cluster # 5271

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5271 cluster # 5271 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5271#0 length = 477 sequences # 3

consensusID : consensus_5271#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 477
fasta sequence

                              [TTATTGATTGATAAAGTTGTATTCTCTGGTNTTAGCCAAGAAGATTTCACTAGACGTGTACTGTATTCACTGGTACTATTACCAACACTGTAACCAACATGACCATCATTATGATTAAGTTTTGTTGATAAACCGGGC--ATATCTCTTAATTCAGCCGGATCACAGAATAACCAATCTTTTAAATTGGACATATTTTGAGATGAATTTGTCAATATATCAAAACTTTCCGAAGTAGATTTATTCGAGTAATTAGAGGGCTTTAAGGTATTATTCAATCCGTATAATTCTCCTTTATGATAAGATGTAGGTTCAACTGTCGGCGGTTGACTATCTCGTAATTCAAGCCAAGTTCGAACTAGTGTAGAATCCGGTCGACAACACGGTTCACGTGAAATATTGAATTCGAAATTATCTTGTACTGATTCTTTTTCCTACCATAAAAATTGATATGTTGTCACCTTTTTAAGTGTTAACCAA]

[+] EMBL CD114178             [TTATTGATTGATAAAGTTGTATTCTCTGGTNTTAGCCAAGAAGATTTCACTAGACGTGTACTGTATTCACTGGTACTATTACCAACACTGTAACCAACATGACCATCATTATGATTAAGTTTTGTTGATAAACCGGGC  ATATCTCTTAATTCAGCCGGATCACAGAATAACCAATCTTTTAAATTGGACATATTTTGAGATGAATTTGTCAATATATCAAAACTTTCCGAAGTAGATTTATTCGAGTAATTAGAGGGCTTTAAGGTATTATTCAATCCGTATAATTCTCCTTTATGATAAGATGTAGGTTCAACTGTCGGCGGTTGACTATCTCGTAATTCAAGCCAAGTTCGAACTAGTGTAGAATCCGGTCGACAACACGGTTCACGTGAAATATTGAATTCGAAATTATCTTGTACTGATTCTTTTTCCTACCATAAAAATTGATATGTTGTCACCTTTTTAAGTGTTAACCAA]
[+] EMBL CD199747             [                                                                        GTACTATTACCAACACTGTAACCAACATGACCATCATTATGATTAAGTTTGGTTGA AAACCCGGCTTATTTCTCTTAATTCAGCCGGATCACAGAATAACCAATCTTTTAAATTGGACATATTTTGAGATGATTTTGTCAATATATCAAAACTTTCCGAAGTAGATTTATTCGAGTAATTAGAGGGCTTTAAGGTATTATTCAATCCGTATAATTCTCCTTTATGATAAGATGTAGGTTCAACTGTCGGCGGTTGACT                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD199650             [                                                                        GTACTATTACCAACACTGTAACCAACATGACCATCATTATGATTAAGTTTTGTTGATAAACCGGGC  ATATCTCTTAATTCAGCCGGATCACAGAATAACCAATCTTTTAAATTGGACATATTTTGAGATGAATTTGTCAATATATCAAAACTTTCCGAAGTAGATTTATTCGAGTAATTAGAGGGCTTTAAGGTATTATTCAATCCGTATAATTCTCCTTTATGATAAGATGTAGGTTCAACTGTCGGCGGTTGACTA                                                                                                                                                   ]




>consensus_5271#0
TTATTGATTGATAAAGTTGTATTCTCTGGTNTTAGCCAAGAAGATTTCACTAGACGTGTA
CTGTATTCACTGGTACTATTACCAACACTGTAACCAACATGACCATCATTATGATTAAGT
TTTGTTGATAAACCGGGCATATCTCTTAATTCAGCCGGATCACAGAATAACCAATCTTTT
AAATTGGACATATTTTGAGATGAATTTGTCAATATATCAAAACTTTCCGAAGTAGATTTA
TTCGAGTAATTAGAGGGCTTTAAGGTATTATTCAATCCGTATAATTCTCCTTTATGATAA
GATGTAGGTTCAACTGTCGGCGGTTGACTATCTCGTAATTCAAGCCAAGTTCGAACTAGT
GTAGAATCCGGTCGACAACACGGTTCACGTGAAATATTGAATTCGAAATTATCTTGTACT
GATTCTTTTTCCTACCATAAAAATTGATATGTTGTCACCTTTTTAAGTGTTAACCAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case