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Schistosoma mansoni
cluster # 5009 cluster # 5009       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5009#0 length = 1214 sequences # 3  

consensusID : consensus_5009#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1214
fasta sequence
                              [ATTCAAATTCACGAAGCATCATCCACAGATTCATGTACTTCCATTTTAATATCATCATCTGTCGGATCGTCATCATCACCAATTTTGCATCGAATTACACGAAATATTGACATATTTTCTAACCAAACAAGTGGTGATATTCTAACAGAATACGATAATGATGATCCCAGAGCTACACTTGTCCCATCGATTGATTTAGATCCAGAGAAATTATACACAAATTATTGCTTACAAGAAGGGACATCAGCTAATTGTGATCAAATACGTCGTGATATTGATCGTCAATTTCCTTTCCATGAATTATTCAGTGAAAAAGGAGGTCATGGTCAAGAAAGTTTATACACCTTACTAAAAGCTTATACAATTAGACATCCAGAGAAAGGTTATTGTCAAGGTCAAGCCCCACTAGCAGCTGTCCTACTCATGTTTATGCCTGAAGTTGATGCCTTTTGGACTTTCAATGAAATTTGTGAACGTTATTTAGAATCTTATTATGATGATGGTCTTGAACGAGTACAAATTGACGGGGACGTCTTATATGCTCTTCTTAAGTCGATACATCCTCCAATATACANGATTTTACGAAAATATTCAGTGGAACCAAATCTTGTCGTCTTGGAATGGTTCATGTGCGCTTATACACGAACTTTACCTTGGACAGCTGTATTAAGAATATGGGATTTGTTTTTCTGTGATGGTAAAATCATATTATTTAAAGTGGCTATTGTTTTATTGAATCGTTTATTTGGACGTCCTTCTCACCGTAAATCATGTCAAGGACTTGACGATATTCTTATGAGATTACGTGAAGTATCATCTGTTGTTGGAAAATTGAATAATTTCATCCGTGAAGTTGTTCGAGTCCCTATAACTGCGAAAGAATTAAGTCAACAAATTGTTCGACAATCTCAAAAATGGGCAGCTAATCATCAAAAACAATCTTAGGCATTTAAGTTCATCAGTTGATTTAAATAATTGTCTAATACATCAAATGAAGAAATAACTAAAAAAAACACTTGATCATTTACCCGTTTACACAGATCAAGTCAGCATGGTAAAATGAAGTAATCAACGCCATAAAATGATTATATATATATATATATATTTCCTCTTCGAACACTGAATTACTCTTATTTTCATTTGTTCTTTTACAAAAAAGGAATGTGTTAACATTTTTCTTTCTTTTGTAAAAATTAATAATAACTGCGACTTTC]

