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Schistosoma mansoni
cluster # 5201 cluster # 5201       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5201#0 length = 661 sequences # 3  

consensusID : consensus_5201#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 661
fasta sequence
                              [TATACACACAAAAACATTGATGAAAAGTGATGTAAGCAAAGATGAACCAATAACAAACAGCACAATGTAAGGGTGATGTACTTGGTATAGTATTCAAAATTTAGAAAAATAACTGACTTTTCGACAGGTACTTTGGAATGAATAAATTTTCAGTAAACTTTGAATATTCATTGTCTGAAAATGTATGACTTTTGATAAAAACGAAATTGTATTGACATGTTTAGCAAGTTGTTATCTCTAACAGAGAATGAAATGATAAAAACCTTATATTATGATGTATAAATATAGGGAAAGTTTGTATCCTGAAGGGAAAAATAAGGTCTCTGGGTAAATCTATTACAAGGAAATTATGTACTTTATCATACTTCAAATGTACTTCAAAGACTTCAGTGTATATTGGATGACATTACAAACGACCAATGATGCTATTTATTATGTT-GGAAAATGATATGAATGATTGTGCAATTCCAAAAGATAATCTAATCTGTTACACAAATCACTTTGACAGACAACATGCATAAACACAATGGAAATAATGATTAGCATTAAATATTGGAGTTGATTTAATTCTCGGTCCACAACAACTTATTTACTGGCTGCCTGTGATTTCTCTGATTGTATCGGTGTTGGTACAGTGGTTGTAGTCGTAATGGTCAATGTT]

[+] EMBL CD144679             [TATACACACAAAAACATTGATGAAAAGTGATGTAAGCAAAGATGAACCAATAACAAACAGCACAATGTAAGGGTGATGTACTTGGTATAGTATTCAAAATTTAGAAAAATAACTGACTTTTCGACAGGTACTTTGGAATGAATAAATTTTCAGTAAACTTTGAATATTCATTGTCTGAAAATGTATGACTTTTGATAAAAACGAAATTGTATTGACATGTTTAGCAAGTTGTTATCTCTAACAGAGAATGAAATGATAAAAACCTTATATTATGATGTATAAATATAGGGAAAGTTTGTATCCTGAAGGGAAAAATAAGGTCTCTGGGTAAATCTATTACAAGGAAATTATGTACTTTATCATACTTCAAATGTACTTCAAAGACTTCAGTGTATATTGGATGACATTACAAACGACCAATGATGCTATTTATTATGTT GGAAAATGATATGAATGATTGTGCAATTCCAAAAGATAATCTAATCTGTTACACAAATCACTTTGACAGACAACATGCATAAACACAATGGAAATAATGATTAGCATTAAATATTGGAGTTGATTTAATTCTCGGTCCACAACAACTTATTTACTGGCTGCCTGTGATTTCTCTGATTGTATCGGTGTTGGTACAGTGGTTGTAGTCGTAATGGTC      ]
[+] EMBL CD200580             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aACAAGGAAATTATGTACTTTATCATACTTCAAATGTACTTCAAAGACTTCAGTGTATATTGGATGACATTACAAACGACCAATGATGCTATTTATTATGTTAGGAAAATGATATGAATGATTGTGCACTTCCAAAAGA AGTCTAATCTGTTACACAAATGACTTGGACAGACAACATGCATAAACACAATGGAAATAATGATTAGCATTAAATATTGGAGTTGATTTAATTCTCGGTCCACAACAACTTATTTACTGGCCG CTGTGTACACTCTGATTGTATCGGTGTTGGTACAGTGGTTGTAGTCGTAGTGGTCAATGTT]
[+] EMBL CD061083             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATATGAATGATTGTGCAATTCCAAAAGATAATCTAATCTGTTACACAAATCACTTTGACAGAGAACATGCGTAAACACAATGGAAATAATGATTAGCATTAAATATTGGAGTTGATTTAATTCTTGGTCCACAACAACTTAT                                                                        ]


>consensus_5201#0 TATACACACAAAAACATTGATGAAAAGTGATGTAAGCAAAGATGAACCAATAACAAACAG CACAATGTAAGGGTGATGTACTTGGTATAGTATTCAAAATTTAGAAAAATAACTGACTTT TCGACAGGTACTTTGGAATGAATAAATTTTCAGTAAACTTTGAATATTCATTGTCTGAAA ATGTATGACTTTTGATAAAAACGAAATTGTATTGACATGTTTAGCAAGTTGTTATCTCTA ACAGAGAATGAAATGATAAAAACCTTATATTATGATGTATAAATATAGGGAAAGTTTGTA TCCTGAAGGGAAAAATAAGGTCTCTGGGTAAATCTATTACAAGGAAATTATGTACTTTAT CATACTTCAAATGTACTTCAAAGACTTCAGTGTATATTGGATGACATTACAAACGACCAA TGATGCTATTTATTATGTTGGAAAATGATATGAATGATTGTGCAATTCCAAAAGATAATC TAATCTGTTACACAAATCACTTTGACAGACAACATGCATAAACACAATGGAAATAATGAT TAGCATTAAATATTGGAGTTGATTTAATTCTCGGTCCACAACAACTTATTTACTGGCTGC CTGTGATTTCTCTGATTGTATCGGTGTTGGTACAGTGGTTGTAGTCGTAATGGTCAATGT T



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)