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Schistosoma mansoni
cluster # 5048 cluster # 5048       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5048#0 length = 789 sequences # 3  

consensusID : consensus_5048#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 789
fasta sequence
                              [GGGACACGAACTCGAGAGAAAATTGATTTAGATGGTATTCGATCGGGCAACGGTGAGACAATGACAAACGATATCTCCATTAATAATAGTAATGATAATCAGACAACGTCCGATGTAAGTACTAGTAATATTAACAGCAACGTTGACGATAAGTCACATCCAATTAGTTTAATTCGTACAAATAAAATACTACGCGGCTTCAAACAATGGCTTCAACGTCCTGTTGGTGTAAATAATAATAATAATAATAGTAATCA-TAATAATGCCAGTAGTACCAGTAATAGTACTAGTACTAATTGTCCCTCTGTTGGTTCAATTGATTTCTCAACTGCCAATAATCCGACCAATACAATGAACAACGTTGTCAACTCTACCACTGGTTATTTTAGTGGTAGCTGTGGAGGTACCGCCAACAGCAGTGTAAATTATCATAATGTAAACAGTAATAACAATTGTGATATATCTTCTACTGTGGATGTTTCACATTTGGAATCTCCGAAATATGAACATAAATTCAGCTCACTAATGACAGTTGTTGATCCTNC-AACATGACCGATTTAGATAGTCTTGGTCCTGTATTCGGTGCTCCATTAGAATCTCAATTAGAAAGTCCTGATTATCCATGTGTTCCAGTCATGATTACAAGCCTATTGTTGTAGCCTTAGAGATACATGGACTTAGTTTACCTGGCCTGTATAGAAAACGTGGTCGACATCGTACAATTGCACAATTTATTTCCTCAGTAAACTTGCATCATGAACATATTGACCTGATGTTTAGTTTGGATGC]

[-] EMBL CD116417             [GGGACACGAACTCGAGAGAAAATTGATTTAGATGGTATTCGATCGGGCAACGGTGAGACAATGACAAACGATATCTCCATTAATAATAGTAATGATAATCAGACAACGTCCGATGTAAGTACTAGTAATATTAACAGCAACGTTGACGATAAGTCACATCCAATTAGTTTAATTCGTACAAATAAAATACTACGCGGCTTCAAACAATGGCTTCAACGTCCTGTTGGTGTAAATAATAATAATAATAATAGTAATCA TAATAATGCCAGTAGTACCAGTAATAGTACTAGTACTAATTGTCCCTCTGTTGGTTCAATTGATTTCTCAACTGCCAATAATCCGACCAATACAATGAACAACGTTGTCAACTCTACCGCTGGTTATTTTAGTGGTAGCTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD155082             [     ACGAACTCGAGAGAAAATTGATTTAGATGGTATTCGATCGGACAACACTGAGACAATGACAAACGATATCTCCATTAATAATAGTAATGGTAATCAGACAACGTCCGATGTAACTACTAGTAATATTAACAGCAACGTTGACGATAAGTCACATCCAATTAGTTTAATTCGTACAAATAAAATACTACGTGGCTTCAAACAATGGCTTCAACGTCCTGTTGGTGTAAATAATAATAATAATAATAGTAATCATTAATAATGCCAGTAGTACCAGTAATAGTACTAGTACTAATTGTCCCTCTGTTGGTTCAATTAATTTCTCAACTGCCAATAATCCGACCAATACAATGAACAACGTTGTCAACTCTACCACTGGTTATTTTAGTGGTAGCTGTGGAGGTACCGCCAACAGCAGTGTAAATTATCATAATGTAAACAGTAATAACAATTGTGATATATCTTCTACTGTGGATGTTTCACATTTGGAATCTCCGAAATATGAACATAAATTCAGCTCACTAATGACAGTTGTTGATCCTNC AACATGACCGATTT                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD117202             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACAACGTTGTCAACTCTACCACTGGTTATTTTAGTGGTAGCTGTGGAGGTACCGCCAACAGCAGTGTAAATTATCATAATGTAACCAGTAATAACAATTGTGATATATCTTATACTGTGGATGTTTCACATTTGGAATCTCCGAATAATGAACATAAATTCAGCTCACTAATGACAGTTGTTGATCCTCCAAACATGACCGATTTAGATAGTCTTGGTCCTGTATTCGGTGCTCCATTAGAATCTCAATTAGAAAGTCCTGATTATCCATGTGTTCCAGTCATGATTACAAGCCTATTGTTGTAGCCTTAGAGATACATGGACTTAGTTTACCTGGCCTGTATAGAAAACGTGGTCGACATCGTACAATTGCACAATTTATTTCCTCAGTAAACTTGCATCATGAACATATTGACCTGATGTTTAGTTTGGATGC]


>consensus_5048#0 GGGACACGAACTCGAGAGAAAATTGATTTAGATGGTATTCGATCGGGCAACGGTGAGACA ATGACAAACGATATCTCCATTAATAATAGTAATGATAATCAGACAACGTCCGATGTAAGT ACTAGTAATATTAACAGCAACGTTGACGATAAGTCACATCCAATTAGTTTAATTCGTACA AATAAAATACTACGCGGCTTCAAACAATGGCTTCAACGTCCTGTTGGTGTAAATAATAAT AATAATAATAGTAATCATAATAATGCCAGTAGTACCAGTAATAGTACTAGTACTAATTGT CCCTCTGTTGGTTCAATTGATTTCTCAACTGCCAATAATCCGACCAATACAATGAACAAC GTTGTCAACTCTACCACTGGTTATTTTAGTGGTAGCTGTGGAGGTACCGCCAACAGCAGT GTAAATTATCATAATGTAAACAGTAATAACAATTGTGATATATCTTCTACTGTGGATGTT TCACATTTGGAATCTCCGAAATATGAACATAAATTCAGCTCACTAATGACAGTTGTTGAT CCTNCAACATGACCGATTTAGATAGTCTTGGTCCTGTATTCGGTGCTCCATTAGAATCTC AATTAGAAAGTCCTGATTATCCATGTGTTCCAGTCATGATTACAAGCCTATTGTTGTAGC CTTAGAGATACATGGACTTAGTTTACCTGGCCTGTATAGAAAACGTGGTCGACATCGTAC AATTGCACAATTTATTTCCTCAGTAAACTTGCATCATGAACATATTGACCTGATGTTTAG TTTGGATGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)