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Schistosoma mansoni
cluster # 5135 cluster # 5135       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5135#0 length = 293 sequences # 3  

consensusID : consensus_5135#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 293
fasta sequence
                              [CGAGGTTAGGACGTGCAACCCACTATTTTGAAGACTGATGGCTCTAACGACTACTCTAATGCTAATGGTGTGGATATTTAAGTTTCATTAGGAGAATTAGTAAAAATGTTTAGCGTAATGAAATGATTAGGATCTTCCCTTAAACAACAATTTAGTACTAATCATGGGATCACAAAGTTAATTCAAAGCGTATCTTTTGTAGTGTCACTTTCCATATCTATTTAAGCATACCGAAATAATAGTAAGCAGTTAAATTTTACCCTACAATTTTACAAAACTTAAGCAATCATAGT]

[+] EMBL CD090261             [CGAGGTTAGGACGTGCAACCCACTATTTTGAAGACTGATGGCTCTAACGACTACTCTAATGCTAATGGTGTGGATATTTAAGTTTCATTAGGAGAATTAGTAAAAATGTTTAGCGTAATGAAATGATTAGGATCTTCCCTTAAACAACAATTTAGTACTAATCATGGGATCACAAAGTTAATTCAAAGCGTATCTTTTGTAGTGTCACTTTCCATATCTATTTAAGCATACCGAAATAACAGTAAGCAGTTAAATTTTACCCTACAATTTTACAAAACTTAAGCAATCATAG ]
[+] EMBL CD090204             [CGAGGTTAGGACGTGCAACCCACTATTTTGAAGACTGATGGCTCTAACGACTACTCTAATGCTAATGGTGTGGATATTTAAGTTTCATTAGGAGAATTAGTAAAAATGTTTAGCGTAATGAAATGATTAGGATCTTCCCTTAAACAACAATTTAGTACTAATCATGGGATCACAAAGTTAATTCAAAGCGTATCTTTTGTAGTGTCACTTTCCATATCTATTTAAGCATACCGAAATAATAGTAAGCAGTTAAATTTTATCCTACAATTTTACAAAACTTAAGCAATCATAG ]
[-] EMBL CD090265             [ GAGGTTAGGACGTGCAACCCACTATTTTGAAGACTGATGGCTCTAACGACTACTCTAATGCTAATGGTGTGGATATTTAAGTTTCATTAGGAGAATTAGTAAAAATGTTTAGCGTAATGAAATGATTAGGATCTTCCCTTAAACAACAATTTAGTACTAATCATGGGATCACAAAGTTAATTCAAAGCGTATCTTTTGTAGTGTCACTTTCCATATCTATTTAAGCATACCGAAATAATAGTAAGCAGTTAAATTTTACCCTACAATTTTACAAAACTTAAGCAATCATAGT]


>consensus_5135#0 CGAGGTTAGGACGTGCAACCCACTATTTTGAAGACTGATGGCTCTAACGACTACTCTAAT GCTAATGGTGTGGATATTTAAGTTTCATTAGGAGAATTAGTAAAAATGTTTAGCGTAATG AAATGATTAGGATCTTCCCTTAAACAACAATTTAGTACTAATCATGGGATCACAAAGTTA ATTCAAAGCGTATCTTTTGTAGTGTCACTTTCCATATCTATTTAAGCATACCGAAATAAT AGTAAGCAGTTAAATTTTACCCTACAATTTTACAAAACTTAAGCAATCATAGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)