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Schistosoma mansoni
cluster # 4838 cluster # 4838       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4838#0 length = 590 sequences # 3  

consensusID : consensus_4838#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 590
fasta sequence
                              [ACTCAGATGGTAGGCTTCCAGATATTGATGTTATAACTGAGGACAGAAGTGATGGAATCGATTTTAAATCATAAGTCAACACACTACCAACACCATCATTACTCAGAGGACGGACATTTTCTCGTAATTCAATCAAATTATTATAGGCAGGATATTCAACAGGTATTTGTTGTTCAACATTACAGCTGGAAAGTGTAGATTTATCATTAAGTTGTTCATCGGACTTTCTGGATCGTCTGTTAACATTATTCTTATTATTATTGTTACTGCTAGAGATATTTGTGGTCATGATACGAGAGAAATGATCGATTTCTGATTGATGGGAAAATTTTCGAGTTAATACGTTATTTGCTTTATCACTACTGATAGTAGTATTTATCTTAAAATGATGATGGTTATCTTGCATAGCGGAATTTCGATGATCAGAATGATGTAAAAAGTATAAGCGATTATTGACTTTTTGATTGATACTGTTGCCATTAGCAATAATATCTTGATTAGTAGTATCCACTTTTGATGAATTAACACAAATGAGGTGATTATTAATATTATTCCAAGTATTTTTATGATCAATTGATTGTTGACGAAGA]

[-] EMBL CD091578             [ACTCAGATGGTAGGCTTCCAGATATTGATGTTATAACTGAGGACAGAAGTGATGGAATCGATTTTAAATCATAAGTCAACACACTACCAACACCATCATTACTCAGAGGACGGACATTTTCTCGTAATTCAATCAAATTATTATAGGCAGGATATTCAACAGGTATTTGTTGTTCAACATTACAGCTGGAAAGTGTAGATTTATCATTAAGTTGTTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD178763             [                       ATTGATGTTATAACTGAGGACAGAAGTGATGGAATCGATTTTAAATCATAAGTCAACATACTACCAACACCATCATTACTCAGAGGACGGACATTTTCTCGTAATTCAATCAAATTATTATAGACAGGATATTCAACAGGTATTTGTTGTTCAACATTACAGCTGGAAAGTGTAGATTTATCATTAAGTTGTTCATCGGACTTTCTGGATCGTCTGTTAACATTATTCTTATTATTATTGTTACTGCTAGAGATATTTGTGGTCATGATACGAGAGAAATGATCGATTTCTGATTGATGGGAAAATTTTCGAGTTAATACGTTATTTGCTTTATCACTACTGATAGTAGTATTTATCTTAAAATGATGATGGTTATCTTGCATAGCGGAATTTCGATGATCAGAATGATGTAAAAAGTATAAGCGATTATTGACTTTTTGATTGATACTGTTGCCATTAGCAATAAT                                                                                                    ]
[+] EMBL CD092105             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTCGATGATCAGAATGATGTAAAAAGTATAAGCGATTATTGACTTTTTGATTGATACTGTTGCCATTAGCAATAATATCTTGATTAGTAGTATCCACTTTTGATGAATTAACACAAATGAGGTGATTATTAATATTATTCCAAGTATTTTTATGATCAATTGATTGTTGACGAAGA]


>consensus_4838#0 ACTCAGATGGTAGGCTTCCAGATATTGATGTTATAACTGAGGACAGAAGTGATGGAATCG ATTTTAAATCATAAGTCAACACACTACCAACACCATCATTACTCAGAGGACGGACATTTT CTCGTAATTCAATCAAATTATTATAGGCAGGATATTCAACAGGTATTTGTTGTTCAACAT TACAGCTGGAAAGTGTAGATTTATCATTAAGTTGTTCATCGGACTTTCTGGATCGTCTGT TAACATTATTCTTATTATTATTGTTACTGCTAGAGATATTTGTGGTCATGATACGAGAGA AATGATCGATTTCTGATTGATGGGAAAATTTTCGAGTTAATACGTTATTTGCTTTATCAC TACTGATAGTAGTATTTATCTTAAAATGATGATGGTTATCTTGCATAGCGGAATTTCGAT GATCAGAATGATGTAAAAAGTATAAGCGATTATTGACTTTTTGATTGATACTGTTGCCAT TAGCAATAATATCTTGATTAGTAGTATCCACTTTTGATGAATTAACACAAATGAGGTGAT TATTAATATTATTCCAAGTATTTTTATGATCAATTGATTGTTGACGAAGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)