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Schistosoma mansoni
cluster # 4905 cluster # 4905       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4905#0 length = 585 sequences # 3  

consensusID : consensus_4905#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 585
fasta sequence
                              [ATACCAGCGGTCATCCAGAAGTTTATATTTTAATTATTCCTGGTTTTGGGATGATTTCTCATATTGTTATTAGAATTTCAAAAAAAGGAGAAATTTTTGGATATTTGGGCATAGTTTATGCTATGATTTCTATTGGGTTATTAGGTTTTATTGTTTGAGCTCATCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTTGATACACGTGCTTATTTTGCAGCTGCAACTATAGCTATTGCTGTCCCTACAGGCATTAAAATTTTTAGATGAATTGGTACGTTGTTTGGTGGTGTTTATTCTTTTGATTATTTAATAATGTGAGTTTTAGGTTTTATTTTTTTATTTACTATAGGGGGTTTAACAGGTATTGTTTTATCTAATTCGAGTTTAGATATTGTTTTACATGATACTTATTATGTTGTTGCTCATTTTCATTATGCTTTGAGAATAGGTGCAGTATTTAGTTTATTAGCTGGTATTTTTTATTGATTTCCTTTATTTACAGGAGTTGCTATAAATAGAAAATTATTATTAGTTCAGTTTTTAATTTTATTTGTTGGTGTAAATATAACTTTTTTTCCTCAGCATTTTT]

[+] EMBL CD085992             [ATACCAGCGGTCATCCAGAAGTTTATATTTTAATTATTCCTGGTTTTGGGATGATTTCTCATATTGTTATTAGAATTTCAAAAAAAGGAGAAATTTTTGGATATTTGGGCATAGTTTATGCTATGATTTCTATTGGGTTATTAGGTTTTATTGTTTGAGCTCATCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTTGATACACGTGCTTATTTTGCAGCTGCAACTATAGCTATTGCTGTCCCTACAGGCATTAAAATTTTTAGATGAATTGGTACGTTGTTTGGTGGTGTTTATTCTTTTGATTATTTAATATTGTGAGTTTTAGGTTTTATTTTTTTATTTACTATAGGGGGTTTAACAGGTATTGTTTTATCTAATTCGAGTTTAGATATTGTTTTACATGATACTTATTATGTTGTTGCTCATTTTCATTATGCTTTGAGAATAGGTGCAGTATT                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD086058             [                                                                                                                                                              GCTCATCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTTGATACACGTGCTTATTTTACAGCTGCAACTATAGCTATTGCTGTCCCTACAGGCATTAAAATTTTTAGATGAATTGGTACGTTGTTTGGTGGTGTTTATTCTTTTGAATAATTAA AATGTGAGTTTTAGGTTTTATTTTTTTATTTACTATAGGGGGTTTAACAGGTATTGTTTTATCTAATTCGAGTTTAGATATTGTTTTACATGATACTTATTATGCTGTTGCTCATTTTCATTATGCTTTGAGAATAGGTGCAGTATTTAGTTTATTAGCTGGTAT                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD132308             [                                                                                                                                                                                                                  CAGCTGCTACTATAGCTATTGCTGTGCCTACAGGAATTAAAATTTTTAGATGAATTGGTACGTTGTTTGGTGGTGTTTATTCTTTTGATTATTTAATACTATGAGTTTTAGGTTTTATTTTTTTATTTACTATAGGAGGTTTAACAGGTATTGTTTTATCTAATTCGAGTTTAGATATTGTTTTACACGATACTTATTATGTTGTTGCTCATTTTCATTATGCTTTGAGAATAGGTGCAGTATTTAGTCTATTAGCTGGTTTTTTTTATTGATTTCCTTTATTTACAGGAGTTGCTATAAATAGAAAATTATTATTAGTTCAGTTTTTAATTTTATTTGTTGGTGTAAATATAACTTTTTTTCCTCAGCATTTTT]


>consensus_4905#0 ATACCAGCGGTCATCCAGAAGTTTATATTTTAATTATTCCTGGTTTTGGGATGATTTCTC ATATTGTTATTAGAATTTCAAAAAAAGGAGAAATTTTTGGATATTTGGGCATAGTTTATG CTATGATTTCTATTGGGTTATTAGGTTTTATTGTTTGAGCTCATCATATGTTTACTGTTG GTTTAGATGTTGATACACGTGCTTATTTTGCAGCTGCAACTATAGCTATTGCTGTCCCTA CAGGCATTAAAATTTTTAGATGAATTGGTACGTTGTTTGGTGGTGTTTATTCTTTTGATT ATTTAATAATGTGAGTTTTAGGTTTTATTTTTTTATTTACTATAGGGGGTTTAACAGGTA TTGTTTTATCTAATTCGAGTTTAGATATTGTTTTACATGATACTTATTATGTTGTTGCTC ATTTTCATTATGCTTTGAGAATAGGTGCAGTATTTAGTTTATTAGCTGGTATTTTTTATT GATTTCCTTTATTTACAGGAGTTGCTATAAATAGAAAATTATTATTAGTTCAGTTTTTAA TTTTATTTGTTGGTGTAAATATAACTTTTTTTCCTCAGCATTTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)