cluster # 5195

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Schistosoma mansoni
cluster # 5195 cluster # 5195 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5195#0 length = 611 sequences # 3

consensusID : consensus_5195#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 611
fasta sequence

                              [TCAGTCCAAAACTATACTGTTGATTCTTAAGTTCATATTGTTATGTATTGTTTGCTTGTTGTTTTGTTACTAATTTTAATCACATTCAGTTATTTGTCGTATTCGTTTGACCTGCTGCTTATACTTGGAAACGGGAACTACTGTAATCCCTAAGACACCAGATAAGAACACATAATACTGGTACAGATGAAGAATTATCGACCTCCAATAAAATATGTCGTCGCTGGACCAAAATACACCTATTTATACTACTGATTCGGACATATACTTAATATCACACACTGGGATATATATATATATATATAGTCACTAAGAAAATACACAATGAATATTGTTCAATTTTCACTGACATCAAGAATATGGACGTTACACATAACGACAGTTGATACCTATCATAGTGAACGAAATTCGTGCTGAATTAGCAAGAAAATTTTAACCTGAAATAAATTCATAATGAAAGAGGGTTCACACATGTCACCCTGGACGAAAATGATACCGAATCTATACAAAAGATATTTGCCTGAAATAATGTTGCTTTTTTTAACTCATCCTATTACTAATCACATAATTAATATTTATTNTTCGGCATTCTTCTATCGTCTATTAACTAA]

[+] EMBL AI976477             [TCAGTCCAAAACTATACTGTTGATTCTTAAGTTCATATTGTTATGTATTGTTTGCTTGTTGTTTTGTTACTAATTTTAATCACATTCAGTTATTTGTCGTATTCGTTTGACCTGCTGCTTATACTTGGAAACGGGAACTACTGTAATCCCTAAGACACCAGATAAGAACACATAATACTGGTACAGATGAAGAATTATCGACCTCCAATAAAATATGTCGTCGCTGGACCAAAATACACCTATTTATACTACTGATTCGGACATATACTTAATATCACACACTGGGATATATATATATATATATAGTCACTAAGAAAATACACAATGAATATTGTTCAATTTTCACTGACATCAAGAATATGGACGTTACACATAACGACAGTTGATACCTATCATAGTGAACGAAATTCGTGCTGAATTAGCAAGAAAATTTTAACCTGAAATAAATTCATAATGAAAGAGGGTTCACACATGTCACCCTGGACGAAAATGATACCGAATCTATACAAAAGATATTTGCCTGAAATAATGTTGCTTTTTTTAACTCATCCTATTACTAATCACATAATTAATATTTATTNTTCGGCATTCTTCTATCGTCTATTAACTAA]
[+] EMBL AI975806             [TCAGTCCAAAACTATACTGTTGATTCTTAAGTTCATATTGTTATGTATTGTTTGCTTGTTGTTTTGTTACTAATTTTAATCACATTCAGTTATTTGTCGTATTCGTTTGACCTGCTGCTTATACTTGGAAACGGGAACTACTGTAATCCCTAAGACACCAGATAAGAACACATAATACTGGTACAGATGAAGAATTATCGACCTCCAATAAAATATGTCGTCGCTGGACCAAAATACACCTATTTATACTACTGATTCGGACATATACTTAATATCACACACTGGGATATATATATATATATATAGTCACTAAGAAAATACACAATGAATATTGTTCAATTTTCACTGACATCAAGAATATGGACGTTACACATAACGACAGTTGATACCTATCATAGTGAACGAAATTCGTGCTGAATTAGCAAGAAAATTTTAACCTG AATANATTCATAATGAAAGAGGGTTCACACATGTCACCCTGGACGAAAATGATACCGAATCTA                                                                                                           ]
[+] EMBL BF936494             [TCAGTCCAAAACTATACTGGTGATTCTTAAGTTCATATTGTTATGTATTGTTTGCTTGTTGTTTTGTTACTAATTTTAATCACATTCAGTTATTTGTCGTATTCGTTTGACCTGCTGCTTATACTTGGAAACGGGAACTACTGTAATCCCTAAGACACCAGATTAGAACACATAATACTGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]




>consensus_5195#0
TCAGTCCAAAACTATACTGTTGATTCTTAAGTTCATATTGTTATGTATTGTTTGCTTGTT
GTTTTGTTACTAATTTTAATCACATTCAGTTATTTGTCGTATTCGTTTGACCTGCTGCTT
ATACTTGGAAACGGGAACTACTGTAATCCCTAAGACACCAGATAAGAACACATAATACTG
GTACAGATGAAGAATTATCGACCTCCAATAAAATATGTCGTCGCTGGACCAAAATACACC
TATTTATACTACTGATTCGGACATATACTTAATATCACACACTGGGATATATATATATAT
ATATAGTCACTAAGAAAATACACAATGAATATTGTTCAATTTTCACTGACATCAAGAATA
TGGACGTTACACATAACGACAGTTGATACCTATCATAGTGAACGAAATTCGTGCTGAATT
AGCAAGAAAATTTTAACCTGAAATAAATTCATAATGAAAGAGGGTTCACACATGTCACCC
TGGACGAAAATGATACCGAATCTATACAAAAGATATTTGCCTGAAATAATGTTGCTTTTT
TTAACTCATCCTATTACTAATCACATAATTAATATTTATTNTTCGGCATTCTTCTATCGT
CTATTAACTAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case