cluster # 5246

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Schistosoma mansoni
cluster # 5246 cluster # 5246 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5246#0 length = 612 sequences # 3

consensusID : consensus_5246#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 612
fasta sequence

                              [CTCAAAGGGGTGACGGTAATACTATTAAGTTTCCGTGCTTATTGTTGACTATCGTGGTTGGTAATCGGATACCATTATAAATCAATTTATGTTCGGATCTTTTAAAATAATCCTTTGTTGTGGATTTTAAAGTCTGCAAACACAGTATCACTTAACTTCATTTCACCCACCGCAATGACAAATAAAATAAAATCTTAAAGTTTCCGCAATTGCATGTTCAACGCCGAATTTATTCCTACCTACATGATGATTATTCGGGGTAGATCATCAAAAAGTCGAATTCATCTGCATAATTATCTCTTCCTATTGTTAACTTTTAAATTTATTACAATTATTATTTCCTTTAAGAGTTATAATGCGATTCTGTGCTTCCATTCGTCTAAGCTAATGAATAATTATGTACTGTAAAGTACAGCTTGCTACGTAGAAAACGAAATACTGAGATCCATGTACTAGTAATTATTAGTAAATAGATCCCAGTATAACCTAACAGTTTTATGAAAAATCATTTAGCGATAGAAAATGATTAACAGAGATACAGTGATAGACCTGGATATTTTAATCAATTATACTATAGCTCATATGTAAGCAATGGCAAAATTAGATGCGTTT]

[+] EMBL AI975540             [CTCAAAGGGGTGACGGTAATACTATTAAGTTTCCGTGCTTATTGTTGACTATCGTGGTTGGTAATCGGATACCATTATAAATCAATTTATGTTCGGATCTTTTAAAATAATCCTTTGTTGTGGATTTTAAAGTCTGCAAACACAGTATCACTTAACTTCATTTCACCCACCGCAATGACAAATAAAATAAAATCTTAAAGTTTCCGCAATTGCATGTTCAACGCCGAATTTATTCCTACCTACATGATGATTATTCGGGGTAGATCATCAAAAAGTCGAATTCATCTGCATAATTATCTCTTCCTATTGTTAACTTTTAAATTTATTACAATTATTATTTCCTTTAAGAGTTATAATGCGATTCTGTGCTTCCATTCGTCTAAGCTAATGAATAATTATGTACTGTAAAGTACAGCTTGCTACGTAGAAAACGAAATACTGAGATCCATGTACTAGTAATTATTAGTAAATAGATCCCAGTATAACCTAACAGTTTTATGAAAAATCATTTAGCGATAGAAAATGATTAACAGAGATACAGTGATAGACCTGGATATTTTAATCAATTATACTATAGCTCATATGTAAGCAATGGCAAAATTAGATGCGTTT]
[+] EMBL AI975100             [CTCAAAGGGGTGACGGTAATACTATTAAGTTTCCGTGCTTATTGTTGACTATCGTGGTTGGTAATCGGATACCATTATAAATCAATTTATGTTCGGATCTTTTAAAATAATCCTTTGTTGTGGATTTTAAAGTCTGCAAACACAGTATCACTTAACTTCATTTCACCCACCGCAATGACAAATAAAATAAAATCTTAAAGTTTCCGCAATTGCATGTTCAACGCCGAATTTATTCCTACCTACATGATGATTATTCGGGGTAGATCATCAAAAAGTCGAATTCATCTGCATAATTATCTCTTCCTATTGTTAACTTTTAAATTTATTACAATTATTATTTCCTTTAAGAGTTATAATGCGATTCTGTGCTTCCATTCGTCTAAGCTAATGAATAATTATGTACTGTAAAGTACAGCTTGCTACGTAGAAAACGAAATACTGAGATCCATGTACTAGTAATTATTAGTAAATAGATCCCAGTATAACCTAA                                                                                                                          ]
[+] EMBL BF936531             [CTCAAAGGGGTGACGGTAATACTATTAAGTTTCCGTGCTTATTGTTGACTATCGTGGTTGGTAATCGGATACCATTATAAATCAATTTATGTTCGGATCTTTTAAAATAATCCTTTGTTGTGGATTTTAAAGTCTGCAAACACAGTATCACTTAACTTCATTTCACCCACCGCAATGACAAATAAAATAAAATCTTAAAGTTTCCGCAATTGCATGTTCAACGCCGAATTTATTCCTACCTACATGATGATTATTCGGGGTAGATCATCAAAAAGTCGAATTCATCTGCATAATTATCTCTTCCTATTGTTAACTTTTAAATTTATTACAATTATTATTTCCTTTAAGAGTTATAATGCGATTCTGTGCTTCCATTCGTCTAAGCTAATGAATAATTATGTACTGTAAAGTACAGCTTGCTACGTAGAAAACGAAATACTGAGATCCATGTACTAGTAATTATTAGTAAAT                                                                                                                                             ]




>consensus_5246#0
CTCAAAGGGGTGACGGTAATACTATTAAGTTTCCGTGCTTATTGTTGACTATCGTGGTTG
GTAATCGGATACCATTATAAATCAATTTATGTTCGGATCTTTTAAAATAATCCTTTGTTG
TGGATTTTAAAGTCTGCAAACACAGTATCACTTAACTTCATTTCACCCACCGCAATGACA
AATAAAATAAAATCTTAAAGTTTCCGCAATTGCATGTTCAACGCCGAATTTATTCCTACC
TACATGATGATTATTCGGGGTAGATCATCAAAAAGTCGAATTCATCTGCATAATTATCTC
TTCCTATTGTTAACTTTTAAATTTATTACAATTATTATTTCCTTTAAGAGTTATAATGCG
ATTCTGTGCTTCCATTCGTCTAAGCTAATGAATAATTATGTACTGTAAAGTACAGCTTGC
TACGTAGAAAACGAAATACTGAGATCCATGTACTAGTAATTATTAGTAAATAGATCCCAG
TATAACCTAACAGTTTTATGAAAAATCATTTAGCGATAGAAAATGATTAACAGAGATACA
GTGATAGACCTGGATATTTTAATCAATTATACTATAGCTCATATGTAAGCAATGGCAAAA
TTAGATGCGTTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case