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Schistosoma mansoni
cluster # 4641 cluster # 4641       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4641#0 length = 1007 sequences # 3  

consensusID : consensus_4641#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1007
fasta sequence
                              [GGATTCGGAGAATTTCTTGGTTACGGATGCTTATTTAGGTGTATTATCTGTTTCGGTAAAAGATGGTAGTGTGAAGAAATTGTTCCCTTTAGATGAAAATTTCAAAGTTACATTTTTTGATGATTCCGTAATTTTACCAAATGGTAGTCTCATTATTACTGAAGCTAGTACAAAAAATACATTACAACATTTATGGACAACAATTTTAGAGGGATTACCTAGTGGAAGGCTAACAATGGTTGATACACGAACTGGTCAATACAGTCACATAATGGATGGTTTACGCTTTCCCAATGGAATCGAACTTTGTAATGACGGCAAATCCATATTAGTCGTTGAAACAATGAAACTTCGAGTTTTACGAATTCCATTGGACGGAGGTGAAGTGACTGTGTTTAGTGATGGACTACCTGGTTATCCGGATAATATCAAAGCTAGTCCACGTGGTGGTTACTGGGTTCCTGTATCAAATCTTCGTGATGAGCCTCTATCTGTACTTCTACTCAACCATCTACCAGCTTATCCACGTATTCGTCAATTAGCTTCTAGTATTATCTCCATGCTTCCATTCAAACCAACACCAAAAGGAAAATCATCAATGTTAATTCGTTTAGATGAAAAT-GGACAGATAATTGAAATTTGGAAAGATTTACAAAATGAATTACCGAATGCTTGTGAAGTACTAGAACATGATGATATTTTATACACTGGAAGCTTCTATTTACCTTACATTGGTCGTTTAAAAAGATTATCAAATTAATTTTCATAAAATTTCGAAATTCTTAAATTCCAAAGATGAATACCGTGTAATTTGATGAACATAATTAATTTGTTGTTCTTCATTCAATACGTTGACCTATCTTTAAAACATACATCACTATCTTGATTTCTTATTTTCGTTGTTGTTGGTAGTTTGACTTAGTTGCTTTTTTTAATATTTAGTTATTCTGTACAAATTTTGTAATGTGTAAATTAGTTAATCAATAATAAATGACACAATACCACTT]

