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Schistosoma mansoni
cluster # 4999 cluster # 4999       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4999#0 length = 1025 sequences # 3  

consensusID : consensus_4999#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1025
fasta sequence
                              [GAGGCAAGAATTCGGCACGAGGCGGCACGAGGCCAAAGTTAGAGGATTATATTCAACTGCTGAAGAACTAGCCAAATTAAATTGTCGTAGATTTGCATGTTTATCATTGCAATCTCAAGGAGGTTCTATAATTGATTCATCAAATTATTCTCCAATTTGTATCTCTGTAGGTTGGGCTCTAATGGCACGTGATTATTCTATGATTAATCGATTAGCTGAGCTCTCTCTTGCTAGAGATAATGGGTTTATGCGTAAGGAAACTTTGAATGAAACAACAATTTCACATGCGTCTACGGAAGTTGCAGAATTGGCTGCTATAATATTAGGCTTTTGTCGAGGATCATCATATGACGAACCATCTAATAATAACAAAGTTAATGAAGTGAATCATCTTCAATTATCACCTGAATTAGCTTTTTTAATTCGTTATGCTGAACTTCAACAAAGTTTTAATGATGGTGATTGTGAAGGCGCAGTTGACCGAATTATTGATCTACTGGTTACTAGTCCTGGCAATTCACTTATTACCACCAATTCAGCTGGACAAGATTATACAAGTTCTTCGACTACAGGTCTTGGTTTACGTATACCAACTCGTCTTAAAATAAGACTTCTTGCTGAAGTAAGACATTTATTGGGTCGAAATTGTCTACGACGAGATCAAGTTGAAGTACTTATTACTGCTTTGATTGAATTAAGAGCAGATTTAGATTTAAATCCTAATAACATGTCCACAAATAGTGATATGCATTCATTACTAACAAAAATTCATGTGTCCCTTGCTAAAGAACTAGCATCGACATTCTTTGCTACCTCTGATACTATTTCTATATCTGCGTCTTTATCACCCAATAGTATGGTCGATACCAATTGGCATTAAGTTTGTNTCCCTATNTACCCATGTGTGTAAACTTTNTAAGAGTAAATTTATTGGATATGGGCATTATGATCCATGTTNGNGATATGTTNTGTGCTATTTGATAGAAGNNATGAGNTCTATTTCTATCTACATACTTAGTACAACA]

[+] EMBL CD078043             [GAGGCAAGAATTCGGCACGAGGCGGCACGAGGCCAAAGTTAGAGGATTATATTCAACTGCTGAAGAACTAGCCAAATTAAATTGTCGTAGATTTGCATGTTTATCATTGCAATCTCAAGGAGGTTCTATAATTGATTCATCAAATTATTCTCCAATTTGTATCTCTGTAGGTTGGGCTCTAATGGCACGTGATTATTCTATGATTAATCGATTAGCTGAGCTCTCTCTTGCTAGAGATAATGGGTTTATGCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD082472             [                                                                                                                                                                                             TGATTATTCTATGATTAATCGATTAGCTGAGCTCTCTCTTGCTAGAGATAATGGGTTTATGCGTAAGGAAACTTTGAATGAAACAACAATTTCACATGCGTCTACGGAAGTTGCAGAATTGGCTGCTATAATATTAGGCTTTTGTCGAGGATCATCATATGACGAACCATCTAATAATAACAAAGTTAATGAAGTGAATCATCTTCAATTATCACCTGAATTAGCTTTTTTAATTCGTTATGCTGAACTTCAACAAAGTTTTAATGATGGTGATTGTGAAGGCGCAGTTGACCGAATTATTGATCTACTGGTTACTAGTCCTGGCAATTCACTTATTACCACCAATTCAGCTGGACAAGATTATACAAGTTCTTCGACTACAGGTCTTGGTTTACGTATACCAACTCGTCTTAAAATAAGACTTCTTGCTGAAGTAAGACATTTATTGGGTCGAAATTGTCTACGACGAGATCAAGTTGAAGTACTTATTACTGCTTTGATTGAATTAAGAGCAGATTTAGATTTAAATCCTAATAACATGTCCACAAATAGTGATATGCATTCATTACTAACAAAAATTCATGTGTCCCTTGCTAAAGAACTAGCATCGACATTCTTTGCTACCTCTGATACTATTTCTATATCTGCGTCTTTATCACCCAATAGTATGGTCGATACCAATTGGCATTAAGTTTGTNTCCCTATNTACCCATGTGTGTAAACTTTNTAAGAGTAAATTTATTGGATATGGGCATTATGATCCATGTTNGNGATATGTTNTGTGCTATTTGATAGAAGNNATGAGNTCTATTTCTATCTACATACTTAGTACAACA]
[+] EMBL CD134329             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gTCACTTAGGGGCGCCAATTCAGGTGGACAATATTATACCAGTTCTGCGACTACAGGTCTTGGTTTACGTATACCAACTCGTCTTAAAATAAGACTTCTTGCTGAAGTAAGACATTTATTGGGTCGAAATTGACTACGACGAGATCAAGTTGAAGTACTTATGACTGCTATGACTGAATTAAGAGCAGATTTAGATTTAAATGCTAATAACATGTTCACAAATAGTGATATGCATTCATTACTGACAAAAATTCATGTGTCCCTTGCTAAAGAACTAGCATCGACATTGTTTGCTACCTCTGATACTATTg                                                                                                                                                                                                      ]


>consensus_4999#0 GAGGCAAGAATTCGGCACGAGGCGGCACGAGGCCAAAGTTAGAGGATTATATTCAACTGC TGAAGAACTAGCCAAATTAAATTGTCGTAGATTTGCATGTTTATCATTGCAATCTCAAGG AGGTTCTATAATTGATTCATCAAATTATTCTCCAATTTGTATCTCTGTAGGTTGGGCTCT AATGGCACGTGATTATTCTATGATTAATCGATTAGCTGAGCTCTCTCTTGCTAGAGATAA TGGGTTTATGCGTAAGGAAACTTTGAATGAAACAACAATTTCACATGCGTCTACGGAAGT TGCAGAATTGGCTGCTATAATATTAGGCTTTTGTCGAGGATCATCATATGACGAACCATC TAATAATAACAAAGTTAATGAAGTGAATCATCTTCAATTATCACCTGAATTAGCTTTTTT AATTCGTTATGCTGAACTTCAACAAAGTTTTAATGATGGTGATTGTGAAGGCGCAGTTGA CCGAATTATTGATCTACTGGTTACTAGTCCTGGCAATTCACTTATTACCACCAATTCAGC TGGACAAGATTATACAAGTTCTTCGACTACAGGTCTTGGTTTACGTATACCAACTCGTCT TAAAATAAGACTTCTTGCTGAAGTAAGACATTTATTGGGTCGAAATTGTCTACGACGAGA TCAAGTTGAAGTACTTATTACTGCTTTGATTGAATTAAGAGCAGATTTAGATTTAAATCC TAATAACATGTCCACAAATAGTGATATGCATTCATTACTAACAAAAATTCATGTGTCCCT TGCTAAAGAACTAGCATCGACATTCTTTGCTACCTCTGATACTATTTCTATATCTGCGTC TTTATCACCCAATAGTATGGTCGATACCAATTGGCATTAAGTTTGTNTCCCTATNTACCC ATGTGTGTAAACTTTNTAAGAGTAAATTTATTGGATATGGGCATTATGATCCATGTTNGN GATATGTTNTGTGCTATTTGATAGAAGNNATGAGNTCTATTTCTATCTACATACTTAGTA CAACA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)