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Schistosoma mansoni
cluster # 5144 cluster # 5144       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5144#0 length = 1052 sequences # 3  

consensusID : consensus_5144#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1052
fasta sequence
                              [GAATAAAGAAAAAAATTATGTTGGACAACAAAAAAACCACTGGGAAAACGGCGTAGTATGGGATGAAAAATTTTTCATAAAAAATGGACAAATTTATCATGAATATATCAAGTACTTGCAACATTCTATCAACATGATTTTACTATTGATCAAAGAACAATTTCAACATCATTCCGAATACTTGAATGTGGATGAGAATAATTTTGAGGCTAATTACTTGCTTATGGCATACGAATTTGATCAATGTTATTCTGATTATGACAATCGTTTACTTAATCAAACTGTGCAACATTGTTTGAAACCTATATTCGATAAATTATGGCACTATGCACAGTTAGCACATTTAACCGATAATAAACTCCAAGCTTTTATAAACATTTATGTTCCAGGAATTATGAATCCGAAGGATGATGGGATATTATTAATGCCATTATCACCCCAGTCTAGGCCCATTAAACTCCATCTAGGTGTTGTCTTGAAGTTTGTAAAACATCTTACGGATGAAAATTATTCGTTATCGCTTCTGTATATTTCTAATCCACAACATCATACTGAATTAATTAGTGAACTGGATTCAGTTTTTAAAAACTATCTATTGCATGGTGAAAAAGCTTTAACTGATATTTTAGCCAGCTCTAGTATCAAAGAAAAAGTATTCGGTTCATCGTCATTTATTCATAAAGAACATATACAAAATGCAATACAAAGTGCATTTGACTGGCTGTATTATTGGAGTATATTAAAACCCATTTCATCTGAATATAGTTTTGTAATTGGTTATAGTATGACATTGGGTATGCTGCGCGCCCTTGGTCTAGAACCAGTTGCTGCTTTACTAAAACATGGAATAGATTTGGAAATGGAGTCAATATTTATTGGTTCACCTACACAATTTGGTAATATATGTCGGGAAGTCCTAGGCCTAGTGGAGTTACCAAAATCAAGTATTTCGTTATCATGGAAAGTTTCTCCAGAAGAAATTATCAAGAGTCCAAAACATGTTTTAGAATTTTTGAATTTACAGTTAGTATCTCATTGTGATAAATAAAAAA]