[+] EMBL CD081374             [GGATTCGGAGAATTTCTTGGTTACGGATGCTTATTTAGGTGTATTATCTGTTTCGGTAAAAGATGGTAGTGTGAAGAAATTGTTCCCTTTAGATGAAAATTTCAAAGTTACATTTTTTGATGATTCCGTAATTTTACCAAATGGTAGTCTCATTATTACTGAAGCTAGTACAAAAAATACATTACAACATTTATGGACAACAATTTTAGAGGGATTACCTAGTGGAAGGCTAACAATGGTTGATACACGAACTGGTCAATACAGTCACATAATGGATGGTTTACGCTTTCCCAATGGAATCGAACTTTGTAATGACGGCAAATCCATATTAGTCGTTGAAACAATGAAACTTCGAGTTTTACGAATTCCATTGGACGGAGGTGAAGTGACTGTGTTTAGTGATGGACTACCTGGTTATCCGGATAATATCAAAGCTAGTCCACGTGGTGGTTACTGGGTTCCTGTATCAAATCTTCGTGATGAGCCTCTATCTGTACTTCTACTCAACCATCTACCAGCTTATCCACGTATTCGTCAATTAGCTTCTAGTATTATCTCCATGCTTNCATTCAAACCAACACCAAAAGGAAAATCATCAATGTTAATTCGTTTAGATGAAAATGGGACAGAT ATTGAAATTTGGAAAGATTTAC AAATGAATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD075208             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCCA TGGACGGAGGTGAAGTGACTGTGTTTAGTGATGGACTACCTGGTTATCCGGATAATATCAAAGCTAGTCCACGTGGTGGTTACTGGGTTCCTGTATCAAATCTTCGTGATGAGCCTCTATCTGTACTTCTACTCAACCATCTACCAGCTTATCCACGTATTCGTCAATTAGCTTCTAGTATTATCTCCATGCTTCCATTCAAACCAACACCAAAAGGAAAATCATCAATGTTAATTCGTTTAGATGAAAAT GGACAGATAATTGAAATTTGGAAAGATTTACAAAATGAATTACCGAATGCTTGTGAAGTACTAGAACATGATGATATTTTATACACTGGAAGCTTCTATTTACCTTACATTGGTCGTTTAAAAAGATTATCAAATTAATTTTCATAAAATTTCGAAATTCTTAAATTCCAAAGATGAATACCGTGTAATTTGATGAACATAATTAATTTGTTGTTCTTCATTCAATACGTTGACCTATCTTTAAAACATACATCACTATCTTGATTTCTTATTTTCGTTGTTGTTGGTAGTTTGACTTAGTTGCTTTTTTTAATATTTAGTTATTCTGTACAAATTTTGTAATGTGTAAATTAGTTAATCAATAATAAATGACACAATACCACTT]
[+] EMBL AW146487             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGCTTCCATTCAAACCAACACCAAAAGGAAAATCATCAATGTTAATTCGTTTAGATGAAAAT GGACAGATAATTGAAATTTGGAAAGATTTACAAAATGAATTACCGAATGCTTGTGAAGTACTAGAACATGATGATATTTTATACACTGGGAGCTTCTATTTACCTTACATTGGTCGTTTAAAAAGATTATCAAATTAATTTTCATAAAATTTCGAAATTCTT AATTCCAAAGATGAATACGGTGTAATTTGATGAACATAATTAATTTG TGGTCTTCAT                                                                                                                                                                    ]


>consensus_4641#0 GGATTCGGAGAATTTCTTGGTTACGGATGCTTATTTAGGTGTATTATCTGTTTCGGTAAA AGATGGTAGTGTGAAGAAATTGTTCCCTTTAGATGAAAATTTCAAAGTTACATTTTTTGA TGATTCCGTAATTTTACCAAATGGTAGTCTCATTATTACTGAAGCTAGTACAAAAAATAC ATTACAACATTTATGGACAACAATTTTAGAGGGATTACCTAGTGGAAGGCTAACAATGGT TGATACACGAACTGGTCAATACAGTCACATAATGGATGGTTTACGCTTTCCCAATGGAAT CGAACTTTGTAATGACGGCAAATCCATATTAGTCGTTGAAACAATGAAACTTCGAGTTTT ACGAATTCCATTGGACGGAGGTGAAGTGACTGTGTTTAGTGATGGACTACCTGGTTATCC GGATAATATCAAAGCTAGTCCACGTGGTGGTTACTGGGTTCCTGTATCAAATCTTCGTGA TGAGCCTCTATCTGTACTTCTACTCAACCATCTACCAGCTTATCCACGTATTCGTCAATT AGCTTCTAGTATTATCTCCATGCTTCCATTCAAACCAACACCAAAAGGAAAATCATCAAT GTTAATTCGTTTAGATGAAAATGGACAGATAATTGAAATTTGGAAAGATTTACAAAATGA ATTACCGAATGCTTGTGAAGTACTAGAACATGATGATATTTTATACACTGGAAGCTTCTA TTTACCTTACATTGGTCGTTTAAAAAGATTATCAAATTAATTTTCATAAAATTTCGAAAT TCTTAAATTCCAAAGATGAATACCGTGTAATTTGATGAACATAATTAATTTGTTGTTCTT CATTCAATACGTTGACCTATCTTTAAAACATACATCACTATCTTGATTTCTTATTTTCGT TGTTGTTGGTAGTTTGACTTAGTTGCTTTTTTTAATATTTAGTTATTCTGTACAAATTTT GTAATGTGTAAATTAGTTAATCAATAATAAATGACACAATACCACTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)