cluster # 5186

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Schistosoma mansoni
cluster # 5186 cluster # 5186 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5186#0 length = 924 sequences # 3

consensusID : consensus_5186#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 924
fasta sequence

                              [CCCACAGAAACAGCTAGATTTCATCAGTCTCATATTATTGAACTTGTTCAGAAAGCCATTAAAGAAGCGAGAGTTGACCCTTCCGAATTGGATGCTGTTGCTTACACTAAGGGTCCTGGTATGGGTGCTCCTCTTCTCACTGTTGCAGTAGTTGCTCGTACTCTTGCTCAATTATGGAATAAACCTTTAATTGGAGTTAATCATTGCATAGCACATATTGAAATGGGTCGTCTTATCACTGGTGCAAAGTCCCCCATCATATTGTACGTCAGCGGTGGTAATACACAAATTATTGCTTTTGTTTCTGGGCGTTATCGAATATTCGGAGAAACGATCGATATAGCATTGGGAAATTGTTTTGATAGGTTTGCCCGTATTGTAAATCTTTCGAATGATCCAAGTCCTGGCTTTAACATTGAGAAGTTAGCCAAACAAGGATCCAAATTTTTCGAGTTGCCATATGCAGTGAAGGGTATGGATGTTTCTTTTGCAGGATTATTATCATTTTTGGAAGAGCGTGCACCGAAACTTTTAGAAACTGGTGAATACACTGTGGCTGATTTATGCTTTAGCCTCCAAGAGACAGCTTTTGCTATGGTTGTAGAAATTACTGAACGGGCTATGGCACATTGTGGTGTAGACGAGGTCCTCATTGTCGGTGGCGTTGGTTGCAACGTGCGTCTACAGGAAATGATGAACTGCATGGCTGAAGAGCGTGGTGCTAAATTATTCGCAACAGATGAGAGATTTTGTATTGATAATGGTGCTATGATAGCACATACTGGATGCCTAATGTTTGATGCCGGTTTGACTTTTCCGCTGAAAGACTCTGTCGTGTCTCAACGCTATCGTACAGATGCTGTTGATGCAATTTGGCGTGATGAATAACATCTCCCATATGTATATATTTTCAAATATATTGTT]

