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Schistosoma mansoni
cluster # 5233 cluster # 5233       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5233#0 length = 929 sequences # 3  

consensusID : consensus_5233#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 929
fasta sequence
                              [CGAGATTTTGCATTATGTAAACTGTTATATGAATAGTTTTAGTAGTTTTTTCATTATCGAGCTAAAATTTACTCTACTGAGCAAATTGTATCATTAAGATTCGTCACTTAACCTTAGCTCCGCAAACTCAGGAGCCATGTACACGGTTGTGTTCGATTCTGTGGTCATTAATTGACTGACTCAGTTACCAGATTTGTGACTTATTATCATTAGTTTCATGTATAGTCATTGTCCAACCAGTGAGGAGACCGATTTTGAGGTAAATAACGTCTTACTTAGTGTTTTCCACTAATATCAAACTTATATGTATATAACTTGCACACTATATCTACCTCAACATTTCTCCTATTCATATATTCTGTTTATTTTATTCTCAGGGTGGTGATCGTGCTCAATTAAATGCTCTACTTCAACATGAAAAGAGCCTTAATCCGGATCGCATCCCTTATTTTTTGAGTTCAACAAAAGAACGTCCCGGTTATTTCATTCTTGCTTATTTACCTAATAAGAATCCACATTTTGAATTATTTAGCATACGACCTGAAGGTTTCAAGTTTCGCCAGTTAATATTCCCAACTCTCGACCGAATGATTACTTGGTTCAAAGAACACTATAATGACGCTGTAAATTACTATCGCGGTTGAGTCGGTCTATTCTCAGGATGCTTTATTTCTAGTCTACATTTCTTTATTGCTGAATTCAATTTCACATAAATATTAACTTTTCTCAAAATCTTACTTAAAGCTTTGTCAATTTCCACTTCAAGTTTTTATTACGAATTATTAACACTTGTAAATATCCCTAAGCAATGTTCACAAGTTTCCACAATGTTACCGTATTGTTTTTTTAGTATATGTACAACTGAATAATAATACGTACAAAGGAATTAAATGAACGAAGTTGAATTTATATATTTTGATACAAGATGT]

[+] EMBL CD078634             [CGAGATTTTGCATTATGTAAACTGTTATATGAATAGTTTTAGTAGTTTTTTCATTATCGAGCTAAAATTTACTCTACTGAGCAAATTGTATCATTAAGATTCGTCACTTAACCTTAGCTCCGCAAACTCAGGAGCCATGTACACGGTTGTGTTCGATTCTGTGGTCATTAATTGACTGACTCAGTTACCAGATTTGTGACTTATTATCATTAGTTTCATGTATAGTCATTGTCCAACCAGTGAGGAGACCGATTTTGAGGTAAATAACGTCTTACTTAGTGTTTTCCACTAATATCAAACTTATATGTATATAACTTGCACACTATATCTACCTCAACATTTCTCCTATTCATATATTCTGTTTATTTTATTCTCAGGGTGGTGATCGTGCTCAATTAAATGCTCTACTTCAACATGAAAAGAGCCTTAATCCGGATCGCATCCCTTATTTTTTGAGTTCAACAAAAGAACGTCCCGGTTATTTCATTCTTGCTTATTTACCTAATAAGAATCCACATTTTGAATTATTTAGCATACGACCTGAAGGTTCCAAGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD076596             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTGGTGATCGTGCTCAATTAAATGCTCTACTTCAACATGAAAAGAGCCTTAATCCGGATCGCATCCCTTATTTTTTGAGTTCAACAAAAGAACGTCCCGGTTATTTCATTCTTGCTTATTTACCTAATAAGAATCCACATTTTGAATTATTTAGCATACGACCTGAAGGTTTCAAGTTTCGCCAGTTAATATTCCCAACTCTCGACCGAATGATTACTTGGTTCAAAGAACACTATAATGACGCTGTAAATTACTATCGCGGTTGAGTCGGTCTATTCTCAGGATGCTTTATTTCTAGTCTACATTTCTTTATTGCTGAATTCAATTTCACATAAATATTAACTTTTCTCAAAATCTTACTTAAAGCTTTGTCAATTTCCACTTCAAGTTTTTATTACGAATTATTAACACTTGTAAATATCCCTAAGCAATGTTCACAAGTTTCCACAATGTTACCGTATTGTTTTTTTAGTATATGTACAACTGAATAATAATACGTACAAAGGAATTAAATGAACGAAGTTGAATTTATATATTTTGATACAAGATGT]
[-] EMBL CD073098             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GCATCCCTTATTTTTTGAGTTCAACAAAAGAACGTCCCGGTTATTTCATTCTTGCTTATTTACCTAATAAGAATCCACATTTTGAATTATTTAGCATACGACCTGAAGGTTTCAAGTTTCGCCAGTTAATATTCCCAACTCTCGACCGAATGATTACTTGGTTCAAAGAACACTATAATGACGCTGTAAATTACTATCGCGGTTGAGTCGGTCTATTCTCAGGATGCTTTATTTCTAGTCTACATTTCTTTATTGCTGAATTCAATTTCACATAAATATTAACTTTTCTCAAAATCTTACTTAAAGCTTTGTCAATTTCCACTTCAAGTTTTTATTACGAATTATTAACACTTGTAAATATCCCTAAGCAATGTTCACAAGTTTCCACAATGTTACCGTATTGTTTTTTTAGTATATGTACAACTGAATAATAATACGTACAAAGGAATTAAATGAACGAAGTTGAATTTATATATTTTGATACAAGATGT]


>consensus_5233#0 CGAGATTTTGCATTATGTAAACTGTTATATGAATAGTTTTAGTAGTTTTTTCATTATCGA GCTAAAATTTACTCTACTGAGCAAATTGTATCATTAAGATTCGTCACTTAACCTTAGCTC CGCAAACTCAGGAGCCATGTACACGGTTGTGTTCGATTCTGTGGTCATTAATTGACTGAC TCAGTTACCAGATTTGTGACTTATTATCATTAGTTTCATGTATAGTCATTGTCCAACCAG TGAGGAGACCGATTTTGAGGTAAATAACGTCTTACTTAGTGTTTTCCACTAATATCAAAC TTATATGTATATAACTTGCACACTATATCTACCTCAACATTTCTCCTATTCATATATTCT GTTTATTTTATTCTCAGGGTGGTGATCGTGCTCAATTAAATGCTCTACTTCAACATGAAA AGAGCCTTAATCCGGATCGCATCCCTTATTTTTTGAGTTCAACAAAAGAACGTCCCGGTT ATTTCATTCTTGCTTATTTACCTAATAAGAATCCACATTTTGAATTATTTAGCATACGAC CTGAAGGTTTCAAGTTTCGCCAGTTAATATTCCCAACTCTCGACCGAATGATTACTTGGT TCAAAGAACACTATAATGACGCTGTAAATTACTATCGCGGTTGAGTCGGTCTATTCTCAG GATGCTTTATTTCTAGTCTACATTTCTTTATTGCTGAATTCAATTTCACATAAATATTAA CTTTTCTCAAAATCTTACTTAAAGCTTTGTCAATTTCCACTTCAAGTTTTTATTACGAAT TATTAACACTTGTAAATATCCCTAAGCAATGTTCACAAGTTTCCACAATGTTACCGTATT GTTTTTTTAGTATATGTACAACTGAATAATAATACGTACAAAGGAATTAAATGAACGAAG TTGAATTTATATATTTTGATACAAGATGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)