Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4926 cluster # 4926       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4926#0 length = 670 sequences # 3  

consensusID : consensus_4926#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 670
fasta sequence
                              [TGCCTAATCCACAGTCCATTGTGGTTATGGATCAGGTAAAGATATCAATTTATATCGTTCTCTTGGCTTATCAACTCAAAACATCTTTCTAGTTGGTAAAATCTCTCGATCACAAGCAACAAATGGAACTCCATTATCACAAGGATATTCGTCGCACTTATCTTCATTAATCAATGGTCATACTTTATCTAGACCTGCTATTGGATCAATGAGTGTAGCAGTGCGTTGTTGTCCTTTTGATCTACCATCAGTTTATCCTTCATCACCTTTATTAATGGAATCTAATTTGCTTCGACACAATTCTTTTAAATTTTCACCTCAATTAAGTCAACGATTATTAATTAATGATGAAATAGATCAGAATACATTGTAATATTCCTAATACTTATTATCTTATTCAAGTCATTCATCATTCATGTAAGCTTCAATGTTATAAATAGATGAAAAATTGCAAACTATTTTTTAGAGTCCAATTATTTGTTTTTGTATATTGATCAATTAATTTTACCCTTATTTTCATTTATACTATATCATTTCAATTTGATTGTTGTGAAAACCTTTCAATTTAATTCTGACAAAGGTTTCCTATTTGTTTGTCACTAACAAAAACATTAACCCTAGAACTTATATCTTGTANATCTTCGTTTTAATTCGATGGCTTGAGACCGGC]

[-] EMBL CD112210             [TGCCTAATCCACAGTCCATTGTGGTTATGGATCAGGTAAAGATATCAATTTATATCGTTCTCTTGGCTTATCAACTCAAAACATCTTTCTAGTTGGTAAAATCTCTCGATCACAAGCAACAAATGGAACTCCATTATCACAAGGATATTCGTCGCACTTATCTTCATTAATCAATGGTCATACTTTATCTAGACCTGCTATTGGATCAATGAGTGTAGCAGTGCGTTGTTGTCCTTTTGATCTACCATCAGTTTATCCTTCATCACCTTTATTAATGGAATCTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD078410             [                                                       CGTTCTCTTGGCTTATCAACTCAAAACATCTTTCTAGTTGGTAAAATCTCTCGATCACAAGCAACAAATGGAACTCCATTATCACAAGGATATTCGTCGCACTTATCTTCATTAATCAATGGTCATACTTTATCTAGACCTGCTATTGGATCAATGAGTGTAGCAGTGCGTTGTTGTCCTTTTGATCTACCATCAGTTTATCCTTCATCACCTTTATTAATGGAATCTAATTTGCTTCGACACAATTCTTTTAAATTTTCACCTCAATTAAGTCAACGATTATTAATTAATGATGAAATAGATCAGAATACATTGTAATATTCCTAATACTTATTATCTTATTCAAGTCATTCATCATTCATGTAAGCTTCAATGTTATAAATAGATGAAAAATTGCAAACTATTTTTTAGAGTCCAATTATTTGTTTTTGTATATTGATCAATTAATTTTACCCTTATTTTCATTTATACTATATCATTTCAATTTGATTGTTGTGAAAACCTTTCAATTTAATTCTGACAAAGGTTTCCTATTTGTTTGTCACTAACAAAAACATTAACCCTAGAACTTATATCTTGTANATCTTCGTTTTAATTCGATGGCTTGAGACCGGC]
[-] EMBL CD171340             [                                                                                               GTAAAATCTCTCGATCACAAGCAACAAATGGAACTCCATTATCACAAGGATATTCGTCGCACTTATCTTCATTAATCAATGGTCATACTTTATCTAGACCTGCTATTGGATCAATGAGTGTAGCAGTGCGTTGTTGTCCTTTTGATCTACCATCACTTTATCCTTCATCACCTTTATTAATGGAACCTAATTTGCTTCGACACAATTCTTTTAAATTTTCACCTCAATTAAGTCAACGATTATTAATTAATGATGAAATAGATCAGAATACATTGTAATATTCCTAATACTTATTATCTTATTCAAGTCATTCATCATTCATGTAAGCTTCAA                                                                                                                                                                                                                                                  ]


>consensus_4926#0 TGCCTAATCCACAGTCCATTGTGGTTATGGATCAGGTAAAGATATCAATTTATATCGTTC TCTTGGCTTATCAACTCAAAACATCTTTCTAGTTGGTAAAATCTCTCGATCACAAGCAAC AAATGGAACTCCATTATCACAAGGATATTCGTCGCACTTATCTTCATTAATCAATGGTCA TACTTTATCTAGACCTGCTATTGGATCAATGAGTGTAGCAGTGCGTTGTTGTCCTTTTGA TCTACCATCAGTTTATCCTTCATCACCTTTATTAATGGAATCTAATTTGCTTCGACACAA TTCTTTTAAATTTTCACCTCAATTAAGTCAACGATTATTAATTAATGATGAAATAGATCA GAATACATTGTAATATTCCTAATACTTATTATCTTATTCAAGTCATTCATCATTCATGTA AGCTTCAATGTTATAAATAGATGAAAAATTGCAAACTATTTTTTAGAGTCCAATTATTTG TTTTTGTATATTGATCAATTAATTTTACCCTTATTTTCATTTATACTATATCATTTCAAT TTGATTGTTGTGAAAACCTTTCAATTTAATTCTGACAAAGGTTTCCTATTTGTTTGTCAC TAACAAAAACATTAACCCTAGAACTTATATCTTGTANATCTTCGTTTTAATTCGATGGCT TGAGACCGGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)