[+] EMBL CD185326             [ATTCAAATTCACGAAGCATCATCCACAGATTCATGTACTTCCATTTTAATATCATCATCTGTCGGATCGTCATCATCACCAATTTTGCATCGAATTACACGAAATATTGACATATTTTCTAACCAAACAAGTGGTGATATTCTAACAGAATACGATAATGATGATCCCAGAGCTACACTTGTCCCATCGATTGATTTAGATCCAGAGAAATTATACACAAATTATTGCTTACAAGAAGGGACATCAGCTAATTGTGATCAAATACGTCGTGATATTGATCGTCAATTTCCTTTCCATGAATTATTCAGTGAAAAAGGAGGTCATGGTCAAGAAAGTTTATACACCTTACTAAAAGCTTATACAATTAGACATCCAGAGAAAGGTTATTGTCAAGGTCAAGCCCCACTAGCAGCTGTCCTACTCATGTTTATGCCTGAAGTTGATGCCTTTTGGACTTTCAATGAAATTTGTGAACGTTATTTAGAATCTTATTATGATGATGGTCTTGAACGAGTACAAATTGACGGGGACGTCTTATATGCTCTTCTTAAGTCGATACATCCTCCAATATACANGATTTTACGAAAATATTCAGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD133759             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAATTGACGGGGACGTCTTATATGCTCTTCTTAAGTCGATACATCCTCCAATATACAAATTTTTACGAAAATATTCAGTGGAACCAAATCTTGTCGTCTTGGAATGGTTCATGTGCGCTTATACACGAACTTTACCTTGGACAGCTGTATTAAGAATATGGGATTTGTTTTTCTGTGATGGTAAAATCATATTATTTAAAGTGGCTATTGTTTTATTGAATCGTTTATTTGGACGTCCTTCTCACCGTAAATCATGTCAAGGACTTGACGATATTCTTATGAGATTACGTGAAGTATCATCTGTTGTTGGAAAATTGAATAATTTCATCCGTGAAGTTGTTCGAGTCCCTATAACTGCGAAAGAATTAAGTCAACAAATTGTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD124328             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GGTTCATGTGCGCTTATACACGAACTTTACCTTGGACAGCTGTATTAAGAATATGGGATTTGTTTTTCTGTGATGGTAAAATCATATTATTTAAAGTGGCTATTGTTTTATTGAATCGTTTATTTGGACATCCTTCTCACCGTAAATCATGTCAAGGACTTGACGATATTCTTATGAGATTACGTGAAGTATCATCTGTTGTTGGAAAATTGGATAATTTCATCCGTGAAGTTGTTCGAGTCCCTATAACTGCGAAAGAATTAAGTCAACAAATTGTTCGACAATCTCAAAAATGGGCAGCTAATCATCAAAAACAATCTTAGGCATTTAAGTTCATCAGTTGATTTAAATAATTGTCTAATACATCAAATGAAGAAATAACTAAAAAAAACACTTGATCATTTACCCGTTTACACAGATCAAGTCAGCATGGTAAAATGAAGTAATCAACGCCATAAAATGATTATATATATATATATATATTTCCTCTTCGAACACTGAATTACTCTTATTTTCATTTGTTCTTTTACAAAAAAGGAATGTGTTAACATTTTTCTTTCTTTTGTAAAAATTAATAATAACTGCGACTTTC]


>consensus_5009#0 ATTCAAATTCACGAAGCATCATCCACAGATTCATGTACTTCCATTTTAATATCATCATCT GTCGGATCGTCATCATCACCAATTTTGCATCGAATTACACGAAATATTGACATATTTTCT AACCAAACAAGTGGTGATATTCTAACAGAATACGATAATGATGATCCCAGAGCTACACTT GTCCCATCGATTGATTTAGATCCAGAGAAATTATACACAAATTATTGCTTACAAGAAGGG ACATCAGCTAATTGTGATCAAATACGTCGTGATATTGATCGTCAATTTCCTTTCCATGAA TTATTCAGTGAAAAAGGAGGTCATGGTCAAGAAAGTTTATACACCTTACTAAAAGCTTAT ACAATTAGACATCCAGAGAAAGGTTATTGTCAAGGTCAAGCCCCACTAGCAGCTGTCCTA CTCATGTTTATGCCTGAAGTTGATGCCTTTTGGACTTTCAATGAAATTTGTGAACGTTAT TTAGAATCTTATTATGATGATGGTCTTGAACGAGTACAAATTGACGGGGACGTCTTATAT GCTCTTCTTAAGTCGATACATCCTCCAATATACANGATTTTACGAAAATATTCAGTGGAA CCAAATCTTGTCGTCTTGGAATGGTTCATGTGCGCTTATACACGAACTTTACCTTGGACA GCTGTATTAAGAATATGGGATTTGTTTTTCTGTGATGGTAAAATCATATTATTTAAAGTG GCTATTGTTTTATTGAATCGTTTATTTGGACGTCCTTCTCACCGTAAATCATGTCAAGGA CTTGACGATATTCTTATGAGATTACGTGAAGTATCATCTGTTGTTGGAAAATTGAATAAT TTCATCCGTGAAGTTGTTCGAGTCCCTATAACTGCGAAAGAATTAAGTCAACAAATTGTT CGACAATCTCAAAAATGGGCAGCTAATCATCAAAAACAATCTTAGGCATTTAAGTTCATC AGTTGATTTAAATAATTGTCTAATACATCAAATGAAGAAATAACTAAAAAAAACACTTGA TCATTTACCCGTTTACACAGATCAAGTCAGCATGGTAAAATGAAGTAATCAACGCCATAA AATGATTATATATATATATATATATTTCCTCTTCGAACACTGAATTACTCTTATTTTCAT TTGTTCTTTTACAAAAAAGGAATGTGTTAACATTTTTCTTTCTTTTGTAAAAATTAATAA TAACTGCGACTTTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)