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Schistosoma mansoni
cluster # 5127 cluster # 5127       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5127#0 length = 850 sequences # 3  

consensusID : consensus_5127#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 850
fasta sequence
                              [TCCACTTCCAATGTTTTCCCCTAATTTCCTCTTCAAATGGAACCTGGTTTGCTTTCTCCTACAACAGTCTGTTGCTGATGGTAACCGGTCAACGAACACTGAGTATCGTGTGCAGACAATTGTTTACAAATACTTGTACCTTTTTGATGTGGTAGTAGTCCAGGTTTCAACTCCGTACAGTAGAACTATCTTGACGTTCGTTTTGAAGATTGTGACTTTGATATTGGTTGACAGTTGTTCCATATGTTCTTCAACTGTAGGAATGCAGTCCTTACTCTGGCAATCCTCGCCTTTACATCTGCATCAGATCCTCCCTGTTCATCAATGATGCTACCCAGATACGTGAATGTTTTCCAGAGAAACTCTGGGTTGGTGTACAAAACTCCCAAACTCTAGTTATGTTTGGCTACTCGAAAAAACGCTCTACATGCAAAACATTCATGTAATTTAGATGTTTTGCATTGCATCCCTTTTAACGATATAACTAATATTTTGTATTAAATTCTCATTACAGTTTTGCAAAGATCAACTTATCACTGTAGCATATGTCAATGAAAATAAATATAAAAAGCCAATGGGAAGTGTTTTTGTTGGATCATCTCCAGAATTCGATATTGCTGTTTACACGGTTGCTTTTGCCTTACATCCTACATCTGTGTTTGATGTGAATATCGCTGGATGCAAAGTACGTATAACATGTCATGAATTATTTCCCTCTGAAATGGGTACATGCTATATGGGGTGAACAATATATGTATCTGCATAAACATTTGTTTCCCCTGACCTTAAAATCAATAGCAAACTTAAATTTAATATGTCATTTGACAGATTAGTGTTCTGAAAATATATA]

[+] EMBL CD078250             [TCCACTTCCAATGTTTTCCCCTAATTTCCTCTTCAAATGGAACCTGGTTTGCTTTCTCCTACAACAGTCTGTTGCTGATGGTAACCGGTCAACGAACACTGAGTATCGTGTGCAGACAATTGTTTACAAATACTTGTACCTTTTTGATGTGGTAGTAGTCCAGGTTTCAACTCCGTACAGTAGAACTATCTTGACGTTCGTTTTGAAGATTGTGACTTTGATATTGGTTGACAGTTGTTCCATATGTTCTTCAACTGTAGGAATGCAGTCCTTACTCTGGCAATCCTCGCCTTTACATCTGCATCAGATCCTCCCTGTTCATCAATGATGCTACCCAGATACGTGAATGTTTTCCAGAGAAACTCTGGGTTGGTGTACAAAACTCCCAAACTCTAGTTATGTTTGGCTACTCGAAAAAACGCTCTACATGCAAAACATTCATGTAATTTAGATGTTTTGCATTGCATCCCTTTTAACGATATAACTAATATTTTGTATTAAATTCTCATTACAGTTTTGCANAGATCAACTTATCACTGTAGCATATGTCAATGAAAATAAATATAAAAAGCCAATGGGAAGTGTTTTTGTTGGATCATCTCCAGAATTCGATATTG                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD078330             [TCCACTTCCAATGTTTTCCCCTAATTTCCTCTTCAAATGGAACCTGGTTTGCTTTCTCCTACAACAGTCTGTTGCTGATGGTAACCGGTCAACGAACACTGAGTATCGTGTGCAGACAATTGTTTACAAATACTTGTACCTTTTTGATGTGGTAGTAGTCCAGGTTTCAACTCCGTACAGTAGAACTATCTTGACGTTCGTTTTGAAGATTGTGACTTTGATATTGGTTGACAGTTGTTCCATATGTTCTTCAACTGTAGGAATGCAGTCCTTACTCTGGCAATCCTCGCCTTTACATCTGCATCAGATCCTCCCTGTTCATCAATGATGCTACCCAGATACGTGAATGTTTTCCAGAGAAACTCTGGGTTGGTGTACAAAACTCCCAAACTCTAGTTATGTTTGGCTACTCGAAAAAACGCTCTACATGCAAAACATTCATGTAATTTAGATGTTTTGCATTGCATCCCTTTTAACGATATAACTAATATTTTGTATTAAATTCTCATTACAGTTTTGCAAAGATCAACTTATCACTGTAGCATATGTCAATGAAAATAAATATAAAAAGCCAATGCGAAGT                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD072888             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGAAACTCTGGGTTGGTGTACAAAACTCCCAAACTCTAGTTATGTTTGGCTACTCGAAAAAACGCTCTACATGCAAAACATTCATGTAATTTAGATGTTTTGCATTGCATCCCTTTTAACGATATAACTAATATTTTGTATTAAATTCTCATTACAGTTTTGCAAAGATCAACTTATCACTGTAGCATATGTCAATGAAAATAAATATAAAAAGCCAATGGGAAGTGTTTTTGTTGGATCATCTCCAGAATTCGATATTGCTGTTTACACGGTTGCTTTTGCCTTACATCCTACATCTGTGTTTGATGTGAATATCGCTGGATGCAAAGTACGTATAACATGTCATGAATTATTTCCCTCTGAAATGGGTACATGCTATATGGGGTGAACAATATATGTATCTGCATAAACATTTGTTTCCCCTGACCTTAAAATCAATAGCAAACTTAAATTTAATATGTCATTTGACAGATTAGTGTTCTGAAAATATATA]


>consensus_5127#0 TCCACTTCCAATGTTTTCCCCTAATTTCCTCTTCAAATGGAACCTGGTTTGCTTTCTCCT ACAACAGTCTGTTGCTGATGGTAACCGGTCAACGAACACTGAGTATCGTGTGCAGACAAT TGTTTACAAATACTTGTACCTTTTTGATGTGGTAGTAGTCCAGGTTTCAACTCCGTACAG TAGAACTATCTTGACGTTCGTTTTGAAGATTGTGACTTTGATATTGGTTGACAGTTGTTC CATATGTTCTTCAACTGTAGGAATGCAGTCCTTACTCTGGCAATCCTCGCCTTTACATCT GCATCAGATCCTCCCTGTTCATCAATGATGCTACCCAGATACGTGAATGTTTTCCAGAGA AACTCTGGGTTGGTGTACAAAACTCCCAAACTCTAGTTATGTTTGGCTACTCGAAAAAAC GCTCTACATGCAAAACATTCATGTAATTTAGATGTTTTGCATTGCATCCCTTTTAACGAT ATAACTAATATTTTGTATTAAATTCTCATTACAGTTTTGCAAAGATCAACTTATCACTGT AGCATATGTCAATGAAAATAAATATAAAAAGCCAATGGGAAGTGTTTTTGTTGGATCATC TCCAGAATTCGATATTGCTGTTTACACGGTTGCTTTTGCCTTACATCCTACATCTGTGTT TGATGTGAATATCGCTGGATGCAAAGTACGTATAACATGTCATGAATTATTTCCCTCTGA AATGGGTACATGCTATATGGGGTGAACAATATATGTATCTGCATAAACATTTGTTTCCCC TGACCTTAAAATCAATAGCAAACTTAAATTTAATATGTCATTTGACAGATTAGTGTTCTG AAAATATATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)