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Schistosoma mansoni
cluster # 4748 cluster # 4748       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4748#0 length = 581 sequences # 3  

consensusID : consensus_4748#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 581
fasta sequence
                              [ATGATCATAGTAACCGATTATTAGGATTTTTTTAGTGAAATGGCTTGAAAGCGTTCACAATGATACAATGGCATCTACTCTTAATCTTTCTTTAGTCTCAAAGTCCCAAAATCTCGTTTCTTTCGTTTTACACCTAATATTTTCTACTAATACTGACACTGTTACTGCTTCTACTACCATGGAAGTTCTTCTTAATAATTTTATCCCTGTGCTAATTAAATGTCGCAGCTTCAGCCGATGCACATATGTGAGTTTCTACGCTGCTGATAACTAATAAGTAACTTATGATCGACAGCCGGGAAGTAATAGCTACCTTTGACACCACCCGAAATCACCTTTCCCACAATTAAATCTCCGTTATTTCGCAGCATCTCTCCTGTGCCCGTAATTAACCCACAAGTATTTGCGGAGTAATGGCTTAGTGTTTACGGCGTCCGACTTCCTGCCATCGAGCCTAAGATTCGAACCAGGCTCCAACTAATTCTTTTTAGACGACAGGATTATATCATTAGCACTCACAAATAAAATACGGCTCATACCTAAGGACCTAGTGAGTGAGCTAATTTTTGTTTTTACTTAAT]

[+] EMBL CD178133             [ATGATCATAGTAACCGATTATTAGGATTTTTTTAGTGAAATGGCTTGAAAGCGTTCACAATGATACAATGGCATCTACTCTTAATCTTTCTTTAGTCTCAAAGTCCCAAAATCTCGTTTCTTTCGTTTTACACCTAATATTTTCTACTAATACTGACACTGTTACTGCTTCTACTACCATGGAAGTTCTTCTTAATAATTTTATCCCTGTGCTAATTAAATGTCGCAGCTTCAGCCGATGCACATATGTGAGTTTCTACGCTGCTGATAACTAATAAGTAACTTATGATCGACAGCCGGGAAGTAATAGCTACCTTTGACACCACCCGAAATCACCTTTCCCACAATTAAATCTCCGTTATTTCGCAGCATCTCTCCTGTGCCCGTAATTAACCCACAAGTATTTGCGGAGTAATGGCTTACTGTTTACGGCGTCCGACTTCCTGCCATCGAGCCTAAGATTCGAAC                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD069087             [                                                                                                                                                                                                    gagggTATCCCTGTGCTAATTAGATGTCGCAGCTTCAGCCGATGCACATATGTGAGTTTCTACGCTGCTGATAACTAATAAGTAACTTATGATCGACAGCCGGGAAGTAATAGCTACCTTTGACACCACCCGAAATCACCTTTCCCACAATTAAATCTCCGTTATTTCGCAGCATCTCTCCTGTGCCCGTAATTAACCCACAAGTATTTGCGGAGTAATGGCTTAGTGTTTACGGCGTCCGACTTCCTGCCATCGAGCCTAAGATTCGAACCAGGCTCCAACTAATTCTTTTTAGACGACAGGATTATATCATTAGCACTCACAAATAAAATACGGCTCATACCTAAGGACCTAGTGAGTGAGCTAATTTTTGTTTTTACTTAAT]
[+] EMBL CD087369             [                                                                                                                                                                                                                                                            tacCTTCGCTGTTGATAACTAATAAGTAACTTATGATCGACAGCCGGGAAGTAATAGCTACCTTTGACACCACCCGAAATCACCTTTCCCACAATTAAATCTCCGTTATTTCGCAGCATCTCTCCTGTGCCCGTAATTAACCCACAAGTATTTGCGGAGTAATGGCTTAGTGTTTACGGCGTCCGACTTCCTGCCATCGAGCCTAAGATTCGAACCAGGCTCCAACTAATTCTTTTTAGACGACAGGATTATATCATTAGCACTCACAAATAAAATACGGCTCATACCTAAG                                     ]


>consensus_4748#0 ATGATCATAGTAACCGATTATTAGGATTTTTTTAGTGAAATGGCTTGAAAGCGTTCACAA TGATACAATGGCATCTACTCTTAATCTTTCTTTAGTCTCAAAGTCCCAAAATCTCGTTTC TTTCGTTTTACACCTAATATTTTCTACTAATACTGACACTGTTACTGCTTCTACTACCAT GGAAGTTCTTCTTAATAATTTTATCCCTGTGCTAATTAAATGTCGCAGCTTCAGCCGATG CACATATGTGAGTTTCTACGCTGCTGATAACTAATAAGTAACTTATGATCGACAGCCGGG AAGTAATAGCTACCTTTGACACCACCCGAAATCACCTTTCCCACAATTAAATCTCCGTTA TTTCGCAGCATCTCTCCTGTGCCCGTAATTAACCCACAAGTATTTGCGGAGTAATGGCTT AGTGTTTACGGCGTCCGACTTCCTGCCATCGAGCCTAAGATTCGAACCAGGCTCCAACTA ATTCTTTTTAGACGACAGGATTATATCATTAGCACTCACAAATAAAATACGGCTCATACC TAAGGACCTAGTGAGTGAGCTAATTTTTGTTTTTACTTAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)