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Schistosoma mansoni
cluster # 5262 cluster # 5262       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5262#0 length = 861 sequences # 3  

consensusID : consensus_5262#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 861
fasta sequence
                              [ATAACAATATATTATTTATCTTATTCAAATGATGACAAATAAATATAACCAACGAGTCAGATATATTTTTAAATTTTAAGCGCTACACCATGGATTAAGAATAAAAGATAAACTGAATATCAACATGAAATAAGTTTGTGAGATTGTTTAGTTCACTATTCATTTGAACTCAATTCATCTTGAATGAAAAGCTTAATGTGTAACAACAAGGAATAGGAAGTTGATGCTTAGAATGATTAATAATATGTGATAACTTTGTGTTGTTAAAATACAAAAGTTTATCAACGTTGTTTTTATGTCCAACAAAGTTCATACAACAATATTACTGTTATTATTATAGTTTAGATATTTCTGTGCTATTAATAACATCATTTTGTCAACAATCAGTTGATCTATTATTATCATTATTACTATTACTATCACTACTTTTATTAAAATTTGTCTCTACGTTATTTTTTAAGTGTACAATTCTTCCATGTTTTCAGTGAATCTCATTTGTTTACTGGAAAATTTCACCACTTAACTTTGACTGATTCCTCTGCAGACGTAGATCCATGTCTACGTTGGAATAATTTGGTCGAATTCGATGATGTGTGATCATCGCTAAATGATGCAGCTTTTATTGGAATGTATGAATTTCGCTTCATATTCATAATAGATAAATGTTGTTTATAGAAATGTTGAGTGGTTAGTAATTTTCGGGATGTTTTTTCAATCACCGACCACGAATAATCAATATCTTCAATACAAGCCTTTTCATGATTTATAGAAAATCGAATAAAATAGATATCTCTGGCCATCGAAGGTACAATATGAATTTCCCGGTTCGTATTAATAAGATGAACTAAACATTGAGTCAAT]

[+] EMBL CD073148             [ATAACAATATATTATTTATCTTATTCAAATGATGACAAATAAATATAACCAACGAGTCAGATATATTTTTAAATTTTAAGCGCTACACCATGGATTAAGAATAAAAGATAAACTGAATATCAACATGAAATAAGTTTGTGAGATTGTTTAGTTCACTATTCATTTGAACTCAATTCATCTTGAATGAAAAGCTTAATGTGTAACAACAAGGAATAGGAAGTTGATGCTTAGAATGATTAATAATATGTGATAACTTTGTGTTGTTAAAATACAAAAGTTTATCAACGTTGTTTTTATGTCCAACAAAGTTCATACAACAATATTACTGTTATTATTATAGTTTAGATATTTCTGTGCTATTAATAACATCATTTTGTCAACAATCAGTTGATCTATTATTATCATTATTACTATTACTATCACTACTTTTATTAAAATTTGTCTCTACGTTATTTTTTAAGTGTACAATTCTTCCATGTTTTCAGTGAATCTCATTTGTTTACTGGAAAATTTCACCACTTAACTTTGACTGATTCCTCTGCAGACGTAGATCCATGTCTACGTTGGAATAATTTGGTCGAATTCGATGATGTGTGATCATCGCTAAATGATGCAGC                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL SMW786               [      ATATATTATTTATCTTATTCAAATGATGACAAATAAATATAACCAACGAGTCAGATATATTTTTAAATTTTAAGCGCTACACCATGGATTAAGAATAAAAGATAAACTGAATATCAACATGAAATAAGTTTGTGAGATTGTTTAGTTCACTATTCATTTGAACTCAATTCATCTTGAATGAAAAGCTTAATGTGTAACAACAAGGAATAGGAAGTTGATGCTTAGAATGATTAATAATATGTGATAACTTTGTGTTGTTAAAATACAAAAGTTTATCAACGTTGTTTTTATGTCCAACAAAGTTCATACAACAATATTACTGTTATTATTATAGTTTAGATATTTCTGTGCTATTAATAACATCATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD078685             [                                                                                                                                                                                                                                                                           AATACAAAAGTTTATCANCGTTGTTTTTATGTCCAACAAAGTTCATACAACAATATTACTGTTATTATTATAGTTTAGATATTTCTGTGCTATTAATAACATCATTTTGTCAACAATCAGTTGATCTATTATTATCATTATTACTATTACTATCACTACTTTTATTAAAATTTGTCTCTACGTTATTTTTTAAGTGTACAATTCTTCCATGTTTTCAGTGAATCTCATTTGTTTACTGGAAAATTTCACCACTTAACTTTGACTGATTCCTCTGCAGACGTAGATCCATGTCTACGTTGGAATAATTTGGTCGAATTCGATGATGTGTGATCATCGCTAAATGATGCAGCTTTTATTGGAATGTATGAATTTCGCTTCATATTCATAATAGATAAATGTTGTTTATAGAAATGTTGAGTGGTTAGTAATTTTCGGGATGTTTTTTCAATCACCGACCACGAATAATCAATATCTTCAATACAAGCCTTTTCATGATTTATAGAAAATCGAATAAAATAGATATCTCTGGCCATCGAAGGTACAATATGAATTTCCCGGTTCGTATTAATAAGATGAACTAAACATTGAGTCAAT]


>consensus_5262#0 ATAACAATATATTATTTATCTTATTCAAATGATGACAAATAAATATAACCAACGAGTCAG ATATATTTTTAAATTTTAAGCGCTACACCATGGATTAAGAATAAAAGATAAACTGAATAT CAACATGAAATAAGTTTGTGAGATTGTTTAGTTCACTATTCATTTGAACTCAATTCATCT TGAATGAAAAGCTTAATGTGTAACAACAAGGAATAGGAAGTTGATGCTTAGAATGATTAA TAATATGTGATAACTTTGTGTTGTTAAAATACAAAAGTTTATCAACGTTGTTTTTATGTC CAACAAAGTTCATACAACAATATTACTGTTATTATTATAGTTTAGATATTTCTGTGCTAT TAATAACATCATTTTGTCAACAATCAGTTGATCTATTATTATCATTATTACTATTACTAT CACTACTTTTATTAAAATTTGTCTCTACGTTATTTTTTAAGTGTACAATTCTTCCATGTT TTCAGTGAATCTCATTTGTTTACTGGAAAATTTCACCACTTAACTTTGACTGATTCCTCT GCAGACGTAGATCCATGTCTACGTTGGAATAATTTGGTCGAATTCGATGATGTGTGATCA TCGCTAAATGATGCAGCTTTTATTGGAATGTATGAATTTCGCTTCATATTCATAATAGAT AAATGTTGTTTATAGAAATGTTGAGTGGTTAGTAATTTTCGGGATGTTTTTTCAATCACC GACCACGAATAATCAATATCTTCAATACAAGCCTTTTCATGATTTATAGAAAATCGAATA AAATAGATATCTCTGGCCATCGAAGGTACAATATGAATTTCCCGGTTCGTATTAATAAGA TGAACTAAACATTGAGTCAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)