cluster # 5071

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Schistosoma mansoni
cluster # 5071 cluster # 5071 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5071#0 length = 781 sequences # 3

consensusID : consensus_5071#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 781
fasta sequence

                              [TGGAAGGGGAAAATTTATTTTCCTGAGATATGCGTGGTGTGCTTATTTTCATGTATTGTTTGTCAGTTTTAATAGGCACTTCTTCAAATGTTAAATTTATACATGAACCTAAGGACTCCTGCATACCTTGGCGTGGTCAAAGTCAACTCATTTGCAAAGCCGATCACCCTAAAGCAACTTATTCGTGGCTAGCAATACGTCATGCACCTTTGGATTTAATTTTTTTTAATGGACGTCTTCATTTTTTAAAAGAATCTAATGTGTTATTTGAAAAATCTGAAGCTATTGTTGAAAATTCTTCATTTGTAAATGTCAATACTCTCAATGGTCGCCTACTTCTCAAACATCCCACATCAGTCGATAAAATTAATCGATCGAAATCTTTGATGCTTCACTACAAGTCATGGCTTGAAGGTTTTTATCGATGTAAAGCTTCTGTTCCCGGTCAAGGTAGTTTGGTTAGCCATGCTGTAAATATTCGTCTTTCTGATCTCTTTCTTGAACCCAATCTACCAACAACTCATGGTCTCCTTTCTAATTCACATCAATCGTTAATTACTGAATTTCAACAGTATTCAACCCCTCCAGTTATGATATCAGAGACGGACACTAATAAACATCCTAGCCTTGGTGGAGGTAGTTTCTATCCGGGAGAAGTAGTTGTTCTTCGCTGTCCATTGATAGCAATAAGTTCGGTTAAACCAATCATACGGTGGTTTCATGTCACATCGGATGTAATGGTTATGCAACCTGTCGGTTTCGATACAGACTTTAGTCATTC]

[+] EMBL CD178435             [TGGAAGGGGAAAATTTATTTTCCTGAGATATGCGTGGTGTGCTTATTTTCATGTATTGTTTGTCAGTTTTAATAGGCACTTCTTCAAATGTTAAATTTATACATGAACCTAAGGACTCCTGCATACCTTGGCGTGGTCAAAGTCAACTCATTTGCAAAGCCGATCACCCTAAAGCAACTTATTCGTGGCTAGCAATACGTCATGCACCTTTGGATTTAATTTTTTTTAATGGACGTCTTCATTTTTTAAAAGAATCTAATGTGTTATTTGAAAAATCTGAAGCTATTGTTGAAAATTCTTCATTTGTAAATGTCAATACTCTCAATGGTCGCCTACTTCTCAAACATCCCACATCAGTCGATAAAATTAATCGATCGAAATCTTTGATGCTTCACTACAAGTCATGGCTTGAAGGTTTTTATCGATGTAAAGCTTCTGTTCCCGGTCAAGGTAGTTTGGTTAGCCATGCTGTAAATATTCGTCTTTCTGATCTCTTTCTTGAACCCAATCTACCAACAA                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD202689             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TAGCCATGCTGTAAATATTCGTCTTTCTGATCTCTTTCTTGAACCCAATCTACCAACAACTCATGGTCTCCTTTCTAATTCACATCAATCGTTAATTACTGAATTTCAACAGTATTCAACCCCTCCAGTTATGATATCAGAGACGGACACTAATAAACATCCTAGCCTTGGTGGAGGTAGTTTCTATCCGGGAGAAGTAGTTGTTCTTCGCTGTCCATTGATAGCAATAAGTTCGGTTAAACCAATCATACGGTGGTTTCATGTCACATCGGATGTAATGGTTATGCAACCTGTCGGTTTCGATACAGACTTTA       ]
[-] EMBL CD072363             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACTCATGGTCTCCTTTCTAATTCACATCAATCGTTAATTACTGAATTTCAACAGTATTCAACCCCTCCAGTTATGATATCAGAGACGGACACTAATAAACATCCTAGCCTTGGTGGAGGTAGTTTCTATCCGGGAGAAGTAGTTGTTCTTCGCTGTCCATTGATAGCAATAAGTTCGGTTAAACCAATCATACGATGGTTTCATGTCACATCGGATGTAATGGTTATGCAACCTGTCGGTTTCGATACAGACTTTAGTCATTC]




>consensus_5071#0
TGGAAGGGGAAAATTTATTTTCCTGAGATATGCGTGGTGTGCTTATTTTCATGTATTGTT
TGTCAGTTTTAATAGGCACTTCTTCAAATGTTAAATTTATACATGAACCTAAGGACTCCT
GCATACCTTGGCGTGGTCAAAGTCAACTCATTTGCAAAGCCGATCACCCTAAAGCAACTT
ATTCGTGGCTAGCAATACGTCATGCACCTTTGGATTTAATTTTTTTTAATGGACGTCTTC
ATTTTTTAAAAGAATCTAATGTGTTATTTGAAAAATCTGAAGCTATTGTTGAAAATTCTT
CATTTGTAAATGTCAATACTCTCAATGGTCGCCTACTTCTCAAACATCCCACATCAGTCG
ATAAAATTAATCGATCGAAATCTTTGATGCTTCACTACAAGTCATGGCTTGAAGGTTTTT
ATCGATGTAAAGCTTCTGTTCCCGGTCAAGGTAGTTTGGTTAGCCATGCTGTAAATATTC
GTCTTTCTGATCTCTTTCTTGAACCCAATCTACCAACAACTCATGGTCTCCTTTCTAATT
CACATCAATCGTTAATTACTGAATTTCAACAGTATTCAACCCCTCCAGTTATGATATCAG
AGACGGACACTAATAAACATCCTAGCCTTGGTGGAGGTAGTTTCTATCCGGGAGAAGTAG
TTGTTCTTCGCTGTCCATTGATAGCAATAAGTTCGGTTAAACCAATCATACGGTGGTTTC
ATGTCACATCGGATGTAATGGTTATGCAACCTGTCGGTTTCGATACAGACTTTAGTCATT
C

clustalw multiple alignements is not computed in this case