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Schistosoma mansoni
cluster # 4936 cluster # 4936       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4936#0 length = 423 sequences # 3  

consensusID : consensus_4936#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 423
fasta sequence
                              [AAAAGTAATAATAATGATAATAATATTTAATGAAAGATAGATTCAAACATAGTTTAGATATATTGAATAGTCAAAGTTAACGTTAGTTTATAGCATTAATAGTGTATTATTCATTGTTTAATTGATCTACGCCTGTTCCTGCAAGCAATATTAGGATTAGGGCAGATTATTTCTCCTTGAATTTGTTTAGTTTGAATTTTGGCTACTCCTGAATTACACTGGAATGGTTTACCATTAATAATCACTTGAAGACCACCAGAACATGAATACTGATGACATGTTGCTTTAACTCGAGGATCATTTGTTGCCCTTCCATTCATTTCAGCTCTCCATGCTCCTTTATGTATAATACACATTGAATTATTTCCAAAATCTTGAGCAAACATATTTCCCCTTTGAGCGACAGGAATGTTCAACTGATGA]

[+] EMBL CD140884             [AAAAGTAATAATAATGATAATAATATTTAATGAAAGATAGATTCAAACATAGTTTAGATATATTGAATAGTCAAAGTTAACGTTAGTTTGTAGCATTAATAGTGTATTATTCATTGTTTAATTGATCTACGCCTGTTCCTGCAAGCAATATTAGGATTAGGGCAGATTATTTCTCCTTGAATTTGTTTAGTTTGAATTTTGGCTACTCCTGAATTACACTGGAATGGTTTACCATTAATAATCACTTGAAGACCACCAGAACATGAATACTGATGACATGTTGCTTTAACTCGAGGATCATTTGTTGCCCTTCCATTCATTTCAGCTCTCCATGCTCCTTTATGTATAATACACATTGAATTATTTCCAAAATCTTGAGCAAACATATNTCCCCTTTGAGCGACAGGAATGTTCAACTGATGA]
[+] EMBL CD140946             [AAAAGTAATAATAATGATAATAATATTTAATGAAAGATAGATTCAAACATAGTTTAGATATATTGAATAGTCAAAGTTAACGTTAGTTTATAGCATTAATAGTGTATTATTCATTGTTTAATTGATCTACGCCTGTTCCTGCAAGCAATATTAGGATTAGGGCAGATTATTTCTCCTTGAATTTGTTTAGTTTGAATTTTGGCTACTCCTGAATTACACTGGAATGGTTTACCATTAATAATCACTTGAAGACCACCAGAACATGAATACTGATGACATGTTGCTTTAACTCGAGGATCATTTGTTGCCCTTCCATTCATTTCAGCTCTCCATGCTCCTTTATGTATAATACACATCGAATTATTTCCAAAATCTTGAGCAAACATATTTCCCCTTTGAGCGACAGGAATGTT          ]
[+] EMBL CD140881             [AAAAGTAATAATAATGATAATAATATTTAATGAAAGATAGATTCAAACATAGTTTAGATATATTGAATAGTCAAAGTTAACGTTAGTTTATAGCATTAATAGTGTATTATTCATTGTTTAATTGATCTACGCCTGTTCCTGCAAGCAATATTAGGATTAGGGCAGATTATTTCTCCTTGAATTTGTTTAGTTTGAATTTTGGCTACTCCTGAATTACACTGGAATGGTTTACCATTAATAATCACTTGAAGACCACCAGAACATGAATACTGATGACATGTTGCTTTAACTCGAGGATCATTTGTTGCCCTTCCATTCATTTCAGCTCTCCATGCTCCTTTATGTATAATACACATTGAATTATTTCCAAAATCTTGAGCAAACATATTTCCCCTTTGAGCGACAGGAATGTT          ]


>consensus_4936#0 AAAAGTAATAATAATGATAATAATATTTAATGAAAGATAGATTCAAACATAGTTTAGATA TATTGAATAGTCAAAGTTAACGTTAGTTTATAGCATTAATAGTGTATTATTCATTGTTTA ATTGATCTACGCCTGTTCCTGCAAGCAATATTAGGATTAGGGCAGATTATTTCTCCTTGA ATTTGTTTAGTTTGAATTTTGGCTACTCCTGAATTACACTGGAATGGTTTACCATTAATA ATCACTTGAAGACCACCAGAACATGAATACTGATGACATGTTGCTTTAACTCGAGGATCA TTTGTTGCCCTTCCATTCATTTCAGCTCTCCATGCTCCTTTATGTATAATACACATTGAA TTATTTCCAAAATCTTGAGCAAACATATTTCCCCTTTGAGCGACAGGAATGTTCAACTGA TGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)