These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5233#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 929 fasta sequence [CGAGATTTTGCATTATGTAAACTGTTATATGAATAGTTTTAGTAGTTTTTTCATTATCGAGCTAAAATTTACTCTACTGAGCAAATTGTATCATTAAGATTCGTCACTTAACCTTAGCTCCGCAAACTCAGGAGCCATGTACACGGTTGTGTTCGATTCTGTGGTCATTAATTGACTGACTCAGTTACCAGATTTGTGACTTATTATCATTAGTTTCATGTATAGTCATTGTCCAACCAGTGAGGAGACCGATTTTGAGGTAAATAACGTCTTACTTAGTGTTTTCCACTAATATCAAACTTATATGTATATAACTTGCACACTATATCTACCTCAACATTTCTCCTATTCATATATTCTGTTTATTTTATTCTCAGGGTGGTGATCGTGCTCAATTAAATGCTCTACTTCAACATGAAAAGAGCCTTAATCCGGATCGCATCCCTTATTTTTTGAGTTCAACAAAAGAACGTCCCGGTTATTTCATTCTTGCTTATTTACCTAATAAGAATCCACATTTTGAATTATTTAGCATACGACCTGAAGGTTTCAAGTTTCGCCAGTTAATATTCCCAACTCTCGACCGAATGATTACTTGGTTCAAAGAACACTATAATGACGCTGTAAATTACTATCGCGGTTGAGTCGGTCTATTCTCAGGATGCTTTATTTCTAGTCTACATTTCTTTATTGCTGAATTCAATTTCACATAAATATTAACTTTTCTCAAAATCTTACTTAAAGCTTTGTCAATTTCCACTTCAAGTTTTTATTACGAATTATTAACACTTGTAAATATCCCTAAGCAATGTTCACAAGTTTCCACAATGTTACCGTATTGTTTTTTTAGTATATGTACAACTGAATAATAATACGTACAAAGGAATTAAATGAACGAAGTTGAATTTATATATTTTGATACAAGATGT] [+] EMBL CD078634 [CGAGATTTTGCATTATGTAAACTGTTATATGAATAGTTTTAGTAGTTTTTTCATTATCGAGCTAAAATTTACTCTACTGAGCAAATTGTATCATTAAGATTCGTCACTTAACCTTAGCTCCGCAAACTCAGGAGCCATGTACACGGTTGTGTTCGATTCTGTGGTCATTAATTGACTGACTCAGTTACCAGATTTGTGACTTATTATCATTAGTTTCATGTATAGTCATTGTCCAACCAGTGAGGAGACCGATTTTGAGGTAAATAACGTCTTACTTAGTGTTTTCCACTAATATCAAACTTATATGTATATAACTTGCACACTATATCTACCTCAACATTTCTCCTATTCATATATTCTGTTTATTTTATTCTCAGGGTGGTGATCGTGCTCAATTAAATGCTCTACTTCAACATGAAAAGAGCCTTAATCCGGATCGCATCCCTTATTTTTTGAGTTCAACAAAAGAACGTCCCGGTTATTTCATTCTTGCTTATTTACCTAATAAGAATCCACATTTTGAATTATTTAGCATACGACCTGAAGGTTCCAAGTT ] [-] EMBL CD076596 [ GTGGTGATCGTGCTCAATTAAATGCTCTACTTCAACATGAAAAGAGCCTTAATCCGGATCGCATCCCTTATTTTTTGAGTTCAACAAAAGAACGTCCCGGTTATTTCATTCTTGCTTATTTACCTAATAAGAATCCACATTTTGAATTATTTAGCATACGACCTGAAGGTTTCAAGTTTCGCCAGTTAATATTCCCAACTCTCGACCGAATGATTACTTGGTTCAAAGAACACTATAATGACGCTGTAAATTACTATCGCGGTTGAGTCGGTCTATTCTCAGGATGCTTTATTTCTAGTCTACATTTCTTTATTGCTGAATTCAATTTCACATAAATATTAACTTTTCTCAAAATCTTACTTAAAGCTTTGTCAATTTCCACTTCAAGTTTTTATTACGAATTATTAACACTTGTAAATATCCCTAAGCAATGTTCACAAGTTTCCACAATGTTACCGTATTGTTTTTTTAGTATATGTACAACTGAATAATAATACGTACAAAGGAATTAAATGAACGAAGTTGAATTTATATATTTTGATACAAGATGT] [-] EMBL CD073098 [ GCATCCCTTATTTTTTGAGTTCAACAAAAGAACGTCCCGGTTATTTCATTCTTGCTTATTTACCTAATAAGAATCCACATTTTGAATTATTTAGCATACGACCTGAAGGTTTCAAGTTTCGCCAGTTAATATTCCCAACTCTCGACCGAATGATTACTTGGTTCAAAGAACACTATAATGACGCTGTAAATTACTATCGCGGTTGAGTCGGTCTATTCTCAGGATGCTTTATTTCTAGTCTACATTTCTTTATTGCTGAATTCAATTTCACATAAATATTAACTTTTCTCAAAATCTTACTTAAAGCTTTGTCAATTTCCACTTCAAGTTTTTATTACGAATTATTAACACTTGTAAATATCCCTAAGCAATGTTCACAAGTTTCCACAATGTTACCGTATTGTTTTTTTAGTATATGTACAACTGAATAATAATACGTACAAAGGAATTAAATGAACGAAGTTGAATTTATATATTTTGATACAAGATGT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||