These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_4879#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 892 fasta sequence [TCCCACTGTNNGCTAAAGTAGGACTGGTGCTCTTATTTAAGATGGAAAGAATTGAAGCAGGCCCACCTGTGTNNGTTGTTGTATTCAACTCAGATTCTGTACTTGTAATTACTTCGAGATTAGGTGATACAGATGTTGATTTTTTCTGTAATAACAGACTTGGTGATACTGCTAAACTTGTTAATACACTGGGAGGATTTCCACCAGGAAGAATACCTTTACCGCTTGATGTAGCCTGTCCATTCATTTGACGTGGTTTTAAACCTTTTGATTGAAGACAGAGACGAGCTGCTGCATGAAAAATAGTTTGGACTTCTTTATAGGTTTCAGTAACAGTTATTTCGTAATATGGAATTCCATGAGATTTTGCAAACTCTTCAGCTTCTGTTTTTTGTACTAAGCGAAATCGTTCCAAATCTGATTTATTTGCAACAAGTATTATACTAGGTGGTTTGACAGTATTTATAGTGTATAAAGCTGAACGTCTCAACGAACCAGATTGTGTTAAACTGTGTTGTGTATTAATAGAATTAGGATTTACTGTTGAGACTGATGAATTAC-TAATGATGTAGATGATGATGTATTTATTTGTTGAGAATTGTTTGATTTAGATTGTTGTGCTCCTGATAGTTTTGGCTTTCTGTCCATTAATTCAGATTGTGAATGAATTGCTTCAACAAGTTCTTGTGCACGATAGAAACTACGGCGACTGGTCATAGAAAATAATATAATAATCGCTTGTGACCATTTAATGATGTCGTCAAGATCAATTTCATCACTATCAGATGTATCCTGAATATTCACTGTTAATTCATGACCGTCGACTGAATCAGCTTTTGTGTAACTGTCACTCAGATAAGGTGCGTATTCCACAATGAAACGACGGGTTAGA] [-] EMBL CD182913 [TCCCACTGTNNGCTAAAGTAGGACTGGTGCTCTTATTTAAGATGGAAAGAATTGAAGCAGGCCCACCTGTGTNNGTTGTTGTATTCAACTCAGATTCTGTACTTGTAATTACTTCGAGATTAGGTGATACAGATGTTGATTTTTTCTGTAATAACAGACTTGGTGATACTGCTAAACTTGTTAATACACTGGGAGGATTTCCACCAGGAAGAATACCTTTACCGCTTGATGTAGCCTGTCCATTCATTTGACGTGGTTTTAAACCTTTTGATTGAAGACAGAGACGAGCTGCTGCATGAAAAATAGTTTGGACTTCTTTATA ] [+] EMBL CD202281 [ ttgcTGTTGTATTCAACTCAGATTCTGTACTTGTAATTACTTCGAGATTAGGTGATACAGATGTTGATTTTTTCTGTAATAACAGACTTGGTGATACTGCTAAACTTGTTAATACACTGGGAGGATTTCCACCAGGAAGAATACCTTTACCGCTTGATGTAGCCTGTCCATTCATTTGACGTGGTTTTAAACCTTTTGATTGAAGACAGAGACGAGCTGCTGCATGAAAAATAGTTTGGACTTCTTTATAGGTTTCAGTAACAGTTATTTCGTAATATGGAATTCCATGAGATTTTGCAAACTCTTCAGCTTCTGTTTTTTGTACTAAGCGAAATCGTTCCAAATCTGATTTATTTGCAACAAGTATTATACTAGGTGGTTTGACAGTATTTATAGTGTATAAAGCTGAACGTCTCAACGAACCAGATTGTGTTAAACTGTGTTGTGTATTAATAGAATTAGGATTTACTGTTGAGACTGATGAATTAC TAATGAT ] [-] EMBL CD059358 [ ACTGTGTTGTGTATTAATAGAATTAGGATTTACTGTTGAGACTGATGAATTACTTAATGATGTAGATGATGATGTATTTATTTGTTGAGAATTGTTTGATTTAGATTGTTGTGCTCCTGATAGTTTTGGCTTTCTGTCCATTAATTCAGATTGTGAATGAATTGCTTCAACAAGTTCTTGTGCACGATAGAAACTACGGCGACTGGTCATAGAAAATAATATAATAATCGCTTGTGACCATTTAATGATGTCGTCAAGATCAATTTCATCACTATCAGATGTATCCTGAATATTCACTGTTAATTCATGACCGTCGACTGAATCAGCTTTTGTGTAACTGTCACTCAGATAAGGTGCGTATTCCACAATGAAACGACGGGTTAGA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||