGAAGGTTT
CCTGGATATGCTTAATGAGCACTACAGAAATATCAGAGAGACTATGTTTATTCAAATGAA
GGATTCTGAGGTAGAAATCATTGAACCTAAACCAACCCAGAATGTGGAAAAAGTTATACT
TTCAGGAAGATCTTTAAACATGGCGGCTTTGTCTGTTTGGAATCGTATCTACAGTCGTTT
GCATGGATTTGATTCGTTTTTGCCTACGGCTAACACGAATCAATCAATGTCCATCAGTGC
TCAAATAGATGCCTGTATTCATGAGGCCACTAATGTTGATAATCTTGCTCTCATGTATGA
AGGATGGACGGCATGGGTATGAATTTCTGCAAGTGATTCGCTAATATGCTCCAATTTTCA
CTACAAAGTTAATTTTTAATTGCTCGATCTCGAGGATCACGTGGTAAATGGATTGATCAA
TTAGTACCTCTAGGTAGCTTGAGGAAATCATACCCATAATATCCAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case