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Schistosoma mansoni
cluster # 4651 cluster # 4651       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4651#0 length = 534 sequences # 3  

consensusID : consensus_4651#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 534
fasta sequence
                              [TAACAATTATATGAGCGTGTTAATGGTCAGCAAAAAATGTTCAAACAAAGCTTACAAAGATGTGATTGTTGATTACTCTCTTGTGGTTAGAAATAGTTTTTTGTCATCGGTAGTGTAACTGCTATTTTATACTTGAGAGAATATGCAATACACTTTAGGAGTGCAAACCACTTTTAGTGGTGTTACTATAGTTTCCACACAAAAAATACAATATGTGATAAATGCTACGATATCTAGCTTTGTATAGATGTAATTNTAATGACCTATATTAGGAAAAATTAGTGGTCGAATAGATGTTACTTAACTCAGCCAAAAGTCATCTAAGTATCAAGCAATAAGATGTAAACGAGACAATACATCTATTTGCTTTGCCACCTACAGTTCCATTTTTTAAAAAAATGATTATGATAATTTATTCAAATTCAAATTAAATAGATATTTGTTGAATATATACAACTGCAAGTTGTTTTGTGAGTAAAAACGATTTCAACAAAAGTCAATCACAATAAACATTCATACCACTGAAATTATAGA]

[+] EMBL CD117977             [TAACAATTATATGAGCGTGTTAATGGTCAGCAAAAAATGTTCAAACAAAGCTTACAAAGATGTGATTGTTGATTACTCTCTTGTGGTTAGAAATAGTTTTTTGTCATCGGTAGTGTAACTGCTATTTTATACTTGAGAGAATATGCAATACACTTTAGGAGTGCAAACCACTTTTAGTGGTGTTACTATAGTTTCCACACAAAAAATACAATATGTGATAAATGCTACGATATCTAGCTTTGTATAGATGTAATTTTAATGACCTATATTAGGAAAAATTAGTGGTCGAATAGATGTTACTTAACTCAGCCAAAAGTCATCTAAGTATCAAGCAATAAGATGTAAACGAGACAATACATCTATTTGCTTTGCCACCTACAGTTCCATTTTTTAAAAAAATGATTATGATAATTTATTCAAATTCAAATTAAATAGATATTTGTTGAATATATACAACTGCAAGTTGTTTTGTGAGTAAAAACGATTTCAACAAAAGTCAATCACAATAAACATTCATACCACTGAAATTATAGA]
[+] EMBL CD118185             [TAACAATTATATGAGCGTGTTAATGGTCAGCAAAAAATGTTCAAACAAAGCTTACAAAGATGTGATTGTTGATTACTCTCTTGTGGTTAGAAATAGTTTTTTGTCATCGGTAGTGTAACTGCTATTTTATACTTGAGAGAATATGCAATACACTTTAGGAGTGCAAACCACTTTTAGTGGTGTTACTATAGTTTCCACACAAAAAATACAATATGTGATAAATGCTACGATATCTAGCTTTGTATAGATGTAATTNTAATGAC                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD118189             [                                                                                                                                                                                   GTGTTACTATAGTTTCCACACAAAAAATACAATATGTGATAAATGCTACGATATCTAGCTTTGTATAGATGTAATTNTAATGACCTATATTAGGAAAAATTAGTGGTCGAATAGATGTTACTTAACTCAGCCAAAAGTCATCTAAGTATCAAGCAATAAGATGTAAACGAGACAATACATCTATTTGCTTTGCCACCTACAGTTCCATTNTTTAAAAAAATGATTATGATAATTTATTCAAATTC                                                                                                              ]


>consensus_4651#0 TAACAATTATATGAGCGTGTTAATGGTCAGCAAAAAATGTTCAAACAAAGCTTACAAAGA TGTGATTGTTGATTACTCTCTTGTGGTTAGAAATAGTTTTTTGTCATCGGTAGTGTAACT GCTATTTTATACTTGAGAGAATATGCAATACACTTTAGGAGTGCAAACCACTTTTAGTGG TGTTACTATAGTTTCCACACAAAAAATACAATATGTGATAAATGCTACGATATCTAGCTT TGTATAGATGTAATTNTAATGACCTATATTAGGAAAAATTAGTGGTCGAATAGATGTTAC TTAACTCAGCCAAAAGTCATCTAAGTATCAAGCAATAAGATGTAAACGAGACAATACATC TATTTGCTTTGCCACCTACAGTTCCATTTTTTAAAAAAATGATTATGATAATTTATTCAA ATTCAAATTAAATAGATATTTGTTGAATATATACAACTGCAAGTTGTTTTGTGAGTAAAA ACGATTTCAACAAAAGTCAATCACAATAAACATTCATACCACTGAAATTATAGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)