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Schistosoma mansoni
cluster # 4879 cluster # 4879       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4879#0 length = 892 sequences # 3  

consensusID : consensus_4879#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 892
fasta sequence
                              [TCCCACTGTNNGCTAAAGTAGGACTGGTGCTCTTATTTAAGATGGAAAGAATTGAAGCAGGCCCACCTGTGTNNGTTGTTGTATTCAACTCAGATTCTGTACTTGTAATTACTTCGAGATTAGGTGATACAGATGTTGATTTTTTCTGTAATAACAGACTTGGTGATACTGCTAAACTTGTTAATACACTGGGAGGATTTCCACCAGGAAGAATACCTTTACCGCTTGATGTAGCCTGTCCATTCATTTGACGTGGTTTTAAACCTTTTGATTGAAGACAGAGACGAGCTGCTGCATGAAAAATAGTTTGGACTTCTTTATAGGTTTCAGTAACAGTTATTTCGTAATATGGAATTCCATGAGATTTTGCAAACTCTTCAGCTTCTGTTTTTTGTACTAAGCGAAATCGTTCCAAATCTGATTTATTTGCAACAAGTATTATACTAGGTGGTTTGACAGTATTTATAGTGTATAAAGCTGAACGTCTCAACGAACCAGATTGTGTTAAACTGTGTTGTGTATTAATAGAATTAGGATTTACTGTTGAGACTGATGAATTAC-TAATGATGTAGATGATGATGTATTTATTTGTTGAGAATTGTTTGATTTAGATTGTTGTGCTCCTGATAGTTTTGGCTTTCTGTCCATTAATTCAGATTGTGAATGAATTGCTTCAACAAGTTCTTGTGCACGATAGAAACTACGGCGACTGGTCATAGAAAATAATATAATAATCGCTTGTGACCATTTAATGATGTCGTCAAGATCAATTTCATCACTATCAGATGTATCCTGAATATTCACTGTTAATTCATGACCGTCGACTGAATCAGCTTTTGTGTAACTGTCACTCAGATAAGGTGCGTATTCCACAATGAAACGACGGGTTAGA]

[-] EMBL CD182913             [TCCCACTGTNNGCTAAAGTAGGACTGGTGCTCTTATTTAAGATGGAAAGAATTGAAGCAGGCCCACCTGTGTNNGTTGTTGTATTCAACTCAGATTCTGTACTTGTAATTACTTCGAGATTAGGTGATACAGATGTTGATTTTTTCTGTAATAACAGACTTGGTGATACTGCTAAACTTGTTAATACACTGGGAGGATTTCCACCAGGAAGAATACCTTTACCGCTTGATGTAGCCTGTCCATTCATTTGACGTGGTTTTAAACCTTTTGATTGAAGACAGAGACGAGCTGCTGCATGAAAAATAGTTTGGACTTCTTTATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD202281             [                                                                        ttgcTGTTGTATTCAACTCAGATTCTGTACTTGTAATTACTTCGAGATTAGGTGATACAGATGTTGATTTTTTCTGTAATAACAGACTTGGTGATACTGCTAAACTTGTTAATACACTGGGAGGATTTCCACCAGGAAGAATACCTTTACCGCTTGATGTAGCCTGTCCATTCATTTGACGTGGTTTTAAACCTTTTGATTGAAGACAGAGACGAGCTGCTGCATGAAAAATAGTTTGGACTTCTTTATAGGTTTCAGTAACAGTTATTTCGTAATATGGAATTCCATGAGATTTTGCAAACTCTTCAGCTTCTGTTTTTTGTACTAAGCGAAATCGTTCCAAATCTGATTTATTTGCAACAAGTATTATACTAGGTGGTTTGACAGTATTTATAGTGTATAAAGCTGAACGTCTCAACGAACCAGATTGTGTTAAACTGTGTTGTGTATTAATAGAATTAGGATTTACTGTTGAGACTGATGAATTAC TAATGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD059358             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACTGTGTTGTGTATTAATAGAATTAGGATTTACTGTTGAGACTGATGAATTACTTAATGATGTAGATGATGATGTATTTATTTGTTGAGAATTGTTTGATTTAGATTGTTGTGCTCCTGATAGTTTTGGCTTTCTGTCCATTAATTCAGATTGTGAATGAATTGCTTCAACAAGTTCTTGTGCACGATAGAAACTACGGCGACTGGTCATAGAAAATAATATAATAATCGCTTGTGACCATTTAATGATGTCGTCAAGATCAATTTCATCACTATCAGATGTATCCTGAATATTCACTGTTAATTCATGACCGTCGACTGAATCAGCTTTTGTGTAACTGTCACTCAGATAAGGTGCGTATTCCACAATGAAACGACGGGTTAGA]


>consensus_4879#0 TCCCACTGTNNGCTAAAGTAGGACTGGTGCTCTTATTTAAGATGGAAAGAATTGAAGCAG GCCCACCTGTGTNNGTTGTTGTATTCAACTCAGATTCTGTACTTGTAATTACTTCGAGAT TAGGTGATACAGATGTTGATTTTTTCTGTAATAACAGACTTGGTGATACTGCTAAACTTG TTAATACACTGGGAGGATTTCCACCAGGAAGAATACCTTTACCGCTTGATGTAGCCTGTC CATTCATTTGACGTGGTTTTAAACCTTTTGATTGAAGACAGAGACGAGCTGCTGCATGAA AAATAGTTTGGACTTCTTTATAGGTTTCAGTAACAGTTATTTCGTAATATGGAATTCCAT GAGATTTTGCAAACTCTTCAGCTTCTGTTTTTTGTACTAAGCGAAATCGTTCCAAATCTG ATTTATTTGCAACAAGTATTATACTAGGTGGTTTGACAGTATTTATAGTGTATAAAGCTG AACGTCTCAACGAACCAGATTGTGTTAAACTGTGTTGTGTATTAATAGAATTAGGATTTA CTGTTGAGACTGATGAATTACTAATGATGTAGATGATGATGTATTTATTTGTTGAGAATT GTTTGATTTAGATTGTTGTGCTCCTGATAGTTTTGGCTTTCTGTCCATTAATTCAGATTG TGAATGAATTGCTTCAACAAGTTCTTGTGCACGATAGAAACTACGGCGACTGGTCATAGA AAATAATATAATAATCGCTTGTGACCATTTAATGATGTCGTCAAGATCAATTTCATCACT ATCAGATGTATCCTGAATATTCACTGTTAATTCATGACCGTCGACTGAATCAGCTTTTGT GTAACTGTCACTCAGATAAGGTGCGTATTCCACAATGAAACGACGGGTTAGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)