[+] EMBL BF937021             [CCCACAGAAACAGCTAGATTTCATCAGTCTCATATTATTGAACTTGTTCAGAAAGCCATTAAAGAAGCGAGAGTTGACCCTTCCGAATTGGATGCTGTTGCTTACACTAAGGGTCCTGGTATGGGTGCTCCTCTTCTCACTGTTGCAGTAGTTGCTCGTACTCTTGCTCAATTATGGAATAAACCTTTAATTGGAGTTAATCATTGCATAGCACATATTGAAATGGGTCGTCTTATCACTGGTGCAAAGTCCCCCATCATATTGTACGTCAGCGGTGGTAATACACAAATTATTGCTTTTGTTTCTGGGCGTTATCGAATATTCGGAGAAACGATCGATATAGCATTGGGAAATTGTTTTGATAGGTTTGCCCGTATTGTAAATCTTTCGAATGATCCAAGTCCTGGCTTTAACATTGAGAAGTTAGCCAAACAAGGATCCAAATTTTTCGAGTTGCCATATGCAGTGAAGGGTATGGATGTTTCTTTTGCAGGATTATTATCATTTTTGGAAGAGCGTGCACCGAAACTTTTAGAAACTGGTGAATACACTGTGGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD078530             [                                                                                                                                                                                                               ATAGCACATATTGAAATGGGTCGTCTTATCACTGGTGCAAAGTCCCCCATCATATTGTACGTCAGCGGTGGTAATACACAAATTATTGCTTTTGTTTCTGGGCGTTATCGAATATTCGGAGAAACGATCGATATAGCATTGGGAAATTGTTTTGATAGGTTTGCCCGTATTGTAAATCTTTCGAATGATCCAAGTCCTGGCTTTAACATTGAGAAGTTAGCCAAACAAGGATCCAAATTTTTCGAGTTGCCATATGCAGTGAAGGGTATGGATGTTTCTTTTGCAGGATTATTATCATTTTTGGAAGAGCGTGCACCGAAACTTTTAGAAACTGGTGAATACACTGTGGCTGATTTATGCTTTAGCCTCCAAGAGACAGCTTTTGCTATGGTTGTAGAAATTACTGAACGGGCTATGGCACATTGTGGTGTAGACGAGGTCCTCATTGTCGGTGGCGTTGGTTGCAACGTGCGTCTACAGGAAATGATGAACTGCATGGCTGAAGAGCGTGGTGCTAAATTATTCGCAACAGATGAGAGATTTTGTATTGATAATGGTGCTATGATAGCACATACT                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD072999             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCTTTNGAATGATCCAAGTCCTGGCTTTAACATTGAGAAGTTAGCCAAACAAGGATCCAAATTTTTCGAGTTGCCATATGCAGTGAAGGGTATGGATGTTTCTTTTGCAGGATTATTATCATTTTTGGAAGAGCGTGCACCGAAACTTTTAGAAACTGGTGAATACACTGTGGCTGATTTATGCTTTAGCCTCCAAGAGACAGCTTTTGCTATGGTTGTAGAAATTACTGAACGGGCTATGGCACATTGTGGTGTAGACGAGGTCCTCATTGTCGGTGGCGTTGGTTGCAACGTGCGTCTACAGGAAATGATGAACTGCATGGCTGAAGAGCGTGGTGCTAAATTATTCGCAACAGATGAGAGATTTTGTATTGATAATGGTGCTATGATAGCACATACTGGATGCCTAATGTTTGATGCCGGTTTGACTTTTCCGCTGAAAGACTCTGTCGTGTCTCAACGCTATCGTACAGATGCTGTTGATGCAATTTGGCGTGATGAATAACATCTCCCATATGTATATATTTTCAAATATATTGTT]




>consensus_5186#0
CCCACAGAAACAGCTAGATTTCATCAGTCTCATATTATTGAACTTGTTCAGAAAGCCATT
AAAGAAGCGAGAGTTGACCCTTCCGAATTGGATGCTGTTGCTTACACTAAGGGTCCTGGT
ATGGGTGCTCCTCTTCTCACTGTTGCAGTAGTTGCTCGTACTCTTGCTCAATTATGGAAT
AAACCTTTAATTGGAGTTAATCATTGCATAGCACATATTGAAATGGGTCGTCTTATCACT
GGTGCAAAGTCCCCCATCATATTGTACGTCAGCGGTGGTAATACACAAATTATTGCTTTT
GTTTCTGGGCGTTATCGAATATTCGGAGAAACGATCGATATAGCATTGGGAAATTGTTTT
GATAGGTTTGCCCGTATTGTAAATCTTTCGAATGATCCAAGTCCTGGCTTTAACATTGAG
AAGTTAGCCAAACAAGGATCCAAATTTTTCGAGTTGCCATATGCAGTGAAGGGTATGGAT
GTTTCTTTTGCAGGATTATTATCATTTTTGGAAGAGCGTGCACCGAAACTTTTAGAAACT
GGTGAATACACTGTGGCTGATTTATGCTTTAGCCTCCAAGAGACAGCTTTTGCTATGGTT
GTAGAAATTACTGAACGGGCTATGGCACATTGTGGTGTAGACGAGGTCCTCATTGTCGGT
GGCGTTGGTTGCAACGTGCGTCTACAGGAAATGATGAACTGCATGGCTGAAGAGCGTGGT
GCTAAATTATTCGCAACAGATGAGAGATTTTGTATTGATAATGGTGCTATGATAGCACAT
ACTGGATGCCTAATGTTTGATGCCGGTTTGACTTTTCCGCTGAAAGACTCTGTCGTGTCT
CAACGCTATCGTACAGATGCTGTTGATGCAATTTGGCGTGATGAATAACATCTCCCATAT
GTATATATTTTCAAATATATTGTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case