[+] EMBL CD078278             [GAATAAAGAAAAAAATTATGTTGGACAACAAAAAAACCACTGGGAAAACGGCGTAGTATGGGATGAAAAATTTTTCATAAAAAATGGACAAATTTATCATGAATATATCAAGTACTTGCAACATTCTATCAACATGATTTTACTATTGATCAAAGAACAATTTCAACATCATTCCGAATACTTGAATGTGGATGAGAATAATTTTGAGGCTAATTACTTGCTTATGGCATACGAATTTGATCAATGTTATTCTGATTATGACAATCGTTTACTTAATCAAACTGTGCAACATTGTTTGAAACCTATATTCGATAAATTATGGCACTATGCACAGTTAGCACATTTAACCGATAATAAACTCCAAGCTTTTATAAACATTTATGTTCCAGGAATTATGAATCCGAAGGATGATGGGATATTATTAATGCCATTATCACCCCAGTCTAGGCCCATTAAACTCCATCTAGGTGTTGTCTTGAAGTTTGTAAAACATCTTACGGATGAAAATTATTCGTTATCGCTTCTGTATATTTCTAATCCACAACATCATACTGAATTAATTAGTGAACTGGATTCAGTTNTTAAAAACTATCTATTGCATGGTGAAAAAGCTTTAACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD078362             [GAATAAAGAAAAAAATTATGTTGGACAACAAAAAAACCACTGGGAAAACGGCGTAGTATGGGATGAAAAATTTTTCATAAAAAATGGACAAATTTATCATGAATATATCAAGTACTTGCAACATTCTATCAACATGATTTTACTATTGATCAAAGAACAATTTCAACATCATTCCGAATACTTGAATGTGGATGAGAATAATTTTGAGGCTAATTACTTGCTTATGGCATACGAATTTGATCAATGTTATTCTGATTATGACAATCGTTTACTTAATCAAACTGTGCAACATTGTTTGAAACCTATATTCGATAAATTATGGCACTATGCACAGTTAGCACATTTAACCGATAATAAACTCCAAGCTTTTATAAACATTTATGTTCCAGGAATTATGAATCCGAAGGATGATGGGATATTATTAATGCCATTATCACCCCAGTCTAGGCCCATTAAACTCCATCTAGGTGTTGTCTTGAAGTTTGTAAAACATCTTACGGATGAAAATTATTCGNTATCGCTTCTGTATATTTCTAATCCACAACATCATACTGAATTAATTAGTGAACTGGATTCAGTTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD072921             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AAAACATCTTACGGATGAAAATTATTCGTTATCGCTTCTGTATATTTCTAATCCACAACATCATACTGAATTAATTAGTGAACTGGATTCAGTTTTTAAAAACTATCTATTGCATGGTGAAAAAGCTTTAACTGATATTTTAGCCAGCTCTAGTATCAAAGAAAAAGTATTCGGTTCATCGTCATTTATTCATAAAGAACATATACAAAATGCAATACAAAGTGCATTTGACTGGCTGTATTATTGGAGTATATTAAAACCCATTTCATCTGAATATAGTTTTGTAATTGGTTATAGTATGACATTGGGTATGCTGCGCGCCCTTGGTCTAGAACCAGTTGCTGCTTTACTAAAACATGGAATAGATTTGGAAATGGAGTCAATATTTATTGGTTCACCTACACAATTTGGTAATATATGTCGGGAAGTCCTAGGCCTAGTGGAGTTACCAAAATCAAGTATTTCGTTATCATGGAAAGTTTCTCCAGAAGAAATTATCAAGAGTCCAAAACATGTTTTAGAATTTTTGAATTTACAGTTAGTATCTCATTGTGATAAATAAAAAA]


>consensus_5144#0 GAATAAAGAAAAAAATTATGTTGGACAACAAAAAAACCACTGGGAAAACGGCGTAGTATG GGATGAAAAATTTTTCATAAAAAATGGACAAATTTATCATGAATATATCAAGTACTTGCA ACATTCTATCAACATGATTTTACTATTGATCAAAGAACAATTTCAACATCATTCCGAATA CTTGAATGTGGATGAGAATAATTTTGAGGCTAATTACTTGCTTATGGCATACGAATTTGA TCAATGTTATTCTGATTATGACAATCGTTTACTTAATCAAACTGTGCAACATTGTTTGAA ACCTATATTCGATAAATTATGGCACTATGCACAGTTAGCACATTTAACCGATAATAAACT CCAAGCTTTTATAAACATTTATGTTCCAGGAATTATGAATCCGAAGGATGATGGGATATT ATTAATGCCATTATCACCCCAGTCTAGGCCCATTAAACTCCATCTAGGTGTTGTCTTGAA GTTTGTAAAACATCTTACGGATGAAAATTATTCGTTATCGCTTCTGTATATTTCTAATCC ACAACATCATACTGAATTAATTAGTGAACTGGATTCAGTTTTTAAAAACTATCTATTGCA TGGTGAAAAAGCTTTAACTGATATTTTAGCCAGCTCTAGTATCAAAGAAAAAGTATTCGG TTCATCGTCATTTATTCATAAAGAACATATACAAAATGCAATACAAAGTGCATTTGACTG GCTGTATTATTGGAGTATATTAAAACCCATTTCATCTGAATATAGTTTTGTAATTGGTTA TAGTATGACATTGGGTATGCTGCGCGCCCTTGGTCTAGAACCAGTTGCTGCTTTACTAAA ACATGGAATAGATTTGGAAATGGAGTCAATATTTATTGGTTCACCTACACAATTTGGTAA TATATGTCGGGAAGTCCTAGGCCTAGTGGAGTTACCAAAATCAAGTATTTCGTTATCATG GAAAGTTTCTCCAGAAGAAATTATCAAGAGTCCAAAACATGTTTTAGAATTTTTGAATTT ACAGTTAGTATCTCATTGTGATAAATAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)