cluster # 4481

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Schistosoma mansoni
cluster # 4481 cluster # 4481 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4481#0 length = 587 sequences # 3

consensusID : consensus_4481#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 587
fasta sequence

                              [TTACACCTATATTTACGTATAATAAGATGAGTTACAAACTAAGGAGTACGAAGAAAACTGTTCCCTGTAAACGAAATCTGAGAGTTCATTAGAAAACAGGATGTGGTATTGATGATAGATTGTGTTTTTCTAGCGACGTGTTTGTTTCCGTAATAACTGTAAGAGTGTTTACTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGTGTGTATGTGTGTGAATGACTAGGTGTTTGTTGTTAGTTTATGAAAGAGCTTATTCTGTCGAGTGTAGTTGTGCAGTTATTTTTGTTCCTGAAAGCGCAGAGACGCACTAGCGTTGTCTGTCGTCGCATTGGGAACAAC-AGAGAAGGATGATTCCATAGTGGGTGAGATGGCAATGATGCTGTTTCAATGTGGGATTGTACAGTTGTATGGCGAATGAGATGAATTGAAGTGATCATGTGATGTGGTATTGATGATAGATTGTGTTTTTCTAGCGACGTGTTTGTTTCCGTAATAACTGTAAGAGTGTTTAC-TTTGTTGTTGTTGGTTGTGGTGGGTGTGTATGTGTGTGAATGACTAGGTGTTTGTTGTTAGTCGAAATCAACACCTAAC]

[+] EMBL CD137143             [TTACACCTATATTTACGTATAATAAGATGAGTTACAAACTAAGGAGTACGAAGAAAACTGTTCCCTGTAAACGAAATCTGAGAGTTCATTAGAAAACAGGATGTGGTATTGATGATAGATTGTGTTTTTCTAGCGACGTGTTTGTTTCCGTAATAACTGTAAGAGTGTTTACTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGTGTGTATGTGTGTGAATGACTAGGTGTTTGTTGTTAGTTTATGAAAGAGCTTATTCTGTCGAGTGTAGTTGTGCAGTTATTTTTGTTCCTGAAAGCGCAGAGACGCACTAGCGTTGTCTGTCGTCGCATTGGGAACAAC AGAGAAGGATGATTCCATAGTGGGTGAGATGGCAATGATGCTGTTTCAATGTGGGATTGTACAGTTGTATGGCGAATGAGATGAATTGAAGTGATCATGTGATGTGGTATTGATGATAAATTGTGTTTTTCTAGCGACGTGTTTGTTTCCGTAATAACTGTAAGAGTGTTTACTTTTGTTGTTGTTGGTTGTGGTGGGTGTGTATGTGTGTGAATGACTAAGTGTTTG                         ]
[+] EMBL CD136862             [TTACACCTATATTTACGTATAATAAGATGAGTTACAAACTAAGGAGTACGAAGAAAACTGTTCCCTGTAAACGAAATCTGAGAGTTCA TAGAAAACAGGATGTGGTATTGATGATAGATTGTGTTTTTCTAGCGACGTGTTTGTTTCCGTAATAACTGTAAGAGTGTTTACTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGTGTGTATGTGTGTGAATGACTAGGTGTTTGTTGTTAGTTTATGAAAGAGCTTATTCTGACGAGTGTAGTTGTGCAGTTATTTTTGTTCCTGAAAGCGCAGAGACGCACTAGCGTTGTCTGTCGTCGCATTGGGAACAAC AGAGAAGGATGATTCCATAGTGGGTGAGATGGCAATGATGCTGTTTCAATGTGGGATTGTACAGTTGTATGGCGAATGAGATGAATTGAAGTGATCATGTGATGTGGTATTGATGATAGATTGTGTTTTTCTAGCGACGTGTTTGTTTCCGTAATAACTGTAAGAGTGTTTAC TTTGTTGNTGTTGTTGGTTGTGGGTGTGTATGTGTGTGAATGACTAGGTGTTT                          ]
[-] EMBL CD157710             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGTCTGTCGTCGCATTGGG ACAACAAGAGAAGGATGATTCCATAGTGGGTGAGATGGCAATGATGCTGTTTCAATGTGGGATTGTACAGTTGTATGGCGAATGAGATGAATTGAAGTGATCATGTGATGTGGTATTGATGATAGATTGTGTTTTTCTAGCGACGTGTTTGTTTCCGTAATAACAGTAAGAGTGTTTAC TTTGTTGTTGTT GTTGT     GTGTG  TGTGTGTGAATGACTAGGTGTTTGTTGTTAGTCGAAATCAACACCTAAC]




>consensus_4481#0
TTACACCTATATTTACGTATAATAAGATGAGTTACAAACTAAGGAGTACGAAGAAAACTG
TTCCCTGTAAACGAAATCTGAGAGTTCATTAGAAAACAGGATGTGGTATTGATGATAGAT
TGTGTTTTTCTAGCGACGTGTTTGTTTCCGTAATAACTGTAAGAGTGTTTACTTTGTTGT
TGTTGTTGTTGTTGTGTGTGTATGTGTGTGAATGACTAGGTGTTTGTTGTTAGTTTATGA
AAGAGCTTATTCTGTCGAGTGTAGTTGTGCAGTTATTTTTGTTCCTGAAAGCGCAGAGAC
GCACTAGCGTTGTCTGTCGTCGCATTGGGAACAACAGAGAAGGATGATTCCATAGTGGGT
GAGATGGCAATGATGCTGTTTCAATGTGGGATTGTACAGTTGTATGGCGAATGAGATGAA
TTGAAGTGATCATGTGATGTGGTATTGATGATAGATTGTGTTTTTCTAGCGACGTGTTTG
TTTCCGTAATAACTGTAAGAGTGTTTACTTTGTTGTTGTTGGTTGTGGTGGGTGTGTATG
TGTGTGAATGACTAGGTGTTTGTTGTTAGTCGAAATCAACACCTAAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case