Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5253 cluster # 5253       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5253#0 length = 777 sequences # 3  

consensusID : consensus_5253#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 777
fasta sequence
                              [GGACAATTCATATTGTTACCTAATATTTCAATCAAATCATAATGTGCAATAAATTATTAAAATACATTGGTCATACGTATTGTCCATGCATAATTTAATGATTTTCCATTATCATTTATAATTAAATCAGGTAAATTAATAATGACACCATTCATTGTAGTTTTATTCATTATTTGATATGATAATTGAATACCAGTTAAACTACCATCTAATAAAGTAAATTGTGATAAATTTGGTTGGACACTAATTGATGCCAAATTTAATTGTCTTTTACAATAGGATATTGATTTTTGATAGTTCATTGATAGTAATGAGATTTCTGTCAAATCATTATTACAATCTTTATTTGGCCATTTTGTTAAATGTGCATATACTATAGATGGATTCTGTTTAATATATGATATTCTTTGAAGTAAATATATAAATGGCA-TTTTGATATATTCATTTATATCCTCACTATCCTTTACTGGTTTATAAGTATACCAAACAAAATCATAATTTGGTTCTTTTTGAATTCTCCCATGGTTGAGTAGCATAAATACCTTCACCATTTATAGACAACCATTCACCTAATTGTAATAAACGTTCTTCATAAATAGGCGAAATTGTTCCATATGAAAGTTGGG-CAACATTAATGAGAATATTTCCACCANAAGTAACAGTTTCAATGACTTCAGAAATAAGTTGTTNCTGGTGTTAATATTTTATNCTAAAGTTATTTNCTCTTCTAAATCCCCATGAACAACAATNCTAATGTCATACAATTTTCCCATTTGT]

[+] EMBL BF936677             [GGACAATTCATATTGTTACCTAATATTTCAATCAAATCATAATGTGCAATAAATTATTAAAATACATTGGTCATACGTATTGTCCATGCATAATTTAATGATTTTCCATTATCATTTATAATTAAATCAGGTAAATTAATAATGACACCATTCATTGTAGTTTTATTCATTATTTGATATGATAATTGAATACCAGTTAAACTACCATCTAATAAAGTAAATTGTGATAAATTTGGTTGGACACTAATTGATGCCAAATTTAATTGTCTTTTACAATAGGATATTGATTTTTGATAGTTCATTGATAGTAATGAGATTTCTGTCAAATCATTATTACAATCTTTATTTGGCCATTTTGTTAAATGTGCATATACTATAGATGGATTCTGTTTAATATATGATATTCTTTGAAGTAAATATATAAATGGCA TTTTGATATATTCATTTATATCCTCACTATCCTTTACTGGTTTATAAGTATACCAAACAAAATCATAATTTGGTTCTTTTTGAATTCTCCCATGGTTGAGTAGCATAAATACCTTCACCATTTATAGACAACCATTCACCTAATTGTAATAAACGTTCTTCATAAATAGGCGAAATTGTTCCATATGAAAGTTGGG CAACA                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AI974948             [GGACAATTCATATTGTTACCTAATATTTCAATCAAATCATAATGTGCAATAAATTATTAAAATACATTGGTCATACGTATTGTCCATGCATAATTTAATGATTTTCCATTATCATTTATAATTAAATCAGGTAAATTAATAATGACACCATTCATTGTAGTTTTATTCATTATTTGATATGATAATTGAATACCAGTTAAACTACCATCTAATAAAGTAAATTGCGATAAATTTGGTTGGACACTAATTGATGCCAAATTTAATTGTCTTTTACAATAGGATATTGATTTTTGATAGTCCATTGATAGTAATGAGATTTCTGTCAAATCATTATTACAATCTTTATTTGGCCATTTTGTTAAATGTGCATATACTATAGATGGATTCTGTTTAATATATGATATTCTTTGAAGTAAATATATAAATGGCA TTTGGATATATTCATTTATATCCTCACTATCCTTTACTGGTTTATAAGTATACCAAACAAAATCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL SM7521               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGTAAATATATAAATGGCATTTTTGATATATTCATTTATATCCTCACTATCCTTTACTGGTTTATAAGTATACCAAACCAAATCATAATTTGGTTCTTTTTGAATTCCTCCATGGTTGAGTAGCATAAATACCTTCACCATTTATAGACAACCATTCACCTAATTGTAATAAACGTTCTTCATAAATAGGCGAAATTGTTCCATATG AAGTTGGGCCAACATTAATGAGAATATTTCCACCANAAGTAACAGTTTCAATGACTTCAGAAATAAGTTGTTNCTGGTGTTAATATTTTATNCTAAAGTTATTTNCTCTTCTAAATCCCCATGAACAACAATNCTAATGTCATACAATTTTCCCATTTGT]


>consensus_5253#0 GGACAATTCATATTGTTACCTAATATTTCAATCAAATCATAATGTGCAATAAATTATTAA AATACATTGGTCATACGTATTGTCCATGCATAATTTAATGATTTTCCATTATCATTTATA ATTAAATCAGGTAAATTAATAATGACACCATTCATTGTAGTTTTATTCATTATTTGATAT GATAATTGAATACCAGTTAAACTACCATCTAATAAAGTAAATTGTGATAAATTTGGTTGG ACACTAATTGATGCCAAATTTAATTGTCTTTTACAATAGGATATTGATTTTTGATAGTTC ATTGATAGTAATGAGATTTCTGTCAAATCATTATTACAATCTTTATTTGGCCATTTTGTT AAATGTGCATATACTATAGATGGATTCTGTTTAATATATGATATTCTTTGAAGTAAATAT ATAAATGGCATTTTGATATATTCATTTATATCCTCACTATCCTTTACTGGTTTATAAGTA TACCAAACAAAATCATAATTTGGTTCTTTTTGAATTCTCCCATGGTTGAGTAGCATAAAT ACCTTCACCATTTATAGACAACCATTCACCTAATTGTAATAAACGTTCTTCATAAATAGG CGAAATTGTTCCATATGAAAGTTGGGCAACATTAATGAGAATATTTCCACCANAAGTAAC AGTTTCAATGACTTCAGAAATAAGTTGTTNCTGGTGTTAATATTTTATNCTAAAGTTATT TNCTCTTCTAAATCCCCATGAACAACAATNCTAATGTCATACAATTTTCCCATTTGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)