cluster # 4712

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Schistosoma mansoni
cluster # 4712 cluster # 4712 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4712#0 length = 500 sequences # 3

consensusID : consensus_4712#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 500
fasta sequence

                              [AATCTATTGCTGCCATGTGCGTGTAATCGTAACTTAACTACTTAGCAGACATGTGACATAATTCAGACTTGTCCCAAATTTTTGAATACAAACAAGGTTGTGTGTGTTCTGCGCTGAAACACATTGATCCGTATCAGTTTGCTTATAAATTCGGAAAAGCACCTTAGATGCTGTTGTTGTTGTGCATCATAATATAGTGTTCAGCTTAAAAAAGAGTTGGATGCTCTTTCCAGGATTAAACCTCTGCCTTTGACTGTATTCTAAGACAACTATTTAACAAGTTTACCAACGTCAACACTAACAGTTGAACAACCAACTGCCTATATTCCTATCTCTCTGGACGAGAACAGTACACTATGTTCGGAGGGAAGTGTTGGATTTCCCCACTGCCTCATGGTGTGCTGCAAGGAGCTGTTCTTTTCTCTCTTTTTCTACCTGATCTGCCATCCACAGGAAACACGTTTGTTAAAAATGTGGACGATCTCACAATATGTATGCGG]

[-] EMBL CD114485             [AATCTATTGCTGCCATGTGCGTGTAATCGTAACTTAACTACTTAGCAGACATGTGACATAATTCAGACTTGTCCCAAATTTTTGAATACAAACAAGGTTGTGTGTGTTCTGCGCTGAAACACATTGATCCGTATCAGTTTGCTTATAAATTCGGAAAAGCACCTTAGATGCTGTTGTTGTTGTGCATCATAATATAGTGTTCAGCTTAAAAAAGAGTTGGATGCTCTTTCCAGGATTAAACCTCTGCCTTTGACTGTATTCTAAGACAACTATTTAACAAGTTTACCAACGTCAACACTAACAGTTGAACAACCAACTGCCTATATTCCTATCTCTCTGGACGAGAACAGTACACTATGTTCGGAGGGAAGTGTTGGATTTTCCCACTGCCTCATGGTGTGCTGCAAGGAGCTGTTCTTTTCT                                                                             ]
[+] EMBL CD179041             [                                                          tgATTCAGACTTGTCCCAAATTTTTGAATACAAACAAGGTTGTGTGTGTTCTGCGCTGAAACACATTGATCCGTATCAGTTTGCTTATAAATTCGGAAAAGCACCTTAGATGCTGTTGTTGTTGTGCATCATAATATAGTGTTCAGCTTAAAAAAGAGTTGGATGCTCTTTCCAGGATTAAACCTCTGCCTTTGACTGTATTCTAAGACAACTATTTAACAAGTTTACCAACGTCAACACTAACAGTTGAACAACCAACTGCCTATATTCCTATCTCTCTGGACGAGAACAGTACACTATGTTCGGAGGGAAGTGTTGGATTTCCCCACTGCCTCATGGTGTGCTGCAAGGAGCTGTTCTTTTCTCTCTTTTTCTACCTGATCTGCCATCCACAGGAAACACGTTTGTTAAAAATGTGGACGATCTCACAATATGTATGCGG]
[-] EMBL CD092080             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTAACAGTTGAACAACCAACTGCCTATATTCCTATCTCTCTGGACGAGAACAGTACACTATGTTCGGAGGGAAGTGTTGGATTTCCCCACTGCCTCA                                                                                                          ]




>consensus_4712#0
AATCTATTGCTGCCATGTGCGTGTAATCGTAACTTAACTACTTAGCAGACATGTGACATA
ATTCAGACTTGTCCCAAATTTTTGAATACAAACAAGGTTGTGTGTGTTCTGCGCTGAAAC
ACATTGATCCGTATCAGTTTGCTTATAAATTCGGAAAAGCACCTTAGATGCTGTTGTTGT
TGTGCATCATAATATAGTGTTCAGCTTAAAAAAGAGTTGGATGCTCTTTCCAGGATTAAA
CCTCTGCCTTTGACTGTATTCTAAGACAACTATTTAACAAGTTTACCAACGTCAACACTA
ACAGTTGAACAACCAACTGCCTATATTCCTATCTCTCTGGACGAGAACAGTACACTATGT
TCGGAGGGAAGTGTTGGATTTCCCCACTGCCTCATGGTGTGCTGCAAGGAGCTGTTCTTT
TCTCTCTTTTTCTACCTGATCTGCCATCCACAGGAAACACGTTTGTTAAAAATGTGGACG
ATCTCACAATATGTATGCGG

clustalw multiple alignements is not computed in this case