cluster # 4728

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Schistosoma mansoni
cluster # 4728 cluster # 4728 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4728#0 length = 673 sequences # 3

consensusID : consensus_4728#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 673
fasta sequence

                              [TTTGAACATTATACAATAAAACAAGGAAAAAAATAACAACCGAAAAACAAAAGAGAACAATGCATGAAGTCTTTGATTACTTTTATTAAATAAACAATAGGGATACTACCCGTCTAACTTTGATTGATTGAAATATGTTTCAACATTATTATTACTATTGTTCATTGTTAATGATTCAATAAATTGTCATTTAAATGTATAGTCATTTTGTATACAATTTATTTGACAGAATGATCGTAATTATCAGAACAACAAAAAAAAACATGTTTATCTACACACTTAATCTATTGATTCTCATTATAATTATTACACTTATCAAGTGCCTTCTATTTGTAACCAATTTACTTAAATAAATATTAGCAGATTAATACATAGACATATATATACATCACATAAATCGATCAAATCAATACACACTTCAATCAATTGATTATTGTTTTTCTATATAATCAATCATATATATAGGAAAAAATTAA-T-AATAATTATGATTGTC-ATAAAATCAATAATTCTATTAAACATGTTTATGAAAGTGAGATAAAAATTATGAAACTTTTTAAAACATAATNACANTGATGAATNTNATTTTGTTGTTAAATTTTTAATAAAAAATATTGACCAGTTAAATAAATTGCCATGGTACTATTATGATTATTATTTTCAAAGTCACAGATCT]

[+] EMBL CD131737             [TTTGAACATTATACAATAAAACAAGGAAAAAAATAACAACCGAAAAACAAAAGAGAACAATGCATGAAGTCTTTGATTACTTTTATTAAATAAACAATAGGGATACTACCCGTCTAACTTTGATTGATTGAAATATGTTTCAACATTATTATTACTATTGTTCATTGTTAATGATTCAATAAATTGTCATTTAAATGTATAGTCATTTTGTATACAATTTATTTGACAGAATGATCGTAATTATCAGAACAACAAAAAAAAACATGTTTATCTACACACTTAATCTATTGATTCTCATTATAATTATTACACTTATCAAGTGCCTTCTATTTGTAACCAATTTACTTAAATAAATATTAGCAGATTAATACATAGACATATATATACATCACATAAATCGATCAAATCAATACACACTTCAATCAATTGATTATTGTTTTTCTATATAATCAATCATATATATAGGAAAAAATTAA T AATAATTATGATTGTC ATAAAATCAATAATTCTATTAAACATGTTTATGAAAGTGAGATAAAAATTATGAAACTTTTTAAAACATAATNACANTGATGAATNTNATTTTGTTGTTAAATTTTTAATAAAAAATATTGACCAGTTAAATAAATTGCCATGGTACTATTATGATTATTATTTTCAAAGTCACAGATCT]
[+] EMBL CD131461             [TTTGAACATTATACAATAAAACAAGGAAAAAAATAACAACCGAAAAACAAAAGAGAACAATGCATGAAGTCTTTGATTACTTTTATTAAATAAACAATAGGGATACTACCCGTCTAACTTTGATTGATTGAAATATGTTTCAACATTATTATTACTATTGTTCATTGTTAATGATTCAATAAATTGTCATTTAAATGTATAGTCATTTTGTATACAATTTATTTGACAGAATGATCGTAATTATCAGAACAACAAAAAAAAACATGTTTATCTACACACTTAATCTATTGATTCTCATTATAATTATTACACTTATCAAGTGCCTTCTATTTGTAACCAATTTACTTAAATAAATATTAGCAGATTAATACATAGACATATATATACATCACATAAATCGATCAAATCAATACACACTTCAATCAATTGATTATTGTTTTTCTATATAATCAATCATATATATAGGAAAAAATTAA T AATAATTATGATTGTC ATAAAATCAATAATTCTATTAAACATGTn                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AI390064             [                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATTGATTCTCATTATAATTATTACACTTATCAAGTGCCTTCTATTTGTAACCAATTTACTTAAATAAATATTAGCAGATTAATACATAGACATATATATACATCACATAAATCGATCAAATCAATACACACTTCAATCAATTGATTATTGTTTTTCTATATAATCAATCATATATATAGGAAAAAATTAAGTGAATAATTATGATCGTCGATAAAATCAATAATTCTATTAAACATG                                                                                                                                                         ]




>consensus_4728#0
TTTGAACATTATACAATAAAACAAGGAAAAAAATAACAACCGAAAAACAAAAGAGAACAA
TGCATGAAGTCTTTGATTACTTTTATTAAATAAACAATAGGGATACTACCCGTCTAACTT
TGATTGATTGAAATATGTTTCAACATTATTATTACTATTGTTCATTGTTAATGATTCAAT
AAATTGTCATTTAAATGTATAGTCATTTTGTATACAATTTATTTGACAGAATGATCGTAA
TTATCAGAACAACAAAAAAAAACATGTTTATCTACACACTTAATCTATTGATTCTCATTA
TAATTATTACACTTATCAAGTGCCTTCTATTTGTAACCAATTTACTTAAATAAATATTAG
CAGATTAATACATAGACATATATATACATCACATAAATCGATCAAATCAATACACACTTC
AATCAATTGATTATTGTTTTTCTATATAATCAATCATATATATAGGAAAAAATTAATAAT
AATTATGATTGTCATAAAATCAATAATTCTATTAAACATGTTTATGAAAGTGAGATAAAA
ATTATGAAACTTTTTAAAACATAATNACANTGATGAATNTNATTTTGTTGTTAAATTTTT
AATAAAAAATATTGACCAGTTAAATAAATTGCCATGGTACTATTATGATTATTATTTTCA
AAGTCACAGATCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case