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Schistosoma mansoni
cluster # 5084 cluster # 5084       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5084#0 length = 867 sequences # 3  

consensusID : consensus_5084#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 867
fasta sequence
                              [GATGGTATCTTCGGCTTAATCCCTTTAAAAGGAGCCCTTGAAAGCATTACTGATGATTCCCTGTATGAAAACTATGAAAGGGTTAAGATTGCCTTGTTACCATTGATGAGAAAACTTAAGACACAAATTATGAGAATCAACGTGATCATTAGGAAAAGTGTGAAATTTTTTAAGAAAGCAAGAGACTCCTACTACACGAAAATGGGTAGACTTTTGGCACTGAAATGGAATTTTCCGGGTCAGAACACCATGTATTCTTATTTATCGGATCCAGAACCGATATCGAGCGCGCAAAATATTTCTAGTGATGAATGTATTATCCAATTACTAAATACCAACAATTATGGTACTCTTGATTGTCATCTTTCGATGGAATGTATTTTAAAACTCATGGACTTTAACTCCCGTGGTTATGAATTGGCTCATCAAGTTCTATATATTTTAATTTCACATCAAGTTAATTGTACTGATTCCCTGGATGGTATGCTATCAAATCTCTCGACTAGCGTGGGATCCTTACAAAATAAACTATGTTCAATTNTGTATAGAGATTTTGTCAATTTGTTTCTCAGTTCGGAAACAACCCCTCGAAATCGAGATATTTTACTTGAAGAAATGTTTGTTTGCGGGAGTATTGGCTACGAAAACTTTCATCCAGTTTTCGATTCTCAGCAGGGTTTTGTCGTGGCAACAGCCTTCCGGATGCTTTATTTCTTCAGGTTCCACAGATGGAAAAAGCANACATAAAAATACCAAAATTATGTTTCACGAACGCCATCCCCTTGTTGAACACAGACATGCGGATGGTTGTCTATCACACATGACCTCTGTGGCTGCAGCTGTGATGGGTCTATATTNTAGAGCATT]

[+] EMBL CD201477             [GATGGTATCTTCGGCTTAATCCCTTTAAAAGGAGCCCTTGAAAGCATTACTGATGATTCCCTGTATGAAAACTATGAAAGGGTTAAGATTGCCTTGTTACCATTGATGAGAAAACTTAAGACACAAATTATGAGAATCAACGTGATCATTAGGAAAAGTGTGAAATTTTTTAAGAAAGCAAGAGACTCCTACTACACGAAAATGGGTAGACTTTTGGCACTGAAATGGAATTTTCCGGGTCAGAACACCATGTATTCTTATTTATCGGATCCAGAACCGATATCGAGCGCGCAAAATATTTCTAGTGATGAATGTATTATCCAATTACTAAATACCAACAATTATGGTACTCTTGATTGTCATCTTTCGATGGAATGTATTTTAAAACTCATGGACTTTAACTCCCGTGGTTATGAACTGGCTCATCAAGTTCTATATATTTTAATTTCACATCAAGTTAATTGTACTGATTCCCTGGATGGTATGCTATCAAATCTCTCGACTAGCGTGGGATCCTTACAAAATAAACTATGTTCAATTNTGTATAGAGATTTTGTCAATTTGTTTCTCAGTTCGGAAACAACCCCTCGAAATCGAGATATTTTACTTGAAGAAATGTTTGTTTGCGGGAGTATTGGCTACGAAAACTTTCATCCA                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD190560             [                                                                                                                                                                                                                                       TTTCCGGGTCAGAACACCATGTATTCTTATTTATCGGATCCAGAACCGATATCGAGCGCGCAAAATATTTCTAGTGATGAATGTATTATCCAATTACTAAATACCAACAATTATGGTACTCTTGATTGTCATCTTTCGATGGAATGTATTTTAAGACTCATGGTCTTTAACTCCCGTGGTTATGAATTGGCTCATCAAGTTGTATATATTTTAATTTCACATCAAGTTAATTGTACTGATTCCCTGGATGGTATGCTATCAGATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD116058             [                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATATCGAGCGCGCAAAATATTTCTAGTGATGAATGTATTATCCAATTACTAAATACCAACAATTATGGTACTCTTGATTGTCATCTTTCGATGGAATGTATTTTAAAACTCATGGACTTTAACTCCCGTGGTTATGAATTGGCTCATCAAGTTCTATATATTTTAATTTCGCATCAAGTTAATTGTACTGATTCCCTGGATGGTATGCTATCAAATCTCTCGACTAGCGTGGGATCCTTACAAAATAAACTATGTTCAATTTTGTATAGAGATTTTGTCAATTTGTTTCTCAGTTCGGAAACAACCCCTCGAAATCGAGATATTTTACTTGAAGAAATGTTTGTTTGCGGGAGTATTGGCTACGAAAAC TTCATCCAGTTTTCGATTCTCAGCAGGGTTTTGTCGTGGCAACAGCCTTCCGGATGCTTTATTTCTTCAGGTTCCACAGATGGAAAAAGCANACATAAAAATACCAAAATTATGTTTCACGAACGCCATCCCCTTGTTGAACACAGACATGCGGATGGTTGTCTATCACACATGACCTCTGTGGCTGCAGCTGTGATGGGTCTATATTNTAGAGCATT]


>consensus_5084#0 GATGGTATCTTCGGCTTAATCCCTTTAAAAGGAGCCCTTGAAAGCATTACTGATGATTCC CTGTATGAAAACTATGAAAGGGTTAAGATTGCCTTGTTACCATTGATGAGAAAACTTAAG ACACAAATTATGAGAATCAACGTGATCATTAGGAAAAGTGTGAAATTTTTTAAGAAAGCA AGAGACTCCTACTACACGAAAATGGGTAGACTTTTGGCACTGAAATGGAATTTTCCGGGT CAGAACACCATGTATTCTTATTTATCGGATCCAGAACCGATATCGAGCGCGCAAAATATT TCTAGTGATGAATGTATTATCCAATTACTAAATACCAACAATTATGGTACTCTTGATTGT CATCTTTCGATGGAATGTATTTTAAAACTCATGGACTTTAACTCCCGTGGTTATGAATTG GCTCATCAAGTTCTATATATTTTAATTTCACATCAAGTTAATTGTACTGATTCCCTGGAT GGTATGCTATCAAATCTCTCGACTAGCGTGGGATCCTTACAAAATAAACTATGTTCAATT NTGTATAGAGATTTTGTCAATTTGTTTCTCAGTTCGGAAACAACCCCTCGAAATCGAGAT ATTTTACTTGAAGAAATGTTTGTTTGCGGGAGTATTGGCTACGAAAACTTTCATCCAGTT TTCGATTCTCAGCAGGGTTTTGTCGTGGCAACAGCCTTCCGGATGCTTTATTTCTTCAGG TTCCACAGATGGAAAAAGCANACATAAAAATACCAAAATTATGTTTCACGAACGCCATCC CCTTGTTGAACACAGACATGCGGATGGTTGTCTATCACACATGACCTCTGTGGCTGCAGC TGTGATGGGTCTATATTNTAGAGCATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)