cluster # 4493

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Schistosoma mansoni
cluster # 4493 cluster # 4493 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4493#0 length = 687 sequences # 3

consensusID : consensus_4493#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 687
fasta sequence

                              [TGTGTGCACTATGAAGTGGTGTACTTTATAACAAGGATCTGATTACATCACCAATCTAGTGAATTACTTTCACATTACAGTGCTCTTAAAGCCAGTCATGAATGCGTAGCTACGGCTATTTTCTTAATCTTGTGCCCGACATATTGAAGTTCGTGCTTTACTATTCGTAAACCTTTGTTCAATCGGAGTTTTGTCAACTTAAAATGACAAAGTACCGCATTATTTTCTATGTTGTTAAGTGCATTTGATAACATGTTAACAACTAAAACCAAGTCATTCGTAAAATCAACAACAAATACTTGCTTAGCTGTCACACATAAGTATCTTGAGATCACAGCAGGTCAAACTGATGGACAATCGTTAATCGCCAATCTGATGAAACCGGGGTTTTTCAAAAGGTACTAACACAAAGAATGATCACTTCAGTGATTAGGGAACCAAGTTTTCAACTGATGTCACAACTTTGGGCTCCTCCTCACTTATTCTAGTTATTGTGGTCAGGCAGTATTAATAGCGTTCACAATGTGATTGAAGACGGGTTAGGTCAATTAATAGGACTTTGCTGGGATAGAAGGTAACACGCTCACTACTGTTTCGCAGTTACAAGAAAATTCCAAGCTAGAAATTATTAGAGACCATGACTCTTGCTANNAACAGCTGTATTATATTGCCGAACTTAACTTTACT]

[+] EMBL CD067599             [TGTGTGCACTATGAAGTGGTGTACTTTATAACAAGGATCTGATTACATCACCAATCTAGTGAATTACTTTCACATTACAGTGCTCTTAAAGCCAGTCATGAATGCGTAGCTACGGCTATTTTCTTAATCTTGTGCCCGACATATTGAAGTTCGTGCTTTACTATTCGTAAACCTTTGTTCAATCGGAGTTTTGTCAACTTAAAATGACAAAGTACCGCATTATTTTCTATGTTGTTAAGTGCATTTGATAACATGTTAACAACTAAAACCAAGTCATTCGTAAAATCAACAACAAATACTTGCTTAGCTGTCACACATAAGTATCTTGAGATCACAGCAGGTCAAACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD067600             [gGTGTGCACTATGAAGTGGTGTACTTTATAACAAGGATCTGATTAGATCACCAATCTAGTGAATTACTTTCACATTACAGTGCTCTTAAAGCCAGTCATGAATGCGTAGCTACGGCTATTTTCTTAATCTTGTGCCCGACATATTGAAGTTCGTGCTTTACTATTCGTAAACCTTTGTTCAATCGGAGTTTTGTCAACTTAAAATGACAAAGTACCGCATTATTTTCTATGTTGTTAAGTGCATTTGATAACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD201230             [                                                                                                                                                                                                                                                             TGTTAACAACTAAAACCAAGTCATTCGTAAAATCAACAACAAATACTTGCTTAGCTTTCACACATAAGTATCTTGAGATCACAGCAGGTCAAACTGATGGACAATCGTTAATCGCCAATCTGATGAAACCGGGGTTTTTCAAAAGGTACTAACACAAAGAATGATCACTTCAGTGATTAGGGAACCAAGTTTTCAACTGATGTCACAACTTTGGGCTCCTCCTCACTTATTCTAGTTATTGTGGTCAGGCAGTATTAATAGCGTTCACAATGTGATTGAAGACGGGTTAGGTCAATTAATAGGACTTTGCTGGGATAGAAGGTAACACGCTCACTACTGTTTCGCAGTTACAAGAAAATTCCAAGCTAGAAATTATTAGAGACCATGACTCTTGCTANNAACAGCTGTATTATATTGCCGAACTTAACTTTACT]




>consensus_4493#0
TGTGTGCACTATGAAGTGGTGTACTTTATAACAAGGATCTGATTACATCACCAATCTAGT
GAATTACTTTCACATTACAGTGCTCTTAAAGCCAGTCATGAATGCGTAGCTACGGCTATT
TTCTTAATCTTGTGCCCGACATATTGAAGTTCGTGCTTTACTATTCGTAAACCTTTGTTC
AATCGGAGTTTTGTCAACTTAAAATGACAAAGTACCGCATTATTTTCTATGTTGTTAAGT
GCATTTGATAACATGTTAACAACTAAAACCAAGTCATTCGTAAAATCAACAACAAATACT
TGCTTAGCTGTCACACATAAGTATCTTGAGATCACAGCAGGTCAAACTGATGGACAATCG
TTAATCGCCAATCTGATGAAACCGGGGTTTTTCAAAAGGTACTAACACAAAGAATGATCA
CTTCAGTGATTAGGGAACCAAGTTTTCAACTGATGTCACAACTTTGGGCTCCTCCTCACT
TATTCTAGTTATTGTGGTCAGGCAGTATTAATAGCGTTCACAATGTGATTGAAGACGGGT
TAGGTCAATTAATAGGACTTTGCTGGGATAGAAGGTAACACGCTCACTACTGTTTCGCAG
TTACAAGAAAATTCCAAGCTAGAAATTATTAGAGACCATGACTCTTGCTANNAACAGCTG
TATTATATTGCCGAACTTAACTTTACT

clustalw multiple alignements is not computed in this case