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Schistosoma mansoni
cluster # 4598 cluster # 4598       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4598#0 length = 1176 sequences # 3  

consensusID : consensus_4598#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1176
fasta sequence
                              [CCCGAGCCAATATTCGGCACGAGGTGGAGATGTCCGAATTCATATTGTGAAGAACATGCTAATCATAATTGTATACAAGTTGATAGCTTAGATAGTGATCGCTGGAAATTGGCTAAATCCAGTCTGAATGAAGTCACCAATCCCTCCATAGTATTCAGTGTTCGATGGATATGTTCAGATCATGTCGGTTTAAAAATATATGGACCGGATTACCGACCTGTACTGTGCTCTGACTCAAATATTCCCACTAAAAAAGTTGCTGCCAGTAAAAATTCAGATAAATTGTCTACTGAAGTTAAACAAAATGGTGGAGAGAGCAATCTAGTACCCTGTTTCATCAACGAAGAAGAGAAAGAAGTTGAAAATATAATTCCAAAGACACCTAATGTCAGAGATTCGAAAATTACCTTAATAAATGATGACACTACCGCTTCTACTCTTGTCACTACCACTACATCCACAACAGTTATCAACTCTAATGGCGATAGTAACCAAAAACTAGAACCCAGACGCTTAGAGCCTCTTAAAGTGACGCTAAAGCGCANACTTAAAGCTGAATTAGCAGCCAAAGAAAATAATTCAGTGTCCGTTCTAAATGATGAAAANCATGTANCCAAGC-ATTTAATGGATACTATTTCTAAATATACTAATTATAGCAATGCTGTGACAACCACTTTGAGTGGCAACAATCATGTTGGTAATCGTAAACGCTTATCAATTACCAGTCCTTTGATAGATAAGAAAAGAACTCGTCTGTCAAGAGATAATACTTCAAAATAGAACAATTGCATTTTTCCTTATGGTAACTTATTTCCTGGAGGTTATTGTAACTTTTTTTGGGAAACAGTACAGTTTACTCCTATTTTAACTAACATTGTTTATATGGCACCAGTTACCGATATTACTGTCAATATTATTGTTATTATCGTTGTTACTACCCGGGGTATATAGATCCTGTAGGCTCGATTTGTTTTTCCTATTTTAAGCTTACCTTACCTCTTATACGCCCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGCCACTGTGTACAAACCAGCAAAATATTATATTGTTATAAGTACAATATGTTTATGTTCAGATTTTATTATTCCGTACTATTATTTCTCTTTTACAGAGTAAGCATTTTATCTTTTTAATAAAGA]

