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Schistosoma mansoni
cluster # 4528 cluster # 4528       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4528#0 length = 1149 sequences # 3  

consensusID : consensus_4528#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1149
fasta sequence
                              [AATCATCTTTCCTTTCACTTAGGACGGCATTTTTAACTTCATCATCATTACTGTCATCATCTCANNCATCCAATGGTTCAGTAAGATTTATGTCAGCATCATCGCCATCACTGTGGTCATGAGTACCATCGGTATGTTTTATAAACTGTCCAGTTAAACGATAATGTAACGAATTTTTTACATGGTGTCGTACAGTTTTACGTTGTTTCAAATTAGAACAATGTTTGATAAAGCGTTGTACTCGATTAATATGACGTTGTTGTTTTAATAAAGCTCCATGATATGTATCGTATTCATTGTTGGAAGATGGTTCACTGGCATCGGAATCGAAAATCTCACTGGGATCATCAACTAAATCAGTTTGTTTTGGAGGACGTTCCAGAAGACAAGACAGAATAGAAGATTGAGCAAATATAAACCATTCCTCTGGACTGATAGATGACTGAGATACTGTTGTTGTTTTTGTGGTAGTGGTGGCAGGGGCTTGCTCTGAAACTTTATTCTTTACACCATCCAACCTGGTTGTGTTGGATTCTAAGTCTGCTATCGCTGCAGCTTCAGCATGTGCTAAAAAACGTATATGTTGACTGGTTAACTTTGTGGGATTTGGTGGACTGCCAATTTTCATTGCAACTTCGATAGCTGCAACTGCATGGTTCCTAGCTCGTGTAACTGCTTTCAATGGACTTCTTGACTTTGATCTGTCATGTTTAGGAGTAGATGTTGGTCGTTTAGGTCGACTCGGTGGAACAGGTTTCTTTTCTGAAGTTAAATTACACGATACATTACTACTACTATTACTAGTAGTAGTAGCAGCAGAAGTAGTGGTGGTAGTAGTAGTACCAGGTTGTGTTGGTGGTCGAAAAGGTTTAGCTCGATATGTTCCACCGAATACACGACTCCATGTTTTCCCATCTAATCGAGCACAAGCTAATCGATATAATGTGAATGTATCACGAGTATGCAATGCATAAACTAATAAACCGAAATAGGATGCAGCTAAAACTTGGGCTAATAGACCAATAATTCGACGACGATCCACAGACTGAATACGTGTTACAGATGACGATGATGAATCACGATCTAACAGATTNTGCGTTGATGTAATACGAATAATTTGACTAGTACTTACACTATTACTCTGTATTN]

