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Schistosoma mansoni
cluster # 4876 cluster # 4876       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4876#0 length = 976 sequences # 3  

consensusID : consensus_4876#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 976
fasta sequence
                              [GTCATATTCATAAGTTTGTGACTAAACATTATTCTATGTTATTAATAAGAACAGTTATTATTGCTAACATTATCATCATCAACCTCATGACTATTCACATGAGTGTAGAATAACTAAAGGTAATAAATGGATAGATAGATATATTATATCCATAGTGTGATAAAATGTGACAACCCACTCGGAAAAATTGAGTGATTAAAAGAATATTGAGTTGTTTTTTTTCTGTCATAATATATATGTATTCATGTATCTATGTGATAGCCTGGCGGTATTATTATGGTTTGTTGTTGCAGATTAAATCAGTATACACGCCCACTAATTGGTTGTTGTTGAGCCACAGTCACAGGTGTTGTATAAGGAATTCCACTACTGACACCGCCGCCAATCGATGTGGGGCCAGTAACATAATTACTGTCGAAACCAGATGATGATGGTGATGGGTTATACGGTGGAGCAGCCTGTTGCATTGGTGTCACATCGTCAAGATCGTCTTCATTAAGTTGCATTTTTGCTTCAATATCTTCATCGGGCGGTGGTTTCGGTTTGTATAAACCACAGCAAAAGTTGAAACAACAAAAGCAGCAACAACAGAAGAAACAACCGGTGATCAAGAAGAGGAAGATGAAAAGTGCTTTACACCATTTGTTTGTAAGCACAAAGTAGGTGTTCACATTTTCTTCACCGAATTGTTCTGCAATAGACAAGCCTACGCTTCCATATTTTTCATAAATACTCCGTTTCACAGGATCAGTTAAAATACGATAAGCACGATTAATCTCCTTGAAAGTTTCAGCTGCAGAAGGATTATCTGGGATTTTTATCCGGATGGAATTGCAAAGCCAACCTTTCTGTATGATTTTCTTAAGTCTCCCTCAGGTGCTCCCTTGGGGACTCTCAGTACGTGAAATAAAGACTCTCCTGAAGTTGATAGCTTCCTGGAACTCATTTGCCCTGTGTCAGAAATGTAACCGTAGCT]

[+] EMBL BG931235             [GTCATATTCATAAGTTTGTGACTAAACATTATTCTATGTTATTAATAAGAACAGTTATTATTGCTAACATTATCATCATCAACCTCATGACTATTCACATGAGTGTAGAATAACTAAAGGTAATAAATGGATAGATAGATATATTATATCCATAGTGTGATAAAATGTGACAACCCACTCGGAAAAATTGAGTGATTAAAAGAATATTGAGTTGTTTTTTTTCTGTCATAATATATATGTATTCATGTATCTATGTGATAGCCTGGCGGTATTATTATGGTTTGTTGTTGCAGATTAAATCAGTATACACGCCCACTAATTGGTTGTTGTTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD166974             [                                                                                                                                                                                                                                                                            GTACTATTATGGTTTGTTGTTGCAGATTAAATCAGTATACACGCCCACTAGTTGGTTGTTGTTGAGCCACAGTCACAGGTGTTGTATAAGGAATTCCACTACTGACACCGCCGCCAATCGATGTGGGGCCAGTAACATAATTACTGTCGAAACCAGATGATGATGGTGATGGGTTATACGGTGGAGCAGCCTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD189830             [                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATGGTTTGTTGTTGCAGATTAAATCAGTATACACGCCCACTAATTGGTTGTTGTTGAGCCACAGTCACAGGTGTTGGATAAGGAAATCCACTACCGACACCGCCGCCAATCGATGTGGGACCAGTAACAAAATTACTGTCGAAACCAGATGATGATGGTGATGGGTTATACGGTGGAGCTGCCTGTTGCATTGGTGTCACATCGTCAAGATCGTCTTCATTAAGTTGCATTTTTGCTTCAATATCTTCATCGGGCGGTGGTTTCGGTTTGTATAAACCACAGCAAAAGTTGAAACAACAAAAGCAGCAACAACAGAAGAAACAACCGGTGATCAAGAAGAGGAAGATGAAAAGTGCTTTACACCATTTGTTTGTAAGCACAAAGTAGGTGTTCACATTTTCTTCACCGAATTGTTCTGCAATAGACAAGCCTACGCTTCCATATTTTTCATAAATACTCCGTTTCACAGGATCAGTTAAAATACGATAAGCACGATTAATCTCCTTGAAAGTTTCAGCTGCAGAAGGATTATCTGGGATTTTTATCCGGATGGAATTGCAAAGCCAACCTTTCTGTATGATTTTCTTAAGTCTCCCTCAGGTGCTCCCTTGGGGACTCTCAGTACGTGAAATAAAGACTCTCCTGAAGTTGATAGCTTCCTGGAACTCATTTGCCCTGTGTCAGAAATGTAACCGTAGCT]


>consensus_4876#0 GTCATATTCATAAGTTTGTGACTAAACATTATTCTATGTTATTAATAAGAACAGTTATTA TTGCTAACATTATCATCATCAACCTCATGACTATTCACATGAGTGTAGAATAACTAAAGG TAATAAATGGATAGATAGATATATTATATCCATAGTGTGATAAAATGTGACAACCCACTC GGAAAAATTGAGTGATTAAAAGAATATTGAGTTGTTTTTTTTCTGTCATAATATATATGT ATTCATGTATCTATGTGATAGCCTGGCGGTATTATTATGGTTTGTTGTTGCAGATTAAAT CAGTATACACGCCCACTAATTGGTTGTTGTTGAGCCACAGTCACAGGTGTTGTATAAGGA ATTCCACTACTGACACCGCCGCCAATCGATGTGGGGCCAGTAACATAATTACTGTCGAAA CCAGATGATGATGGTGATGGGTTATACGGTGGAGCAGCCTGTTGCATTGGTGTCACATCG TCAAGATCGTCTTCATTAAGTTGCATTTTTGCTTCAATATCTTCATCGGGCGGTGGTTTC GGTTTGTATAAACCACAGCAAAAGTTGAAACAACAAAAGCAGCAACAACAGAAGAAACAA CCGGTGATCAAGAAGAGGAAGATGAAAAGTGCTTTACACCATTTGTTTGTAAGCACAAAG TAGGTGTTCACATTTTCTTCACCGAATTGTTCTGCAATAGACAAGCCTACGCTTCCATAT TTTTCATAAATACTCCGTTTCACAGGATCAGTTAAAATACGATAAGCACGATTAATCTCC TTGAAAGTTTCAGCTGCAGAAGGATTATCTGGGATTTTTATCCGGATGGAATTGCAAAGC CAACCTTTCTGTATGATTTTCTTAAGTCTCCCTCAGGTGCTCCCTTGGGGACTCTCAGTA CGTGAAATAAAGACTCTCCTGAAGTTGATAGCTTCCTGGAACTCATTTGCCCTGTGTCAG AAATGTAACCGTAGCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)