cluster # 4925

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Schistosoma mansoni
cluster # 4925 cluster # 4925 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4925#0 length = 387 sequences # 3

consensusID : consensus_4925#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 387
fasta sequence

                              [AAGAGCGGGGGGTGTTCGTTTATGAAATTATTCTTTTTTTTTCTACAAAAACATTCTCTTCAAACACTTGATTACCCTTCCTTTTATACTTCTCTCCTTAAGCCAGACATTCTTCTATTCTATTCTTGTCTGTTACACAGGTGGTTTTACATTTTCTTTTTGAAAAGTCTTTCCTATTATTATAAAAAGACGCCTTATTCTTCATGATTGAATTAATTGTGGTGATATTCTTGCATTAGTTACCTTCGTCGATACAGCACTATTTATTGTCAATGAGCAAATGTAAATTAGCTAACCTTTTTTTTAAAAACTATTGTTTTGTTAATCTCTCCTCTTCAGTTTATATTAATACTACATCATTACATTGTCTTTTCTTTTCCATTGTTT]

[+] EMBL CD169165             [AAGAGCGGGGGGTGTTCGTTTATGAAATTATTCTTTTTTTTTCTACAAAAACATTCTCTTCAAACACTTGATTACCCTTCCTTTTATACTTCTCTCCTTAAGCCAGACATTCTTCTATTCTATTCTTGTCTGTTACACAGGTGGTTTTACATTTTCTTTTTGAAAAGTCTTTCCTATTATTATAAAAAGACGCCTTATTCTTCATGATTGAATTAATTGTGGTGATATTCTTGCATTAGTTACCTTCGTCGATACAGCACTATTTATTGTCAATGAGCAAATGTAAATTAGCTAACCTTTTTTTTAAAAACTATTGTTTTGTTAATCTCTCCTCTTCAGTTTATATTAATACTACATCATTA                         ]
[-] EMBL CD141250             [                  TTTATGAAATTATTCTTTTTTTTTCTACAAAAACATTCTCTTCAAACACTTGATTACCCTTCCTTTTATACTTCTCTCCTTAAGCCAGACGTTCTTCTATTCTATTCTTGTCTGTTACACAGGTGGTTTTACATTTTCTTTTTGAAAAGTCTTTCCTATTATTATAAAAAGACGCCTTATTCTTCATGATTGAATTAATTGTGGTGATATTCTTGCATTAGTTACCTTCGTCGATACAGCACTATTTATTGTCAATGAGCAAATGTAAATTAGCTAACCTTTTTTTTAAAAACTATTGTTTTG                                                                  ]
[-] EMBL CD070493             [                                                                                                     GCCAGACATTCTTCTATTCTATTCTNGTCTGTANCACAGGTGGTTTTACATTTTCTTTTTGAAAAGTCTTTCCTATTATTATAAAAAGACGCCTTATTCTTCATGATTGAATTAATTGTGGTGATATTCTTGCATTAGTTACCTTCGTCGATACAGCACTATTTATTGTCAATGAGCAAATGTAAATTAGCTAACCTTTTTTTTAAAAACTATTGTTTTGTTAATCTCTCCTCTTCAGTTTATATTAATACTACATCATTACATTGTCTTTTCTTTTCCATTGTTT]




>consensus_4925#0
AAGAGCGGGGGGTGTTCGTTTATGAAATTATTCTTTTTTTTTCTACAAAAACATTCTCTT
CAAACACTTGATTACCCTTCCTTTTATACTTCTCTCCTTAAGCCAGACATTCTTCTATTC
TATTCTTGTCTGTTACACAGGTGGTTTTACATTTTCTTTTTGAAAAGTCTTTCCTATTAT
TATAAAAAGACGCCTTATTCTTCATGATTGAATTAATTGTGGTGATATTCTTGCATTAGT
TACCTTCGTCGATACAGCACTATTTATTGTCAATGAGCAAATGTAAATTAGCTAACCTTT
TTTTTAAAAACTATTGTTTTGTTAATCTCTCCTCTTCAGTTTATATTAATACTACATCAT
TACATTGTCTTTTCTTTTCCATTGTTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case