[-] EMBL AI976061             [AATCATCTTTCCTTTCACTTAGGACGGCATTTTTAACTTCATCATCATTACTGTCATCATCTCANNCATCCAATGGTTCAGTAAGATTTATGTCAGCATCATCGCCATCACTGTGGTCATGAGTACCATCGGTATGTTTTATAAACTGTCCAGTTAAACGATAATGTAACGAATTTTTTACATGGTGTCGTACAGTTTTACGTTGTTTCAAATTAGAACAATGTTTGATAAAGCGTTGTACTCGATTAATATGACGTTGTTGTTTTAATAAAGCTCCATGATATGTATCGTATTCATTGTTGGAAGATGGTTCACTGGCATCGGAATCGAAAATCTCACTGGGATCATCAACTAAATCAGTTTGTTTTGGAGGACGTTCCAGAAGACAAGACAGAATAGAAGATTGAGCAAATATAAACCATTCCTCTGGACTGATAGATGACTGAGATACTGTTGTTGTTTTTGTGGTAGTGGTGGCAGGGGCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD067941             [                                                                                                                   GTCATGAGTACCATCGGTATGTTTTATAAACTGTCCAGTTAAACGATAATGTAACGAATTTTTTACATGGTGTCGTACAGTTTTACGTTGTTTCAAATTAGAACAATGTTTGATAAAGCGTTGTACTCGATTAATATGACGTTGTTGTTTTAATAAAGCTCCATGATATGTATCGTATTCATTGTTGGAAGATGGTTCACTGGCATCGGAATCGAAAATCTCACTGGGATCATCAACTAAATCAGTTTGTTTTGGAGGACGTTCCAGAAGACAAGACAGAATAGAAGATTGAGCAAATATAAACCATTCCTCTGGACTGATAGATGACTGAGATACTGTTGTTGTTTTTGTGGTAGTGGTGGCAGGGGCTTGCTCTGAAACTTTATTCTTTACACCATCCAACCTGGTTGTGTTGGATTCTAAGTCTGCTATCGCTGCAGCTTCAGCATGTGCTAAAAAACGTATATGTTGACTGGTTAACTTTGTGGGATTTGGTGGACTGCCAATTTTCATTGCAACTTCGATAGCTGCAACTGCATGGTTCCTAGCTCGTGTAACTGCTTTCAATGGACTTCTTGACTTTGATCTGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD178219             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGAAACTTTATTCTTTACACCATCCAACCTGGTTGTGTTGGATTCTAAGTCTGCTATCGCTGCAGCTTCAGCATGTGCTAAAAAACGTATATGTTGACTGGTTAACTTTGTGGGATTTGGTGGACTGCCAATTTTCATTGCAACTTCGATAGCTGCAACTGCATGGTTCCTAGCTCGTGTAACTGCTTTCTCTGGACTTCTTGACTTTGATCTGTCATGTTTAGGAGTAGATGTTGGTCGTTTAGGTCGACTCGGTGGAACAGGTTTCTTTTCTGAAGTTAAATTACACGATACATTACTACTACTATTACTAGTAGTAGTAGCAGCAGAAGTAGTGGTGGTAGTAGTAGTACCAGGTTGTGTTGGTGGTCGAAAAGGTTTAGCTCGATATGTTCCACCGAATACACGACTCCATGTTTTCCCATCTAATCGAGCACAAGCTAATCGATATAATGTGAATGTATCACGAGTATGCAATGCATAAACTAATAAACCGAAATAGGATGCAGCTAAAACTTGGGCTAATAGACCAATAATTCGACGACGATCCACAGACTGAATACGTGTTACAGATGACGATGATGAATCACGATCTAACAGATTNTGCGTTGATGTAATACGAATAATTTGACTAGTACTTACACTATTACTCTGTATTN]


>consensus_4528#0 AATCATCTTTCCTTTCACTTAGGACGGCATTTTTAACTTCATCATCATTACTGTCATCAT CTCANNCATCCAATGGTTCAGTAAGATTTATGTCAGCATCATCGCCATCACTGTGGTCAT GAGTACCATCGGTATGTTTTATAAACTGTCCAGTTAAACGATAATGTAACGAATTTTTTA CATGGTGTCGTACAGTTTTACGTTGTTTCAAATTAGAACAATGTTTGATAAAGCGTTGTA CTCGATTAATATGACGTTGTTGTTTTAATAAAGCTCCATGATATGTATCGTATTCATTGT TGGAAGATGGTTCACTGGCATCGGAATCGAAAATCTCACTGGGATCATCAACTAAATCAG TTTGTTTTGGAGGACGTTCCAGAAGACAAGACAGAATAGAAGATTGAGCAAATATAAACC ATTCCTCTGGACTGATAGATGACTGAGATACTGTTGTTGTTTTTGTGGTAGTGGTGGCAG GGGCTTGCTCTGAAACTTTATTCTTTACACCATCCAACCTGGTTGTGTTGGATTCTAAGT CTGCTATCGCTGCAGCTTCAGCATGTGCTAAAAAACGTATATGTTGACTGGTTAACTTTG TGGGATTTGGTGGACTGCCAATTTTCATTGCAACTTCGATAGCTGCAACTGCATGGTTCC TAGCTCGTGTAACTGCTTTCAATGGACTTCTTGACTTTGATCTGTCATGTTTAGGAGTAG ATGTTGGTCGTTTAGGTCGACTCGGTGGAACAGGTTTCTTTTCTGAAGTTAAATTACACG ATACATTACTACTACTATTACTAGTAGTAGTAGCAGCAGAAGTAGTGGTGGTAGTAGTAG TACCAGGTTGTGTTGGTGGTCGAAAAGGTTTAGCTCGATATGTTCCACCGAATACACGAC TCCATGTTTTCCCATCTAATCGAGCACAAGCTAATCGATATAATGTGAATGTATCACGAG TATGCAATGCATAAACTAATAAACCGAAATAGGATGCAGCTAAAACTTGGGCTAATAGAC CAATAATTCGACGACGATCCACAGACTGAATACGTGTTACAGATGACGATGATGAATCAC GATCTAACAGATTNTGCGTTGATGTAATACGAATAATTTGACTAGTACTTACACTATTAC TCTGTATTN



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)