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Schistosoma mansoni
cluster # 4877 cluster # 4877       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4877#0 length = 800 sequences # 3  

consensusID : consensus_4877#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 800
fasta sequence
                              [CGGAGCCACCCAGTCGTACACCGACGCCGCCGTTGCCCACGGAAACGTCAAGGCAACGATCATGGTCTCCATGGCCGTCTACGGGGCCGTCCTGGCCGTCACCACATGGGGATCCCACGCCGCTCTCGAACAGCAGCGCGGATGGGGTCGTCAGCTGGCGCTCACCCCGATGACACCGTTGAAATACGTCTTTTCAAAGGTGCTGGCGATCGAAACTGTGGCTTTGGTTCCGCTGGCGGTCGTGTTCGCCACGGGTGCCATCACCAATGCCCGCGTCGATGGGTTGCGCTGGTTGTGGTCCTTCCTGCTGTGCTGGGTGTGCTCGATGCCCTTCACTTTGTTCGGTCTGGCCGTCGCCTTGCTGGTGCGTGGCGAGGCTGCGACTGGGATCACCTCCTTCTGTACCGTTGCCGTGGCCTTTCTAGGCAATATGTTCATCCCGCTGAATGGATTCATGCTCAAGCTGTCACGATTCACCCCAATGTATGGGCCCGGCCAGCTGACGCGGATGCCGCTCATCGGGCAGCAGATGGTGACGATGCGTGGCGTGATCGACGAGCCGGTGTGGCGTCCTGTCGTCAGTATCATCGCTTGGACGATAATCATGGGGATCGTGGCAGTGCTGGCGGGTAGACGTCGTCAGAACCGCTGAGAGGATCGGAGCAGACGAGAAATCCACATCGGGGACGAAATCGATCAGGACAACACCCCTGGAATGCACGATGCTAGCAGGAAGGACTCCGCCATGGTAGTAATCGTAGGGGCATCGCATCCGATTCCCTTGCGGNGTCGCACCGCAA]

[-] EMBL CD091252             [CGGAGCCACCCAGTCGTACACCGACGCCGCCGTTGCCCACGGAAACGTCAAGGCAACGATCATGGTCTCCATGGCCGTCTACGGGGCCGTCCTGGCCGTCACCACATGGGGATCCCACGCCGCTCTCGAACAGCAGCGCGGATGGGGTCGTCAGCTGGCGCTCACCCCGATGACACCGTTGAAATACGTCTTTTCAAAGGTGCTGGCGATCGAAACTGTGGCTTTGGTTCCGCTGGCGGTCGTGTTCGCCACGGGTGCCATCACCAATGCCCGCGTCGATGGGTTGCGCTGGTTGTGGTCCTTCCTGCTGTGCTGGGTGTGCTCGATGCCCTTCACTTTGTTCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD146848             [                                                                                                        CATGGGGATCCCACGCCGCTCTCGAACAGCAGCGCGGATGGGGTCGTCAGCTGGCGCTCACCCCGATGACACCGTTGAAATACGTCTTTTCAAAGGTGCTGGCGATCGAAACTGTGGCTTTGGTTCCGCTGGCGGTCGTGTTCGCCACGGGTGCCATCACCAATGCCCGCGTCGATGGGTTGCGCTGGTTGTGGTCCTTCCTGCTGTGCTGGGTGTGCTCGATGCCCTTCACTTTGTTCGGTCTGGCCGTCGCCTTGCTGGTGCGTGGCGAGGCTGCGACTGGGATCACCTCCTTCTGTACCGTTGCCGTGGCCTTTCTAGGCAATATGTTCATCCCGCTGAATGGATTCATGCTCAAGCTGTCACGATTCACCCCAATGTATGGGCCCGGCCAGCTGACGCGGATGCCGCTCATCGGGCAGCAGATGGTGACGATGCGTGGCGTGATCGACGAGCCGGTGTGGCGTCCTGTCGTCAGTATCATCGCTTGGACGATAATCATGGGGATCGTGGCAGTGCTGGCGGGTAGACGTCGTCAGAACCGCTGAGAGGATCGGAGCAGACGAGAAATCCACATCGGGGACGAAATCGATCAGGACAACACCCCTGGAATGCACGATGCTAGCAGGAAGGACTCCGCCATGGTAGTAATCGTAGGGGCATCGCATCCGATTCCCTTGCGGNGTCGCACCGCAA]
[+] EMBL CD146890             [                                                                                                        CATGGGGATCCCACGCCGCTCTCGAACAGCAGCGCGGATGGGGTCGTCAGCTGGCGCTCACCCCGATGACACCGTTGAAATACGTCTTTTCAAAGGTGCTGGCGATCGAAACTGTGGCTTTGGTTCCGCTGGCGGTCGTGTTCGCCACGGGTGCCATCACCAATGCCCGCGTCGATGGGTTGCGCTGGTTGTGGTCCTTCCTGCTGTGCTGGGTGTGCTCGATGCCCTTCACTTTGTTCGGTCTGGCCGTCGCCTTGCTGGTGCGTGGCGAGGCTGCGACTGGGATCACCTCCTTCTGTACCGTTGCCGTGGCCTTTCTAGGCAATATGTTCATCCCGCTGAATGGATTCATGCTCAAGCTGTCACGATTCACCCCAATGTATGGGCCCGGCCAGTTGACGCGGATGCCGCTCATCGGGCAGCAGATGGTGACGATGCGTGGCGTGATCGACGAGCCGGTGTGGCGTCCTGTCGTCAGTATCATCGCTTGGACGATAATCATGGGGATCGTGGCAGTGCTGGCGGGT                                                                                                                                                                         ]


>consensus_4877#0 CGGAGCCACCCAGTCGTACACCGACGCCGCCGTTGCCCACGGAAACGTCAAGGCAACGAT CATGGTCTCCATGGCCGTCTACGGGGCCGTCCTGGCCGTCACCACATGGGGATCCCACGC CGCTCTCGAACAGCAGCGCGGATGGGGTCGTCAGCTGGCGCTCACCCCGATGACACCGTT GAAATACGTCTTTTCAAAGGTGCTGGCGATCGAAACTGTGGCTTTGGTTCCGCTGGCGGT CGTGTTCGCCACGGGTGCCATCACCAATGCCCGCGTCGATGGGTTGCGCTGGTTGTGGTC CTTCCTGCTGTGCTGGGTGTGCTCGATGCCCTTCACTTTGTTCGGTCTGGCCGTCGCCTT GCTGGTGCGTGGCGAGGCTGCGACTGGGATCACCTCCTTCTGTACCGTTGCCGTGGCCTT TCTAGGCAATATGTTCATCCCGCTGAATGGATTCATGCTCAAGCTGTCACGATTCACCCC AATGTATGGGCCCGGCCAGCTGACGCGGATGCCGCTCATCGGGCAGCAGATGGTGACGAT GCGTGGCGTGATCGACGAGCCGGTGTGGCGTCCTGTCGTCAGTATCATCGCTTGGACGAT AATCATGGGGATCGTGGCAGTGCTGGCGGGTAGACGTCGTCAGAACCGCTGAGAGGATCG GAGCAGACGAGAAATCCACATCGGGGACGAAATCGATCAGGACAACACCCCTGGAATGCA CGATGCTAGCAGGAAGGACTCCGCCATGGTAGTAATCGTAGGGGCATCGCATCCGATTCC CTTGCGGNGTCGCACCGCAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)