[+] EMBL CD082770             [CCCGAGCCAATATTCGGCACGAGGTGGAGATGTCCGAATTCATATTGTGAAGAACATGCTAATCATAATTGTATACAAGTTGATAGCTTAGATAGTGATCGCTGGAAATTGGCTAAATCCAGTCTGAATGAAGTCACCAATCCCTCCATAGTATTCAGTGTTCGATGGATATGTTCAGATCATGTCGGTTTAAAAATATATGGACCGGATTACCGACCTGTACTGTGCTCTGACTCAAATATTCCCACTAAAAAAGTTGCTGCCAGTAAAAATTCAGATAAATTGTCTACTGAAGTTAAACAAAATGGTGGAGAGAGCAATCTAGTACCCTGTTTCATCAACGAAGAAGAGAAAGAAGTTGAAAATATAATTCCAAAGACACCTAATGTCAGAGATTCGAAAATTACCTTAATAAATGATGACACTACCGCTTCTACTCTTGTCACTACCACTACATCCACAACAGTTATCAACTCTAATGGCGATAGTAACCAAAAACTAGAACCCAGACGCTTAGAGCCTCTTAAAGTGACGCTAAAGCGCANACTTAAAGCTGAATTAGCAGCCAAAGAAAATAATTCAGTGTCCGTTCTAAATGATGAAAANCATGTANCCAAGC ATTTAATGGATACTATTTCTAAATATACTAATTATAGCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD068222             [                                                                                                                                                                                    CATGTCGGTTTAAAAATATATGGACCGGATTACCGACCTGTACTGTGCTCTGACTCAAATATTCCCACTGAAAAAGTGGCTGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD076361             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CAAAGAAAATAATTCAGTGTCCGTTCTAAATGATGAAAACAATGTA CCAAGCAATTTAATGGATACTATTTCTAATAATACTAATTATAGCAATGCTGTGACAACCACTTTGAGTGGCAACAATCATGTTGGTAATCGTAAACGCTTATCAATTACCAGTCCTTTGATAGATAAGAAAAGAACTCGTCTGTCAAGAGATAATACTTCAAAATAGAACAATTGCATTTTTCCTTATGGTAACTTATTTCCTGGAGGTTATTGTAACTTTTTTTGGGAAACAGTACAGTTTACTCCTATTTTAACTAACATTGTTTATATGGCACCAGTTACCGATATTACTGTCAATATTATTGTTATTATCGTTGTTACTACCCGGGGTATATAGATCCTGTAGGCTCGATTTGTTTTTCCTATTTTAAGCTTACCTTACCTCTTATACGCCCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGCCACTGTGTACAAACCAGCAAAATATTATATTGTTATAAGTACAATATGTTTATGTTCAGATTTTATTATTCCGTACTATTATTTCTCTTTTACAGAGTAAGCATTTTATCTTTTTAATAAAGA]


>consensus_4598#0 CCCGAGCCAATATTCGGCACGAGGTGGAGATGTCCGAATTCATATTGTGAAGAACATGCT AATCATAATTGTATACAAGTTGATAGCTTAGATAGTGATCGCTGGAAATTGGCTAAATCC AGTCTGAATGAAGTCACCAATCCCTCCATAGTATTCAGTGTTCGATGGATATGTTCAGAT CATGTCGGTTTAAAAATATATGGACCGGATTACCGACCTGTACTGTGCTCTGACTCAAAT ATTCCCACTAAAAAAGTTGCTGCCAGTAAAAATTCAGATAAATTGTCTACTGAAGTTAAA CAAAATGGTGGAGAGAGCAATCTAGTACCCTGTTTCATCAACGAAGAAGAGAAAGAAGTT GAAAATATAATTCCAAAGACACCTAATGTCAGAGATTCGAAAATTACCTTAATAAATGAT GACACTACCGCTTCTACTCTTGTCACTACCACTACATCCACAACAGTTATCAACTCTAAT GGCGATAGTAACCAAAAACTAGAACCCAGACGCTTAGAGCCTCTTAAAGTGACGCTAAAG CGCANACTTAAAGCTGAATTAGCAGCCAAAGAAAATAATTCAGTGTCCGTTCTAAATGAT GAAAANCATGTANCCAAGCATTTAATGGATACTATTTCTAAATATACTAATTATAGCAAT GCTGTGACAACCACTTTGAGTGGCAACAATCATGTTGGTAATCGTAAACGCTTATCAATT ACCAGTCCTTTGATAGATAAGAAAAGAACTCGTCTGTCAAGAGATAATACTTCAAAATAG AACAATTGCATTTTTCCTTATGGTAACTTATTTCCTGGAGGTTATTGTAACTTTTTTTGG GAAACAGTACAGTTTACTCCTATTTTAACTAACATTGTTTATATGGCACCAGTTACCGAT ATTACTGTCAATATTATTGTTATTATCGTTGTTACTACCCGGGGTATATAGATCCTGTAG GCTCGATTTGTTTTTCCTATTTTAAGCTTACCTTACCTCTTATACGCCCATATATATATA TATATATATATATATATATATATATATATATGCCACTGTGTACAAACCAGCAAAATATTA TATTGTTATAAGTACAATATGTTTATGTTCAGATTTTATTATTCCGTACTATTATTTCTC TTTTACAGAGTAAGCATTTTATCTTTTTAATAAAGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)