cluster # 47

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 47 cluster # 47 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_47#0 length = 800 sequences # 2

consensusID : consensus_47#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 800
fasta sequence

                              [TTTATGCTCTGCAGTTAACAGTGATAATTCACAACTGGAATGACGTTTACGACTTCGACGTATTACACGATGAGGTTTATTATCGTATTCATGCTTACAAGTAGTAGTGGACGTAGTTGCTGTTGTTTTTGTCATATTCACTGAAGTGGAAGGATTAATCTCAAGCTGTGGAGAAGGACTAGATGCACAGTATAAAGATGAATAACATGAAGATTCTAGACATATATTCTTTTTTTTCCTCGTCTTCTTTTTCTTCATTTTCGTCATCTTCAAAATTCTCACTATCATCATGGGATGGATAATTTTCAAAGATTATTGATTTCTTATTTGATGAATTTGGTGATGTTATAACAGGTGTTAGTAAAGCAGTTGGTAGACAACATCCATCATATTCATTTGTAGCAAATTTAGTCAATTCATCCATAACTGTTAAAGGATTCGNTGGTATATTATCATTATTATTATTATTTTTATCAGATATTGTTTGAATTCTATGTAATTTTTTAAATTTATGCATAGTATTTGGTAATTGTAACTGTCTTATNTCATGCTGTACATAATGTTCAGCTAATTTAGTAGAATCCGAACTAGTATAATCACAAAATAAACATTGATGTTTAATTGAACTTAAATAATGATAATTATGCAATTTTTGTGAGTAATGTAATGAATTATGTTTTGATTTTGTGAATGTTTCACATAAAGATGTTGATGGTAGAGGTGTTGCTGGAGCAGCGGTAGGGATGATGGTACTTGCTGATATTGTACCAGTTGTAGATAGGGTTGATGGTGACAATGCT]

[+] EMBL CD136960             [TTTATGCTCTGCAGTTAACAGTGATAATTCACAACTGGAATGACGTTTACGACTTCGACGTATTACACGATGAGGTTTATTATCGTATTCATGCTTACAAGTAGTAGTGGACGTAGTTGCTGTTGTTTTTGTCATATTCACTGAAGTGGAAGGATTAATCTCAAGCTGTGGAGAAGGACTAGATGCACAGTATAAAGATGAATAACATGAAGATTCTAGACATATATTCTTTTTTTTCCTCGTCTTCTTTTTCTTCATTTTCGTCATCTTCAAAATTCTCACTATCATCATGGGATGGATAATTTTCAAAGATTATTGATTTCTTATTTGATGAATTTGGTGATGTTATAACAGGTGTTAGTAAAGCAGTTGGTAGACAACATCCATCATATTCATTTGTAGCAAATTTAGTCAATTCATCCATAACTGTTAAAGGATTCGNTGGTATATTATCATTATTATTATTATTTTTATCAGATATTGTTTGAATTCTATGTAATTTTTTAAATTTATGCATAGTATTTGGTAATTGTAACTGTCTTATNTCATGCTGTACATAATGTTCAGCTA                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD195099             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CATCATATTCATTTGTAGCAAATTTAGTCAATTCATCCATAACTGTTAAAGGATTCGTTGATATATTATCATTATTATTATTATTTTTATCAGATATTGTTTGAATTCTATGTAATTTTTTAAATTTATGCATAGTATTTGGTAATTGTAACTGTCTTATTCCATGCTGTACATAATGTTCAGCTAATTTAGTAGAATCCGAACTAGTATAATCACAAAATAAACATTGATGTTTAATTGAACTTAAATAATGATAATTATGCAATTTTTGTGAGTAATGTAATGAATTATGTTTTGATTTTGTGAATGTTTCACATAAAGATGTTGATGGTAGAGGTGTTGCTGGAGCAGCGGTAGGGATGATGGTACTTGCTGATATTGTACCAGTTGTAGATAGGGTTGATGGTGACAATGCT]




>consensus_47#0
TTTATGCTCTGCAGTTAACAGTGATAATTCACAACTGGAATGACGTTTACGACTTCGACG
TATTACACGATGAGGTTTATTATCGTATTCATGCTTACAAGTAGTAGTGGACGTAGTTGC
TGTTGTTTTTGTCATATTCACTGAAGTGGAAGGATTAATCTCAAGCTGTGGAGAAGGACT
AGATGCACAGTATAAAGATGAATAACATGAAGATTCTAGACATATATTCTTTTTTTTCCT
CGTCTTCTTTTTCTTCATTTTCGTCATCTTCAAAATTCTCACTATCATCATGGGATGGAT
AATTTTCAAAGATTATTGATTTCTTATTTGATGAATTTGGTGATGTTATAACAGGTGTTA
GTAAAGCAGTTGGTAGACAACATCCATCATATTCATTTGTAGCAAATTTAGTCAATTCAT
CCATAACTGTTAAAGGATTCGNTGGTATATTATCATTATTATTATTATTTTTATCAGATA
TTGTTTGAATTCTATGTAATTTTTTAAATTTATGCATAGTATTTGGTAATTGTAACTGTC
TTATNTCATGCTGTACATAATGTTCAGCTAATTTAGTAGAATCCGAACTAGTATAATCAC
AAAATAAACATTGATGTTTAATTGAACTTAAATAATGATAATTATGCAATTTTTGTGAGT
AATGTAATGAATTATGTTTTGATTTTGTGAATGTTTCACATAAAGATGTTGATGGTAGAG
GTGTTGCTGGAGCAGCGGTAGGGATGATGGTACTTGCTGATATTGTACCAGTTGTAGATA
GGGTTGATGGTGACAATGCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case