Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4954 cluster # 4954       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4954#0 length = 844 sequences # 3  

consensusID : consensus_4954#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 844
fasta sequence
                              [CCAACAATTCAATGAATGATCCAAATATTGTACAATTAGTTACATTCATTCATCATGTACATAATTATTATAAACAACAACGTAATTTAATTCATCCAATAGTAGTTGTTTGTGAATATGGTGCTGAATTAAGTGGTATATTTATTACTGCATCCGTTGGTATATTACATGCAGATATATTAGGTAGTATGAGTGATGTATTTACTATAGCTGGTTATTTATGTCAACAACGTTATGGTGTATTAAATAATTCATATCAATTATATAATGCTGCACGTCTAATTGGTTATTCTGCTATTGAGACATTAGCTAAAAAAAGATATTGTGATTGGTCCAAGACATCGATCATCTTCAACACTGACGACAACGACAACAACAACAATGAATAACTCGGAAGCAAATAGTTCAATCACGAATTCAACACAATTCAATATAAATAATCCATTGGATAATCTTTTTTCAAAACAATTTTTAAAATTAGATGATTTAATTTCAGTAGTTGATAAATGGTCCACGTCTAATANATCTGGATTGACTACTTCTTATGGTGTAGAAAATGACGACTCANATCAAGCTACATTAAAGAATGAAATGCCTGTTAATGATGAACAACAACAACAACAACAACAGCCAATCGATAAATCCAATGTAAATCCTTCAACTATTATATCATTATCAGATCATCAGCCTAATTTACTATCACAATCTTCAGAAATCAATAAACAAACAGATAACTCTAAACTACCCGAACATTTAATAAATTTAAATAATTTAACTAAAAATGCTACATATAATAAACGTTATACTCGTCAAGATTTTGAAGATCTTTTCAATTCTTCTCCTT]

[+] EMBL CD153081             [CCAACAATTCAATGAATGATCCAAATATTGTACAATTAGTTACATTCATTCATCATGTACATAATTATTATAAACAACAACGTAATTTAATTCATCCAATAGTAGTTGTTTGTGAATATGGTGCTGAATTAAGTGGTATATTTATTACTGCATCCGTTGGTATATTACATGCAGATATATTAGGTAGTATGAGTGATGTATTTACTATAGCTGGTTATTTATGTCAACAACGTTATGGTGTATTAAATAATTCATATCAATTATATAATGCTGCACGTCTAATTGGTTATTCTGCTATTGAGACATTAGCTAAAAAAAGATATTGTGATTGGTCCAAGACATCGATCATCTTCAACACTGACGACAACGACAACAACAACAATGAATAACTCGGAAGCAAATAGTTCAATCACGAATTCAACACAATTCAATATAAATAATCCATTGGATAATCTTTTTTCAAAACAATTTTTAAAATTAGATGATTTAATTTCAGTAGTTGATAAATGGTCCACGTCTAATANATCTGGATTGACTACTTCTTATGGTGTAGAAAATGACGACTCANATCAAGC                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD140746             [                                                           CATAATTATTATAAACAACAACGTAATTTAATTCATCCAATAGTAGTTGTTTGTGAATATGGTGCTGAATTAAGTGGTATATTTATTACTGCATCCGTTGGTATATTACATGCAGATATATTAGGTAGTATGAGTGATGTATTTACTATAGCTGGTTATTTATGTCAACAACGTTATGGTGTATTAAATAATTCATATCAATTATATAATGCTGCACGTCTAATCGGTTATTCTGCTATTGAGACATTAGCT AAAAAAGATATTGTGATTGGTCCAAGACATCGATCATCTTCAACACTGACGACAACGACAACAACAACAATGAATAACTCGGAAGCAAATAGTTCAATCACGAATTCAACACAATTCAATATAAATAATCCATTGGATAATCTTTTTTCAAAACAATTTTTAAAATTAGATGATTTAATTTCAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD153031             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GATCATCTTCAACACTGNCGNCANCGNCAACAACACCAATGAATAACTCGGAAGCAAATAGTTCAATCACGAATTCAACACAATTCAATATAAATAATCCATTGGATAATCTTTTTTCAAAACAATTTTTAAAATTAGATGATTTAATTTCAGTAGTTGATAAATGGTCCACGTCTAATAAATCTGGATTGACTACTTCTTATGGTGTAGAAAATGACGACTCAAATCAAGCTACATTAAAGAATGAAATGCCTGTTAATGATGAACAACAACAACAACAACAACAGCCAATCGATAAATCCAATGTAAATCCTTCAACTATTATATCATTATCAGATCATCAGCCTAATTTACTATCACAATCTTCAGAAATCAATAAACAAACAGATAACTCTAAACTACCCGAACATTTAATAAATTTAAATAATTTAACTAAAAATGCTACATATAATAAACGTTATACTCGTCAAGATTTTGAAGATCTTTTCAATTCTTCTCCTT]


>consensus_4954#0 CCAACAATTCAATGAATGATCCAAATATTGTACAATTAGTTACATTCATTCATCATGTAC ATAATTATTATAAACAACAACGTAATTTAATTCATCCAATAGTAGTTGTTTGTGAATATG GTGCTGAATTAAGTGGTATATTTATTACTGCATCCGTTGGTATATTACATGCAGATATAT TAGGTAGTATGAGTGATGTATTTACTATAGCTGGTTATTTATGTCAACAACGTTATGGTG TATTAAATAATTCATATCAATTATATAATGCTGCACGTCTAATTGGTTATTCTGCTATTG AGACATTAGCTAAAAAAAGATATTGTGATTGGTCCAAGACATCGATCATCTTCAACACTG ACGACAACGACAACAACAACAATGAATAACTCGGAAGCAAATAGTTCAATCACGAATTCA ACACAATTCAATATAAATAATCCATTGGATAATCTTTTTTCAAAACAATTTTTAAAATTA GATGATTTAATTTCAGTAGTTGATAAATGGTCCACGTCTAATANATCTGGATTGACTACT TCTTATGGTGTAGAAAATGACGACTCANATCAAGCTACATTAAAGAATGAAATGCCTGTT AATGATGAACAACAACAACAACAACAACAGCCAATCGATAAATCCAATGTAAATCCTTCA ACTATTATATCATTATCAGATCATCAGCCTAATTTACTATCACAATCTTCAGAAATCAAT AAACAAACAGATAACTCTAAACTACCCGAACATTTAATAAATTTAAATAATTTAACTAAA AATGCTACATATAATAAACGTTATACTCGTCAAGATTTTGAAGATCTTTTCAATTCTTCT CCTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)