Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5137 cluster # 5137       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5137#0 length = 540 sequences # 3  

consensusID : consensus_5137#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 540
fasta sequence
                              [GTTTTGAAACTCTATCGTCAGCTGGCAACTGATTTGTTCTGGGTTTGTAAGGTTTTTCGAAGCTCATTTGTAAACGAGGACAATGAAAGCGTGTCAAATGCAAAGTTGTGATATCAGTTCAATTTTCTATGCTTTTTGAATATAACTAATGACTTGTTTGGGGGGAGTTGGCTGTACTCTTATTGGAGTGGGTCCTTGTTTAATTCTTTTCCTATGTACAGTCGCCAATTGTCCAATAAAAGTCATTTTACTCACAGCCAGTGGATTTTTCTGGTTGGTGTCATTACTTATCACATCTGTAATGTGGTTTATAGTTACCCCACTACGAGCTTACCTTGCATTTGGGATTCTTATTGGCGTGTTAATTCAAGAGATTCTACGATTTCTATTCTTTTTATTGATTTTCAAAGCTGAATCCGGCCTTCAGCTGATTGTAAGTAGTTCAACTACTCCTGTTTCAAGACCACAGCTGGTTGATGGAATTAATAACGACAACATTATTGATAATCCTAGTCCTGGGAGAGAAGCTGAAAGAAATGA]

[-] EMBL CD186295             [GTTTTGAAACTCTATCGTCAGCTGGCAACTGATTTGTTCTGGGTTTGTAAGGTTTTTCGAAGCTCATTTGTAAACGAGGACAATGAAAGCGTGTCAAATGCAAAGTTGTGATATCAGTTCAATTTTCTATGCTTTTTGAATATAACTAATGACTTGTTTGGGGGGAGTTGGCTGTACTCTTATTGGAGTGGGTCCTTGTTTAATTCTTTTCCTATGTACAGTCGCCAATTGTCCAATAAAAGTCATTTTACTCACAGCCAGTGGATTTTTCTGGTTGGTGTCATTACTTATCACATCTGTAATGTGGTTT                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD197014             [                                                                                                                                                                         GGCTGTACTCTTATTGGAGTGGGTCCTTGTTTAATTCTTTTCCTATGTACAGTCGCCAATTGTCCAATAAAAGTCATTTTACTCACAGCCAGTGGATTTTTCTGGTTGGTGTCATTACTTATCACATCTGTAATGTGGTTTATAGTTACCCCACTACGAGCTTACCTTGCATTTGGGATTCTTATTGGCGTGTTAATTCAAGAGATTCTACGATTTCTATTCTTTTTATTGATTTTCAAAGCTGAATCCGGCCTTCAGCTGATTGTAAGTAGTTCAACTACTCCTGTTTCAAGACCACAGCTGGTTGATGGAATTAATAACGACAACATTATTGATAATCCTAGTCCTGGGAGAGAAGCTGAAAGAAATGA]
[+] EMBL CD196970             [                                                                                                                                                                         GGCTGTACTCTTATTGGAGTGGGTCCTTGTTTAATTCTTTTCCTATGTACAGTCGCCAATTGTCCAATAAAAGTCATTTTACTCACAGCCAGTGGATTTTTCTGGTTGGTGTCATTACTTATCACATCTGTAATGTGGTTTATAGTTACCCCACTACGAGCTTACCTTGCATTTGGGATTCTTATTGGCGTGTTAATTCAAGAGATTCTACGATTTCTATTCTTTTTATTGATTTTCAAAGCTGAATCCGGCCTTCAGCTGATTGTAAGTAGTTCAACTACTCCTGTTTCAAGACCACAGCTGGTTGATGGAATTAATAACGACAACATTATTGATAATCATAGTCC                        ]


>consensus_5137#0 GTTTTGAAACTCTATCGTCAGCTGGCAACTGATTTGTTCTGGGTTTGTAAGGTTTTTCGA AGCTCATTTGTAAACGAGGACAATGAAAGCGTGTCAAATGCAAAGTTGTGATATCAGTTC AATTTTCTATGCTTTTTGAATATAACTAATGACTTGTTTGGGGGGAGTTGGCTGTACTCT TATTGGAGTGGGTCCTTGTTTAATTCTTTTCCTATGTACAGTCGCCAATTGTCCAATAAA AGTCATTTTACTCACAGCCAGTGGATTTTTCTGGTTGGTGTCATTACTTATCACATCTGT AATGTGGTTTATAGTTACCCCACTACGAGCTTACCTTGCATTTGGGATTCTTATTGGCGT GTTAATTCAAGAGATTCTACGATTTCTATTCTTTTTATTGATTTTCAAAGCTGAATCCGG CCTTCAGCTGATTGTAAGTAGTTCAACTACTCCTGTTTCAAGACCACAGCTGGTTGATGG AATTAATAACGACAACATTATTGATAATCCTAGTCCTGGGAGAGAAGCTGAAAGAAATGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)